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脚本分享—从fasta格式文件中批量提取特定位置的序列

脚本简介： 这个脚本主要用于从FASTA格式文件中批量提取指定位置的序列，可以应用在很多不同场景，比如： 提取基因内部特定区域的序列，例如用于分析蛋白质或核酸的二级结构区域； 设计引物时，截取目标区域的序列作为模板...； 需要对特定区域进行比对或变异分析时，快速提取目标序列； 亚细胞定位预测后，提取对应区域的序列进行进一步研究； 根据BLAST比对结果，批量提取匹配到的特定序列； 批量提取UTR区域、基因间隔区等非编码序列...； 批量提取基因启动子区域序列，便于启动子分析； 从基因组中提取基因簇等大段连续序列； 提取各类移动元件序列或特定基因，比如基因组岛、前噬菌体、整合子、插入序列、操纵子区域，以及像16S rDNA这样的功能基因...总之，通过这个脚本，用户可以根据自己的研究需要，从FASTA文件中灵活、精准地提取指定区间的序列，广泛应用于各种生物信息学分析工作中。...install biopython 查看脚本帮助文档： python Extract_fasta_by_site.py -h 脚本使用方方法： 1）脚本准备文件如下图所示 2）fasta文件详解 3）提取位置文件详解

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无码实现​从非数字到数字拆分到行，是怎么做到的？| Power Query技巧

在Power Query里，拆分列的功能非常强大，除了按分隔符、字符数等基本拆分功能外，还支持如从大写到小写或相反，从数据到非数字或相反等等特殊方式，相信很多朋友也都使用过： 其中，按分隔符拆分，有一个比在...Step-02 按分隔符拆分列 虽然我们最后要按“从数字到非数字”进行拆分，但是，我们要借助按分隔符可以拆分到行的方法： 在按分隔符拆分中选择拆分为“行”： 此时，我们通过观察可以发现，生成的步骤中...但是，要自己去写这些Splitter函数，还是比较麻烦的，而且，我们也没有必要自己动手去写，生成一个步骤去复制就可以了—— Step-03 按照从非数字到数字的转换拆分列 此时，我们看步骤的公式，明显...Splitter参数，马上就得到从非数字到数字的拆分到行的效果： Step-05 删掉按从非数字到数字拆分列的步骤 生成这个步骤的目的是为了方便复制其中的Splitter参数，复制好了就可以删掉了：...Step-06 按从数字到非数字拆分列，得到最终结果 我经常讲，Power Query的使用，大多数情况下，并不需要自己大量去写代码，很多步骤的M代码，都是可以通过操作生成，然后再按需求稍作修改即可

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    数字孪生+应用场景：从虚拟映射到实体赋能，重构千行百业的智能基因

    从最初的工业制造领域萌芽，到如今渗透至城市治理、医疗健康、能源交通、农业生态等千行百业，数字孪生正从“虚拟映射”走向“实体赋能”，成为重构产业智能基因的核心引擎。...一、从概念到现实：数字孪生的技术演进数字孪生的概念最早可追溯至2002年，由美国密歇根大学的Michael Grieves教授提出，最初应用于产品全生命周期管理（PLM）。...这些技术的协同突破，使得数字孪生从静态的“镜像”发展为动态的“生命体”，具备了实时交互、智能分析和闭环优化的完整能力。...从设计阶段的虚拟风洞测试，到制造过程的装配仿真，再到服役期间的健康监测与预测性维护，数字孪生显著缩短了研发周期，降低了试错成本，提升了飞行安全。...结语数字孪生，从虚拟映射出发，正以不可阻挡之势赋能实体经济，重构千行百业的智能基因。它不仅是技术的革新，更是思维的变革——它让我们学会用数据的眼光审视世界，用模拟的方式预见未来，用协同的力量解决问题。

