使用Biomart hsapiens_gene_ensembl数据集时出现错误消息。有人知道怎么解决吗？ - 腾讯云开发者社区

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玩转 ENSEMBL 数据库（一）

生物信息学离不开数据库的使用，一般情况下，我们似乎能难使用一个数据库的全部功能，但不可否认的是，一个数据库往往隐藏着我们不知道的使用技巧，也可能我们使用过这些功能，但不够完整。...这里使用两个函数，useEnsembl 函数用来在线连接数据库和基因集，getBM函数用于从数据库中检索数据 library(biomaRt) ensembl = useEnsembl(biomart=...库：*library(biomaRt)*用于加载biomaRt包，确保可以使用其功能来访问生物数据库。...连接到Ensembl数据库：*useEnsembl(biomart="ensembl", dataset="hsapiens_gene_ensembl")函数用于连接到Ensembl数据库，指定了使用人类基因数据集...可以看到有四个数据库，但是我们一般使用 biomart="ensembl", 这个一种快捷方式，等价于 biomart="genes" 参数：dataset 通过dataset="hsapiens_gene_ensembl

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一文教你学会GEO芯片探针注释

以GSE3933为例，该数据集收录由3个平台（GPL2695、GPL3044、GPL3289）检测的共计112个样本的基因表达数据： ?...3、biomaRt http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/biomaRt.html 基于多种数据库进行数据转换： ?...所以，biomaRt的全面和强大并不仅仅局限于探针到基因的对应关系，甚至在生信分析过程中你会经常看到或用到它，当然，你所能用它解决的问题取决于你对其了解的程度！...library(biomaRt) mart = useMart("ensembl", dataset = "hsapiens_gene_ensembl") 查看biomaRt中集成的Affy注释包： ?...知道了数据的平台就可以做探针-基因提取啦，如affy_hg_u95b： probes2genes = getBM(attributes = c("affy_hg_u95b", "hgnc_symbol"

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单细胞专题 | 10.细胞周期分析

在分析单细胞数据时，同一类型的细胞往往来自于不同的细胞周期阶段，这可能对下游聚类分析，细胞类型注释产生混淆；由于细胞周期也是通过cell cycle related protein 调控，即每个阶段有显著的...【生信基础 | 人-小鼠基因之间的比较】【biomaRt包实现不同物种之间同源基因转换】 convertHumanGeneList <- function(x){ require("biomaRt...analysis/base_files/GeneSet/mouse_cell_cycle_genes/mouse_cell_cycle_genes/mouse_cell_cycle_genes.rds") 我们继续使用前面的数据进行分析...（已注释了cell cycle）的基因表达特征产生，我们可以直接使用。...具体参考文章【单细胞数据分析中scran包进行细胞周期分析时细胞周期marker基因的转换】 ###基因转换 library(clusterProfiler) library(org.Hs.eg.db)

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单细胞学习之细胞周期分析

3、scRNA-seq与cell cycle 在分析单细胞数据时，同一类型的细胞往往来自于不同的细胞周期阶段，这可能对下游聚类分析，细胞类型注释产生混淆；由于细胞周期也是通过cell cycle related...在单细胞周期分析时，通常只考虑三个阶段：G1、S、G2M。...选这个数据集是因为It is known to contain actively cycling cells after oncogene induction....（已注释了cell cycle）的基因表达特征产生，我们可以直接使用。...提到的solution就是采用biomaRt包转换一下 convertHumanGeneList <- function(x){ require("biomaRt") human = useMart

