为什么在同一网格点上使用CDO和ArcGIS从netCDF文件中提取数据时会得到不同的值？ - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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关于CDO守恒插值

cdo无法处理坐标系（指griddes中xval和yval）中含有missing value的格点。NCL同样不行（见这个ppt）。这种情况往往出现在曲线网格curvilinear中。...对于曲线网格的守恒插值，往往需要提供xbound和ybound。...对于一些网格，特别是卫星数据，出现cdo remapcon (Abort): Source grid cell corner coordinates missing! 的原因往往出在这里。...= y yunits = "meters" xfirst = xinc = yfirst = yinc = 其中，最后四个常数非常重要，需要针对不同的资料寻找对应的格点值...对于写好的网格描述文件，可以使用setgrid将描述文件赋给netCDF，之后就可以使用remapcon插值了。

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最强大的netCDF处理工具

•插值：和指定权重的方式不同，插值方法是根据给定的输入文件的变量信息，采用线性插值的方式得到输出结果。上述操作对坐标变量和字符变量无效。...ncks可以完成ncdump和nccopy的大部分功能，同时还可以实现文件的提取、分割等操作，还可以根据给定的网格文件对数据进行插值。...ncrcat无法解包数据，只能简单的从输入文件拷贝数据和元数据到输出文件。...ncremap—netCDF Reapper ncremap是在NCO V4.5.4引入的新工具，可以将输入文件中的数据重新插值到map_fl、grd_dst或dst_fl选项给定的网格，并输出。...其主要应用是进行不同网格投影的数据插值变换，比如将WRF模式Lambert投影结果插值到lat-lon投影，或者是对不同模式的网格化结果进行插值变换。

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如何将不同分辨率的ERA5数据插值为统一网格：CDO与xesmf方法

如何将不同分辨率的ERA5数据插值为统一网格：CDO与xesmf方法前言当处理气象数据时，经常会遇到不同分辨率的数据集需要一起使用的情况。...创建样例数据因为手头没有现成的数据，直接制造文件是比较快捷的首先，我们使用xarray创建两个不同分辨率的样例数据集并保存为NetCDF文件。...使用CDO进行插值 CDO (Climate Data Operators) 是我们的老朋友了，专门用于处理气候和NWP模型数据。...方法：优点：命令行操作简单高效，适合批量处理，速度快缺点：需要学习CDO语法，调试不如Python方便 xesmf方法：优点：完全在Python环境中完成，易于集成到工作流中缺点：首次使用需要编译权重文件...ERA5数据统一到相同网格上，便于后续的分析和计算。

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CDO条件性选择数据

还是以NetCDF数据集为演示，在演示之前，为了方便操作，从原始数据集中仅提取出单个时步单个变量的某一层数据。...-10-04_06\:00\:00 wrfoutsub_06.nc 使用 cdo info 查看数据集信息可以得到： cdo info wrfoutsub_03.nc -1 :...CDO同时提供了多字段条件选择操作符 ifthenelse。同样以 infile1为参考，然后从 infile2 和 infile3 文件中选择数据。看下图 ?...使用方法和 ifthen/ifnotthen 相同，只需要把 infile1 换为常数即可。 ? 自定义掩膜在条件选择操作符中，最重要的应该就是自定义掩膜操作符了。...：GRIB格式不能存储非结构网格数据，因此只能输出为 NetCDF数据集。

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气象编程 | cdo配合shape文件提取CMIP6指定区域数据

---- 1、前言前面已经给大家介绍过如何用cdo配合shape文件提取CMIP6指定区域数据，这个思路首先需要用gdal将shape文件转为netCDF格式的文件，然后再用cdo ifthen进行裁剪...注意：其实第三行的代码是可以去掉的，但是本人的shp文件可能存在一点问题，当没有提取sfcWind数据而直接保存时，第四行代码在执行时出现问题，故采取了折中的处理方式，大家在实际操作过程中，如何保存数据...这里还需要注意一点的是，经过掩码之后，output.nc文件跟CMIP6.nc文件大小(基本上)还是一样大，至于原因，我想可能是这个操作只是根据shape文件，把shape文件之外的区域值全部设置为nan...60度的范围内从图中可以看出CMIP6.nc和output.nc文件大小是一样大，但是经过selbox操作之后，output2.nc文件就很小了。...其实只看图片效果，可能还想不明白，为什么output2的文件大小会减少的如此之多，但结合nc文件的lat和lon数据，就能想明白了，这里的数据已经不是全球180x360的数据了。 ----