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    R语言基础教程——第8章：文件的输入与输出

    ：/”通过SEP来指定； 3) 可以通过list指定读入变量的变量名，同时生成的对象为列表，则可以同时读入字符与数字； 4) skip 从第几行开始读入数据； 5) nlines 指定最大读入行数...也可以指定特定文件路径下的文本文件，比如：file= "F:/BioInfoLab/BioInfoCloud/gene.txt" SCAN几点注意： 1) 用于读入纯字符或者数字，没有表头； 2)...24 34 读写文件 1 从文件中读取数据库获矩阵 read.table()函数是R最基本函数之一，主要用来读取矩形表格数据。...用于指定文件中的数字转换为双精度数据时丢失精度的情况下如何进行转换。 （7）row.names 保存行名的向量。可以使用此参数以向量的形式给出每行的实际行名。...当其取值为FALSE时，该函数将把字符型数据转换为因子型数据，取值为TRUE时，仍将其保留为字符型数据。

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    【金猿案例展】某大型国有银行——智慧金融产业大脑建设

    然而一方面，行方缺少产业链分类及企业映射，无法快速获取特定细分产业的企业名单；另一方面，行方缺少产业相关数据、分析方法与技术手段，在分析产业机会与风险方面存在一定困难。...叠加企业特征（如资质荣誉、知识产权、上市发债投融资情况等）、行业产业标签、工商、司法、经营、舆情等数据，推荐有各类资金需求的科技类企业，或在特定场景下定向挖掘优质高新技术企业。...向业务人员推荐有融资需求、扩张需求的企业，推荐相关产业链龙头/独角兽企业，挖掘存量客户关系链推荐潜在优质企业。支持多维度企业筛选，构建特定场景下的主题企业推荐。...目前智慧金融产业大脑的应用，让行内从传统低效营销全面迈向精准营销，已经帮助行方对5000+标准产业链、400+国家战略新兴产业链、2000+特色产业链，10万+上下游产业供需链进行精准营销获客扫描，通过产业链获客...、园区获客、关系链拓客等各种维度，找到有资金需求、可高转化、风险可控的潜在企业信贷客户，构建行业客户数字化洞察体系，完善行内数字化营销获客体系的建设，降低了72.6%无效营销费用，营销效率提高17.3倍

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    css应知应会 第三集

    1、渐变 1、什么是渐变 多种颜色平缓变化过渡的效果 2、渐变的核心 色标 ：表示颜色值 以及 颜色出现的位置 在一个渐变过程中允许出现多个色标...作用：一行数据所占的高度,如果行高高于文字高度的话，那么文字将在指定行高范围内垂直居中显示 属性：line-height 取值...或 表格之间的距离 属性：border-spacing 取值： 1、取1个数字...每个单元格之间的水平 和 垂直的间距是相同的 2、取2个数字 第一个数字表示水平间距 第二个数字表示垂直间距...3、每个块级元素在页面中独占一行，每个块级元素都是按照从上到下的方式排列的 4、多个行内元素会在一行中显示，显示不下再换行 问题：如何在页面中解决多个块级元素在一行内的显示问题

    1.8K20

    CSS知识总结（上）

    只要是被放到指定标签中的特定标签都会被选中 | 子元素选择器只会选中指定标签中, 所有的特定的直接标签, 也就是只会选中特定的儿子标签 交集选择器 选择器1选择器2{ 属性: 值; } #...: normal; 规定文字粗细的属性 格式： font-weight: bold; 单词取值: bold 加粗 bolder 比加粗还要粗 lighter 细线， 默认就是细线 数字取值： 100-...rgb其实就是三原色, 其中r(red 红色) g(green 绿色) b(blue 蓝色) 格式: rgb(0,0,0) 这其中的每一个数字它的取值是0-255之前, 0代表不发光, 255代表发光...div会单独的占领一行,而span不会单独占领一行 div是一个容器级的标签, 而span是一个文本级的标签 容器级的标签和文本级的标签的区别?...插入图片会占用位置 背景图片有定位属性, 所以可以很方便的控制图片的位置 插入图片没有定位属性, 所有控制图片的位置不太方便