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ChatGPT 上线最强应用：分析数据、生成代码都精通

他上传了一个 XLS 文件，并向 AI 提出三个问题： “你能通过可视化和描述性分析，帮助我理解数据内容吗？” “你能试着用回归分析找到其中的模式吗？” “你能运行回归诊断吗？”...尽管 AI 无法访问原始数据，仍能解决问题并提出有用的见解。这凸显出该工具在处理计划外数据相关问题时，表现出的良好适应性和智能水平。...知乎答主“极萨学院冷哲”表示，“它只适合做一些你看起来就知道怎么做，但是超级费工夫的批处理工作。但是对于那种你看起来都不知道怎么做、一脸懵的情况，他也会一脸懵。”...虽然这是最近的事，但这确实意味着该模型可能不知道或无法利用技术的某些进步或变化，如编程语言，或从那时起出现的库。...对于初学者来说，如果没有集成开发环境 (IDE) 通常提供的详细错误消息，对代码进行故障排除可能会有点困难。

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你对 ChatGPT 的所有疑问，看这这一篇文章就够了

总会被别人问到，”你听过 ChatGPT 吗？你知道怎么安装吗？帮我装一个呗！...7、不是号称很智能吗？怎么连前几天发生的事都不知道？ ChatGPT 是一个人工智能大语言模型，它是由工程师用数据训练出来，它的训练数据的截止日期是2021年9月份，以后的事它就不知道了。...8、它是联网的吗参考3，它是由历史数据训练而来，普通版数据是固定的，（随着研发不断进展，也会有一定变化），plus版本可以借助插件功能，实现联网查询 9、登陆时出现“not available in...ChatGPT 不支持该国家或地区使用导致的，可以尝试更换区域解决这个问题 10、与chatgt对话过程中，出现 something went wrong是什么原因？...IP进行风控名单，导致不可用，切换区域基本上就可以解决 12、该怎么使用 ChatGPT 就像与微信聊天一样，正常的文字交流就行了， ChatGPT 可以理解你所说的话，哪怕是有些错误字（背后有强大的NLP

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程序员不仅要学会百度，更要懂得提问

把答案直接ctrl+v，成功解决理想：确定错误范围，列出出现问题的情况列表,定点、有步骤的解决问题 4、询问大佬，怎么问呢？...认真思考问题的解决方案当问题特别明显,只要有动脑就能解决这个问题时,没有人会喜欢回答这种基础问题, 例如: 当你知道echo "hello world"语句,却不知道怎么输出"EasySwoole天下第一..."时当你知道如何移动文件到/tmp目录,却不知道移动到指定日期的目录时当你知道mysql有解释器可以查看是否有使用到索引,却不知道如何看组合索引是否有效时当报错信息出现的情况,却不知道去搜索时搜索问题的解决方案...例如: 当你上传文件这个逻辑出现问题时,你问:"为什么我没法上传文件",是没有人能回答的了你的,你得自行排查,直到一个小范围. 例如: 上传文件,选择文件之后,发生错误....请问mysql连接池是怎么实现的? 性能优化问题性能优化问题,需要先确认慢的地方,然后截图,例如: 我发现这段代码执行特别慢,有什么错误吗?

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FreeMarker与JSP 2.0 + JSTL组合进行比较

但是如果页面出现异常，这是人类测试人员会注意到的，单元测试会注意到（整个页面都会失败），在生产中，维护者会注意到（假设有人检查错误日志）。...但是如果页面出现异常，这是人类测试人员会注意到的，单元测试会注意到（整个页面都会失败），在生产中，维护者会注意到（假设有人检查错误日志）。...但是如果页面出现异常，这是人类测试人员会注意到的，单元测试会注意到（整个页面都会失败），在生产中，维护者会注意到（假设有人检查错误日志）。...只是因为不知道患者是否患有青霉素过敏，我们只能说他/她没有吗？只要考虑这些错误的含义。显示错误页面通常比显示不正确的信息更好，导致用户端的错误决定。...知道当您从另一个模板中包含/导入模板时，如果您没有启动模板名称/，它将相对于包含模板的目录进行解释。错误消息包含完整（已解析）的名称，因此您应该注意到这一点。