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CDO转换数据集格式

在进行数据处理和分析的过程中或是基于其他原因，为了方便进一步的处理，有时需要将NetCDF数据格式转换为GRIB数据格式。...在格式转换的过程中，首先要确定NetCDF格式数据中是否全部变量都包含网格信息，或是网格类型为非 generic。因为CDO不支持上述两种情况下的格式转换。...在CDO中 generic 表示的只是点，其中不包含任何网格信息。...注意：编译CDO时，要使用--with*选项指定要支持的操作，比如支持NetCDF，GRIB数据格式，需要指定 --with-netcdf, --with-grib_api 选项。...（即ecCodes）支持grib_api的功能，但是在使用老版本的CDO时，对于初学者来说仍建议使用grib_api。

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提高科研生产力——CDO的介绍与安装

前言 CDO全称The Climate Data Operators ，是一款相当强大的气象数据处理软件，包含一系列的统计参量和算术函数，用于处理GRIB和NetCDF格式数据有着相当方便指令操作。...用法展示对于小伙伴们比较常用的时间、空间平均，相关系数，最值处理，乃至EOF分析在CDO都只需要一行代码对的，你没有看错，只需要一行代码！...在系统上安装后,只需要将函数后面接上你输入输出的文件，就可以轻松实现数据的处理. 从数据文件中提取、增加、删除变量，改变维数再输入至新的文件. 全部都只需要一个指令，即可完成！...安装教程废话不多说，我们直接上安装教程 CDO的安装其实很简单，这里我们主要讲述在LINUX系统上的安装前期需要的软件有6个，本文给出的是博主已经安装成功的版本。...make check’ and ‘make install’ 在安装好eccodes后，要记得在自己的.bashrc中添加eccodes的库环境变量，否则在后面编译cdo时会报错，找不到libeccode.so

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CDO：强大的气候数据处理软件

CDO在处理气候及模式数据方面有着非常强大的功能，而且其中包含有一些简单的统计和计算函数，数据选择以及空间差值函数。支持常见的气象数据格式，比如GRIB，NetCDF等。...CDO有超过700个可用的数据操作，易于扩展，并且可以如Linux中的管道操作一样直接执行多个操作，而无需产生中间文件，从而省却很多不必要的磁盘空间。...除此之外，大部分操作都支持缺省值处理，而且处理大数据集也相对容易。说了这么多好处，最好的是可以利用Cygwin在windows上安装CDO，当然也支持Unix/Linux和MacOS-X系统。...CDO的一些扩展功能需要安装一些额外的依赖包，比如：安装NetCDF库以支持NetCDF数据集处理；如果要处理GRIB2格式文件则需要安装ECMWF的GRIB_API库；szip库和HDF5库可用于处理...-m 设置非NetCDF数据集的缺省值。

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续篇：ERA5数据插值方法详解 - xarray interp与interp_like

续篇：ERA5数据插值方法详解 - xarray interp与interp_like 上期有朋友在评论区询问有无更简单的插值方法，上次说的库很难安装在上一篇文章中，我们介绍了使用CDO和xesmf进行...本文将扩展介绍另外两种实用的插值方案：xarray自带的interp功能和interp_like函数，帮助大家在不同场景下选择最适合的工具。...方法比较与选择指南方法优点缺点适用场景CDO处理速度快，内存效率高需要命令行操作，调试不便批量处理大量数据xesmf基于ESMF，专业级插值初次使用需编译权重文件需要高质量保守插值xarray interp...集成在xarray中，使用简单大文件内存消耗大快速原型开发和小数据集interp_like集成在xarray中，使用简单，适合格点变量同种的数据使用范围较小同类数据 4....总结前后介绍了四种主要的ERA5数据插值方法：选择哪种方法取决于您的具体需求：希望本文能帮助您更好地处理ERA5和其他气象数据集的多分辨率问题。

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CDO学习1 CDO简介

介绍一个有几百种操作符的单独命令 CDO受NCO启发，通过命令行，提供了一系列的气候数据相关的操作主要是被设计用在操作netCDF3/4，GRIB1/2 众多的函数可以被用在任何NetCDF/格点化数据...非常适合与特定任务有效的调动内存 CDO：一个命令行工具 $ cdo [options] CDO操作的类别文件信息和文件操作符选择和比较元数据的修改算术操作符...可以用一些不同的方法选择数据包括：变量码，名称或者属性层次时间空间区域（纬度/经度）操作符：2.选择用id选择变量：“SSTK”和”CI”: $ cdo selname,SSTK,CI infile.nc...$ cdo ydrunpctdl,p,nts infile minfile maxfile outfile 该运算符写滑动的百分值对于一年中的每一天，从infile写到outfile。...T是一个可选的参数，其缺省值T=20℃。除此之外CDO还能做什么？ CDO有许多通用的命令行开关，可以与（大多数）运算符一起使用。