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    Matlab系列之数组的基本操作

    都知道在数组中包含多个元素，因此对数组的单个元素或多个元素进行访问操作（就是我们想要拿某个特定位置或者特定的值来使用），需要对数组进行寻址操作，MATLAB中，数组寻址就是通过对数组的下表访问实现，不知道你们对之前记录的篇章中出现的...对于一个m行n列的数组，分别使用i和j代表元素行列的索引，则一个二维数组的寻址可表示为A(i,j)；代表A矩阵第中i行j列的这个特定元素，如果括号里只有一个数，这种就叫做单下标寻址，如A(k)；代表的就是按列进行逐一计数...在实际应用中，通常使用多逻辑关系组合产生逻辑数字，判断数组元素是否满足某种比较关系，然后通过find函数返回符合比较关系的元素索引，从而实现对数组元素的查找。...direction代表排序的方向，即升序和降序，其取值为：ascend和descend，默认是升序的； I用于存储排序后的下标数组； Value的作用就是将缺失值放到指定位置，缺失值就是NaN，NaT之类的...； 可以是三种取值：'auto'（默认），'first'，'last' ·'auto'-缺失的元素放在最后（对于升序排序）或放在最前面（对于降序排序）。

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    探索CSS：从入门到精通Web开发（二）

    本书将通过一系列深入浅出的方式，带你从入门到精通CSS，探索Web开发的奥秘。...weight size 字体 简写方式 文本样式： 缩进：属性名：text-indent 取值：数字+px 或者 数字+em（1em等于当前标签的font的字号值） 文字对齐： text-align...取值： 属性值 underline 下划线（常用） line-through 删除线 overline上划线 none无常用线 行高 =上间距+下间距+文本高度· 控制一行的上下行间距...repeat-x 沿着水平方向x轴平铺 repeat-y亚y轴 背景位置 background-position（bgp） 取值：方位名词（水平方向） 方位名词（垂直方向） 或者写数字 50px...220px等等 （这个表示向右移50，向下走220） 连写： 单个属性的合写，取值之间空格隔开 元素显示模式： 块级元素：显示特点 独占一行，一行显示同一个，宽度默认是父元素的宽度，高度默认是由内容撑开

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    欧伟杰博士：突破算力边界！YashanDB实现理论与工程双重突围

    作为创始成员之一加入YashanDB团队，负责YashanDB的架构设计与内核研发，从零到一打造全自研数据库产品在多行业落地应用。随着数字化进程的加速，数据处理的规模和速度需求持续攀升。...首先需定义一个概念为“访问约束”，其意义为对于特定的X取值，其对应的Y的取值有且仅有N种可能，这里的N可理解为通过已知的X找到对应Y的边界。...将特定X取值对应的Y连续存储，可以基于轻量化算法实现去重和压缩，并在计算时还原原始取值确保语义完整。用户执行查询时优化器根据已有访问约束判断能否实现查询加速，无需人工干预或修改SQL语句。...与此同时，同一字段存在重复取值，基于轻量化压缩算法可实现存储空间的成倍缩减。列表相较行表对于写入不太友好，因为一条记录写入可能要访问多个数据块，造成大量Cache Miss和额外IO。...同时随着数字化转型的持续深入,很多客户都提出了数据驱动的实时业务决策，这要求数据库能够满足混合负载，兼顾高通量数据变更和实时查询，因此我们设计了一套统一行列存、混合负载的架构。

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    探索CSS：从入门到精通Web开发（二）

    本书将通过一系列深入浅出的方式，带你从入门到精通CSS，探索Web开发的奥秘。...weight size 字体 简写方式 文本样式： 缩进：属性名：text-indent 取值：数字+px 或者 数字+em（1em等于当前标签的font的字号值） 文字对齐： text-align...取值： 属性值 underline 下划线（常用） line-through 删除线 overline上划线 none无常用线 行高 =上间距+下间距+文本高度· 控制一行的上下行间距...repeat-x 沿着水平方向x轴平铺 repeat-y亚y轴 背景位置 background-position（bgp） 取值：方位名词（水平方向） 方位名词（垂直方向） 或者写数字 50px...220px等等 （这个表示向右移50，向下走220） 连写： 单个属性的合写，取值之间空格隔开 元素显示模式： 块级元素：显示特点 独占一行，一行显示同一个，宽度默认是父元素的宽度，高度默认是由内容撑开