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聊一聊RocketMQ的注册中心NameServer

试想一下，如果NameServer分布式存储Broker注册的信息，那生产者从NameServer获取信息时不是又面临着和Broker相同的问题了吗，不知道应该访问哪个NameServer，所以这样的方式是错误的...这样从NameServer获取数据时无论从哪台机器上都能获取到所有的数据，而且就算其中一个NameServer宕机了，其他NameServer也能继续提供服务。...，当系统获取信息时可能会出现将消息发送到宕机的Broker的情况，导致系统出错，所以NameServer中信息的准确性是很重要的，那么当Broker宕机时，NameServer是真么感知到的呢？...难道只要有Broker宕机了，NameServer就要主动发送消息给各个系统吗？这是不靠谱的，就算是NameServer主动发送消息给所有系统，也无法解决问题。...常见的消息中间件有哪些？你们是怎么进行技术选型的？你懂RocketMQ 的架构原理吗？

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你到底该信谁？

但是经常出现的结果是——所有人的答案都是错误的。试想你摸到了一个红球，但是你前面20多人都宣布箱子里面有2个白球。你有没有可能认为箱子里面有2个红球呢？不会吧。...事后证明，权威Don Poldermans的研究对数据进行了操纵。大样本实验的结论是β受体阻滞剂的使用可以使手术期死亡率提高27%。...从前你只知道哪些人转发了消息，现在你却可以看见冰山下面的情景——那些读了消息，但根本就没有转发的人。他们“不转发”的动作，同样代表了自己的判断和意见。...如果只有我看到别人转发，我才肯转发，那么一条新出现的信息可能永远不会被传播出去。人家社交媒体平台也有用户活跃度的KPI考核好不好？对这个问题，解决起来也不难。...本来嘛，即便是错误信息，一共也没有传到几十个人，那就没有必要弄得那么兴师动众了啊。想要干大事儿，不学会妥协怎么行？ :-) 讨论你之前在甄别社交媒体信息的时候，采用过什么方法？管用吗？

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GPT-4得不到MIT学位，MIT研究团队回应「作弊」，但网友不买账

arxiv.org/pdf/2306.08997.pdf 最初，研究团队从 MIT 的数学、电气工程和计算机科学 (EECS) 专业的课程问题、期中考试和期末考试中，整理出了一个包含 4550 个问题和解决方案的综合数据集...其中一些涉及课程的导师，在论文出现在社交媒体上和 Drori 未经许可在网上发布数据样本时，才知道这个数据集的存在且其中包含了自己的课程材料。...显然，并不是所有人都对调查结果满意，有人表示这是避重就轻的说法，只是关注他们不应该使用这些数据的事实，而不提捏造结果的错误。...「所以这三位麻省理工学院的教授认为，未经同意使用数据是论文的唯一问题。」...一个特别令人担忧的趋势是使用像 GPT-4 这样基于语言的模型来评估一个模型的准确性的技术。」对于此事，你怎么看？

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代码写得好，绩效却不高？程序员的沟通和思考有多重要？

收到消息及时回复是职场人的共识，如果你收到消息不回复，容易给对方造成误解，一旦你养成习惯，也容易在与人沟通上出现理解偏差。企业微信有已读功能，当你已读却不回复消息时，容易给人造成无视、忽略的误解。...上升反馈可能会给对接同事造成很大的压力，这可能会影响到与该同事的下一次顺畅沟通，所以上升反馈非必要不使用；一些常识：当你找对方要时间节点时，可能会遇到：“还不知道，需要评估”、“事情太多，不好说...重点不突出：本次分享重点在于给大家介绍怎么高效的使用，“反馈、改进”之类的话跟本次分享无关，没必要提。...大量的沟通消息，我们既担心处理不及时，又不想写代码被频繁打断，还担心忘记答复，怎么办呢？首先不要逃避消息轰炸，这是无法回避的，应该正视并接受这种状态，然后设计流程解决问题。...使用 MySQL 来传递批量数据，在新老数据版本上也需要做较多工作，要么是数据按版本分表；要么是在一个表里增加一个版本号信息，然后需要处理同时读写出现的资源竞争。