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气象数据的常用格式以及处理的工具

二进制文件和文本数据气象中的二进制文件是指利用ASCII及扩展ASCII字符编写的数据或程序指令的文件，一般没有格式，用文本编辑器打开只能看到无意义的乱码，需要特定的解码说明才能使用，例如气象雷达的数据...数据处理的介绍，有感兴趣的同学可以关注公众号查看历史精彩文章使用python处理NetCDF格式文件，这里介绍大家利用CDO如何处理netCDF格式的文件 CDO（Climate Data Operators...）是用来处理气候数据的命令行的集合，支持netCDF3/4以及Grib1/2数据格式，常用功能： cdo info a.nc ###查看文件信息 cdo -f grb copy a.nc a.grb...cdo -f nc copy a.grb a.nc ###grb和nc文件转换 cdo mergetime *nc test.nc ###合并netCDF文件 cdo -selyear,2019 -selmonth...255 33 ###提取过后经纬度点的数值 wgrib2 a.grb2 -set_grib_type c2 -small_grib 109:110 35:37 a_china.grb2 ###将文件裁剪到中国区域范围

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Python指定时间、经纬度读取NC数据

同时，在我们之前的文章Python批量读取NC数据的时间维信息中，就介绍过基于netCDF4库，对一个文件夹下大量.nc格式数据文件的某一维的信息加以提取的方法。...、变量与其他参数）——其中我们重点观察数据中的因变量（也就是上图中的swvl1），需要留意一下其后不同维的排序顺序，在后面我们按照维提取变量数据的时候会用到。 ...首先，我们指定一个处于.nc文件成像范围内的目标经度longitude_need和目标纬度latitude_need，并使用argmin()函数找到目标经、纬度值与文件中经度、纬度的维数据值最接近的索引值...我们可以在ArcGIS中打开这个.nc文件的第一景数据，找到代码中目标经、纬度（也就是longitude_need和latitude_need所指向的数据）所对应的像元，并查看其像素值；如下图所示。 ...可以看到，上图在ArcGIS提取出来的像素值，与上上图在Python中提取出来的像素值一致，说明我们的代码无误。至此，大功告成。

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气象数据处理：NetCDF文件处理

所谓自描述就是自带属性信息，这和一般的雷达基数据格式不同，一般的雷达数据也是二进制的，但不是自描述的，而是需要额外的数据格式文档来说明数据格式，而NetCDF文件中包含了描述变量和维度的元数据信息。...通常包含以下三个部分：维度变量属性维度部分记录的是每个变量的维度名及长度，而变量包含了维度，属性（如数据单位）信息及变量的值。属性部分包含了一些额外信息，比如文件创建者等。...io模块同样提供了 netcdf 文件处理方法，其所使用的外部模块和 netCDF4-python 使用的相同，都不需要使用 Unidata 提供的 netcdf C库。...:) sst = data->SST(1, :, :) 以上三种方法均可以处理netcdf文件，根据不同的需要使用不同的方法。...此节仅记录了怎么读netcdf文件，关于如何写netcdf文件下次再说。除了上述三种工具之外，CDO和NCO在处理netcdf文件时有时会非常有用，关于这两部分的介绍有空再说。

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如何利用CDO从数据集中提取数据

之前说了如何利用CDO查看数据集信息使用CDO查看气象数据信息。这一次说一下利用CDO从数据集中提取数据。这部分是非常使用的，尤其是当涉及到大数据集的时候，其优势就变得非常明显了。...比如，要提取某些时刻，某些变量在局部区域的数据： cdo -sellonlatbox,119.5,120.5,33.5,34.5 -selname,SCW,SCI,SCS,SCH,SCHL,SCR,SCTOT...# wrfsub.nc 输出文件名上述命令表示先从输入文件中选取第1，7，13，19，24个时步的所有变量，然后从所得的结果中选择指定的八个变量，然后再从得到的结果中选择指定经纬度范围的数据，...over 5 timesteps ( 24.10s ) 从输出信息中可以看出，总耗时在1min左右，查看输出文件信息可以看到，输出文件大小为98M，而之前的输入文件大小为206G！...当然了，除了选择部分数据之外，也可以从数据集中删除数据。选择字段 select 操作符可以从任意数量的输入文件中提取指定的信息，并输出到指定文件中。