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    探索CSS：从入门到精通Web开发（二）

    本书将通过一系列深入浅出的方式，带你从入门到精通CSS，探索Web开发的奥秘。...weight size 字体 简写方式 文本样式： 缩进：属性名：text-indent 取值：数字+px 或者 数字+em（1em等于当前标签的font的字号值） 文字对齐： text-align...取值： 属性值 underline 下划线（常用） line-through 删除线 overline上划线 none无常用线 行高 =上间距+下间距+文本高度· 控制一行的上下行间距...repeat-x 沿着水平方向x轴平铺 repeat-y亚y轴 背景位置 background-position（bgp） 取值：方位名词（水平方向） 方位名词（垂直方向） 或者写数字 50px...220px等等 （这个表示向右移50，向下走220） 连写： 单个属性的合写，取值之间空格隔开 元素显示模式： 块级元素：显示特点 独占一行，一行显示同一个，宽度默认是父元素的宽度，高度默认是由内容撑开

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    【前缀和】算法思想，附两道道手撕题

    前缀和算法思想概述 前缀和算法的核心思想是预先计算并存储数组中每个位置之前所有元素的累积和，这样在需要计算任意子区间和时，可以直接通过查找前缀和数组中的特定元素来快速得出结果。 算法实现步骤 1....然而，如果数组是动态变化的，即元素的值或位置会发生变化，那么可能需要定期重新计算前缀和数组，这会增加额外的计算开销。 在这种情况下，需要根据具体问题的特点来权衡使用前缀和算法的利弊。...输入描述 第一行输入数组中元素个数n，1 < n ≤ 100000 第二行输入数字序列，以空格进行分隔，数字取值为4字节整数 输出描述 输出差值的最大取值 题解 具体的步骤如下： 初始化变量：...输入描述 输入有两行内容，第一行为{minAverageLost}，第二行为{数组}，数组元素通过空格(” “)分隔， minAverageLost及数组中元素取值范围为0~100的整数，数组元素的个数不会超过...该数组的每个元素代表从数组起点到当前位置的失败率累加值。 遍历子区间：接着，我们遍历所有可能的子区间，即所有可能的起始和结束索引组合。

    35210

    腾讯专有云多项目获评“2023年度可信云最佳实践”

    腾讯云原生技术平台TCS，则以云原生技术为核心，集成了众多成熟 PaaS 产品和 IaaS 产品的能力，能够为企业提供从代码到应用部署、运维的应用全生命周期管理服务，让企业构建应用变得更加简单，促进企业实现...IT系统的数字化转型。...// 值得一提的是，腾讯专有云TCE 及 TCS 全类云产品均支持一云多芯，兼容多芯片平台，支持资源池粒度的异构部署，建设成本和起步规模灵活可控，满足企业渐进式平滑迁移的需求；与此同时，专有云从部件选型...此次获评“2023年度可信云金融行业服务最佳实践”的腾讯云分布式数据库 TDSQL，全面兼容 MySQL 和 PostgreSQL，在特定场景下 Oracle 兼容性能达到98%以上，可以为金融机构提供审计...在金融行业，腾讯云已经与中国人民银行以及六大国有行建立合作，头部商业银行中有90%客户采用腾讯云的数字化方案，其中7成应用在核心或关键业务领域。

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    CSS 实用手册

    背景 (1). background-color 背景颜色 语法:background-color：颜色值 或 transparent 注意:背景颜色从边框位置处开始绘制 (2). background-image...，背景图右偏移，取值为负，背景图左偏移 y : 垂直偏移距离，取值为正，背景图下偏移，取值为负，背景图上偏移 ②. x% y% 指定背景图相对模型大小的百分比位置 ③....语法:opacity:value 取值:从 0、0(完全透明) ~ 1、0(完全不透明) 之间的数字 53. vertical-align 垂直对齐 语法:vertical-align:value (...位移 改变元素在页面中的位置 语法：transform：value A. translate(x) 改变元素在 x 轴的位置 x 取值为正向右移动 x 取值为负向左移动 B. translate(x，y...取值为数字的属性 ④. 转换属性 ⑤. visibility 属性 ⑥.