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哎，被这个叫做at least once的玩意坑麻了。

甚至还发现了一个低级错误：对应的表，针对订单号，这个业务上具有唯一属性的字段，连唯一索引都没有加。如果加了唯一索引，也不至于出现落库两次的情况。...然后拿着数据去问上游系统，为什么会出现同一个订单发起了两次的这种异常场景。上游系统一听到我们的描述，立马就站出来解释：不可能，在没有人工介入的情况下，同一个单子，我们绝对不可能发送两次。...再或者：一个由数据库约束驱动的消息幂等保护性框架。好，现在我们有了这么一个“高大上”的通用解决方案了。到底怎么用呢？名字很厉害，但是用起来其实也就那么回事儿。...现在，我们通过引入事务来解决了“非原子性”的问题，但是又带来另外一个问题：事务。一般来说，大家都是能不使用事务的地方就尽量不使用事务，通过最终一致性来保证数据的完整性。...当时我是真的不知道 Spring 的事务怎么用，但是我知道结合当时我开发的业务场景，一个数据的状态很重要，处理之前把数据的状态修改了，但是如果出了异常，应该把状态给它恢复回去。

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为什么你在群里提的技术问题没人回答？

几乎隔一段时间，我就会发现有些人身上出现下面的这两个问题。第一个就是不知道怎么提问，第二个就是有工作对接的时候，有用的信息不实时收集，多次对同样的问题进行提问。今天来说一说如何提问的话题。...3、昨天还好好的，今天突然数据库就连不上了，有没有人知道怎么回事？先别笑，这可不是开玩笑，相信你肯定也碰到过类似的提问，碰到这种提问除了让人啼笑皆非外，就只能是忽略了，当做什么都没看见。...记得，有一次，微信一下子弹出了好几条消息，正好挡住了我正要操作的内容，本来就心生不爽，点进去发现是一个同学正在群里问问题，5、6条消息发出来，仍然看的人一头雾水，不知所云。...这样一来，回答者会因为帮人解决了问题而有一些优越感，其他人也会了解这个过程，以后如果遇到相同的问题，也就知道怎么解决了。而提问者，做一个总结，也会给人一个良好的印象。...禁忌 1、如果有问题，直接按照上面说的方法把你的问题发出来就好，不要上来说一些无关痛痒的话，比如：有人能帮我解决一个问题吗？ ==> 对不起，没有有大佬在吗？

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OpenAI 演讲：如何通过 API 将大模型集成到自己的应用程序中

对于任何使用过 ChatGPT 的人来说，我们都知道它的训练数据是 2021 年 9 月之前的，所以它不知道当前的事件。...它再次使用完全有效的 JSON 调用该函数。它说，“很高兴看到你检索角色值。”；“你的错误信息简洁明了。”；“我很感激你对数据库的更改，做得很好。”。我希望有人能这样审查我的代码。...你总是可以得到好的错误信息之类的。这些就是我即兴的建议。 LLM 和 langChain 参会者 2：有人尝试过做一些 LangChain 吗，它可以与 LangChain 一起使用吗？...我们只是没有在自己的数据上训练它。这种围绕企业级数据隔离的特性显然很快就会出现。这一特定的安全层还没有出现。 Eleti：我们不使用 API 数据进行训练。...使用 GPT 进行可靠的函数调用参会者 5：关于将 GPT 集成到不同的软件中。我在使用枚举时遇到了一些问题，当我要求它用英语、法语或德语做一些工作时，我使用的枚举有时会出现德语或法语。

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运行个Hello Word也能出Bug？Python、Java、C++等16种语言中枪，最严重可导致文件丢失

0 Bug的最初发现者表示：这可不是一个小错误，本质上是“打印到标准输出”的任务。发生了错误但不抛出异常，意味着即使出现数据丢失，进程依然会继续运行。...主要使用的是Linux系统下的一个经典的设备文件，/dev/full。 /dev/full总是在写入时返回设备无剩余空间（错误码为ENOSPC），常常用于测试程序能否正确处理I/O错误。...博主sunfishcode这样说：标准输出可能意味着一个具体文件，那么如果这个文件刚好耗尽了空间，程序又因为Bug没有检测到这一错误呢？父进程不会知道子进程失败了，只会继续运行。...甚至有人表示：程序的失败不是由程序控制结构定义，而是由需求定义，Hello World程序的需求难道包括主机系统的所有错误边界吗？...那么你又怎么看？

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运行个Hello Word也能出Bug？Python、Java、C++等16种语言中枪，最严重可导致文件丢失

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会干不会说？程序员必须掌握的高效沟通技巧

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为什么说大模型训练很难？

大家都说大模型难，大模型训练除了集群调度麻烦，还难在哪里吗？...模型训练一个月才知道结果好坏，知道时候几千万已经花了。怎么能早点知道大致的结果来停掉没前途的实验？用户说模型会胡说八道，你不修好这个问题你的模型就会被下架，怎么修？调参？改训练数据？改模型结构？...有人说大模型嘛，简单，给我卡就行，等到老板真给你买来了1000张卡你就知道有多难了，老板说，小王，卡买来了，三个月给我搞出来。...按照训练效率预估，在不发生错误和重启的情况下，在300B token数据集上训练需要花费33天。...所以，即使是有丰富经验、充足的数据集和庞大硬件资源，训练大模型依然是困难重重的。

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如何面试Python后端工程师？

33398583/answer/59017861 吃午饭的时候我就一直在想这个问题，我觉得重点不是Python而是后端工程师，因为Python只是系统的一部分，linux基础操作要熟吧，sql要懂吧，消息队列要知道吧...logging是线程安全的吗？ 4.python适合的场景有哪些？当遇到计算密集型任务怎么办？ 5.python高并发解决方案？...tcp粘包是怎么回事，如何处理？udp有粘包吗？ 2.time_wait是什么情况？出现过多的close_wait可能是什么原因？ 3.epoll,select的区别？...原子操作还有其它解决方案吗？ 3.redis内存满了会怎么样？四.安全 web安全相关 1.sql注入是怎么产生的，如何防止？ 2.xss如何预防？...数据库等存储技术是研发工程师迈不过的坎，对关系数据库以mysql举例来说，你必须清楚的知道什么字段选择什么类型，类型字节大小，限制条件，这东西也很容易理解，多想想即可，比如set类型，要支持交并等操作，

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玩转 ENSEMBL 数据库（一）

一文教你学会GEO芯片探针注释

单细胞专题 | 10.细胞周期分析

单细胞学习之细胞周期分析

ChatGPT 上线最强应用：分析数据、生成代码都精通

你对 ChatGPT 的所有疑问，看这这一篇文章就够了

程序员不仅要学会百度，更要懂得提问

FreeMarker与JSP 2.0 + JSTL组合进行比较

聊一聊RocketMQ的注册中心NameServer

你到底该信谁？

GPT-4得不到MIT学位，MIT研究团队回应「作弊」，但网友不买账

代码写得好，绩效却不高？程序员的沟通和思考有多重要？

哎，被这个叫做at least once的玩意坑麻了。

为什么你在群里提的技术问题没人回答？

OpenAI 演讲：如何通过 API 将大模型集成到自己的应用程序中

运行个Hello Word也能出Bug？Python、Java、C++等16种语言中枪，最严重可导致文件丢失

运行个Hello Word也能出Bug？Python、Java、C++等16种语言中枪，最严重可导致文件丢失

会干不会说？程序员必须掌握的高效沟通技巧

为什么说大模型训练很难？

如何面试Python后端工程师？

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