    3.4K10

    【Shell】算术运算符、流程控制、函数使用、数组以及加载其它文件的变量

    ，不支持字符串，除非字符串的值是数字。...while 循环用于不断执行一系列命令，也用于从输入文件中读取数据；命令通常为测试条件。...取值后面必须为单词 in ，每一模式必须以右括号结束。取值可以为变量或常 数。匹配发现取值符合某一模式后，其间所有命令开始执行直至 ;; 。 取值将检测匹配的每一个模式。...在函数体内部，通过 的 形 式 来 获 取 参 数 的 值 ， 例 如 ， 1 表示 第一个参数， $2 表示第二个参数 ......带参数的函数示例： 输出结果： 注意， 不 能 获 取 第 十 个 参 数 ， 获 取 第 十 个 参 数 需 要 {10} 。

    3.6K30

    Word域的应用和详解

    插入用常规方法无法实现的字符，如： 　　　3. 自动生存索引和目录。 　　　4. 表格和数学公式的计算。 　　　5. 插入超级链接，可以从文档的此处跳转至其他位置，或打开其他文件。 　　　...域是在使用“插入”菜单中的“日期和时间”等特定命令或按下 Ctrl+F9 组合键并且在域的花括号之间键入相应信息后插入的。 　　也可通过宏的语句在文档中插入域。...■第三章 表格一、表格的引用 　　表格中的单元格可用诸如 A1、A2、B1、B2 之类的形式进行引用。其中的字母代表列而数字代表行。如表格 1 所示。 　　　...x 可以是数字或算式的结果。 ▲ SIGN(x) 如果 x 是正数，那么取值 1；如果 x 是负数，那么取值 -1。 ▲ SUM( ) 一组数或算式的总和。...该名字必须以字母开头，可含有字母、数字和下划线，但不能超过 40 个字符。例如，一系列表格的名字可以是“tables”。 BookMark：书签名，加入书签来引用文档中其他位置的项目。

    7.7K20

    Python数据类型详解-字符串#学习猿地

    + 作为续行符时，在行尾使用了\后，可以换行继续书写内容 + \n 代表一个换行符 + \r 代表光标位置（从\r出现的位置开始作为光标的起点） + \t 代表一个水平制表符（table 缩进） + \...b 代表一个退格符 + `\\` 反转义\，输出了\，取消\的转义效果 **把转义字符作为普通字符输出,在字符串的前面加 r' '** 示例： ```python # \ 续行符 #续行符 # vars...= '123' \ # '456' # print(vars) # \ 转义符，在字符出现的特定字符有着特定的意义 # \n 代表一个换行符 # vars = '岁月是把杀猪刀，\n\n但是它拿长得丑的人一点办法都没有...# \r 代表光标的位置（从\r出现的位置开始作为光标的起点） # vars = '岁月是把杀猪刀，\r但是它拿长得丑的人一点办法都没有。。。'...() # 检测字符串是否由数字和字母组成，如果字符串中包含来非数字字母的其它字符，则返回False res = vars.isalnum() # 检测字符串是否全部由字符(包含英文字符和中文)组成 res

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    Python数据类型详解-字符串#学习猿地

    + 作为续行符时，在行尾使用了\后，可以换行继续书写内容 + \n 代表一个换行符 + \r 代表光标位置（从\r出现的位置开始作为光标的起点） + \t 代表一个水平制表符（table 缩进） + \...b 代表一个退格符 + `\\` 反转义\，输出了\，取消\的转义效果 **把转义字符作为普通字符输出,在字符串的前面加 r' '** 示例： ```python # \ 续行符 #续行符 # vars...= '123' \ #    '456' # print(vars) # \ 转义符，在字符出现的特定字符有着特定的意义 # \n 代表一个换行符 # vars = '岁月是把杀猪刀，\n\n但是它拿长得丑的人一点办法都没有...# \r 代表光标的位置（从\r出现的位置开始作为光标的起点） # vars = '岁月是把杀猪刀，\r但是它拿长得丑的人一点办法都没有。。。'...() # 检测字符串是否由数字和字母组成，如果字符串中包含来非数字字母的其它字符，则返回False res = vars.isalnum() # 检测字符串是否全部由字符(包含英文字符和中文)组成 res

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