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使用CDO查看气象数据信息

CDO提供了一系列查看数据集信息的命令，可以非常方便的查看数据集信息，而不用想使用python，ncl，matlab等编程语言或软件一样，先读文件，然后再获取相关信息，可以通过命令行直接对文件操作，然后将文件信息输出到屏幕...以NetCDF数据集为例： info # 通过列出参数ID查看数据集信息 infon # 通过列出参数名查看数据集信息 map # 展示数据集信息和样本映射执行 cdo info...图中最右列表示参数的ID，而将 info 改为 infon 之后，最右侧将变为参数名 ? 从左到右每一列分别表示序号，日期，时间，层序，网格大小，缺省值，最小值，平均值，最大值，参数ID/参数名。...也可以输出数据集中的参数数目，层数，年数，月数，网格数等信息。...上述获取数据集信息的操作符在进行数据处理之前是非常有用的，比如查看变量名，可以确定要处理的变量名称，查看日期和时间可以确定要处理哪一部分日期的数据等等。

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背向NCL，面向对象

PyNGL和PyNIO中的函数和绘图方式与NCL是非常类似的，可以非常顺畅的从NCL转到Python。...既然已经从NCL转到Python了，那么为什么一定要执着于PyNGL和PyNIO呢，今天就抛开PyNGL和PyNIO，介绍Python中其他常用库，实现真正的跨平台切换。...除了上述简单的数据处理库之外，python还提供了NCO和CDO工具的封装，pynco和cdo，提供了更多的便捷操作。...数据插值 •xESMF和ESMPy：气象数据空间插值，尤其是对于模式网格数据而言，提供了一些便捷的命令可对网格数据进行一些列插值操作•python-stratify：针对大气和海洋数据进行垂直插值•scipy.interpolate...模块提供了大量插值函数•python-geotiepoints：针对地理网格数据的空间插值说到地球科学领域的数据处理，最离不开的应该也是模式输出数据了。

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wrf-python 详解之API

当然，大多数时候我们仅需要wrf-python已经提供的诊断函数和其它可调用函数，可能都不会使用到这些API。...用户API 方法诊断从WRF输出中返回基本诊断变量插值返回3D场插值到2D平面(指定垂直层)的值坐标转换返回经纬度坐标对应的X,Y坐标网格去栅格返回去栅格化后的变量，与NCL中的wrf_user_unstagger...函数效果相同 numpy 提取返回 xarray.DataArray 实例中包含的 numpy.ndarray 数组变量提取从NetCDF文件或NetCDF文件对象序列中提取变量辅助绘图返回文件或是变量的地理边界...原始诊断方法返回2D网格中一个线上的x,y点配置方法如果安装并打开了 xarray 则返回 True 其他如果输入变量名是时间坐标则返回 True 类异常当诊断过程中发生错误是触发异常 CoordPair...装饰器算法装饰器从封装函数输出进行单位转换的装饰器元数据装饰器为封装函数的输出设置元数据的装饰器装饰器工具确定文件中包含哪个变量的可调用类类可迭代封装器类一个生成器和自定义可迭代类的封装类

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python推荐 | 面向地学领域的Python库汇总

这是一篇告诉你如何更好的使用Python来解决地学领域问题的文章。数据处理 •NetCDF格式 : netCDF4-python，h5py，h5netcdf，xarray等。...除了上述简单的数据处理库之外，python还提供了NCO和CDO工具的封装，pynco和cdo，提供了更多的便捷操作。...数据插值 •xESMF和ESMPy：气象数据空间插值，尤其是对于模式网格数据而言，提供了一些便捷的命令可对网格数据进行一些列插值操作•python-stratify：针对大气和海洋数据进行垂直插值•scipy.interpolate...模块提供了大量插值函数•python-geotiepoints：针对地理网格数据的空间插值说到地球科学领域的数据处理，最离不开的应该也是模式输出数据了。...当然还有一些库不知道该怎么分类，因为分析画图的时候会用到，就放到这边吧： •geopandas：地理空间数据处理和可视化神器•pyshp，fiona等可处理常规的shapefile文件，常在画图的时候添加海岸线和边界线使用

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wrf-python 详解之如何使用

近几年，python在气象领域的发展也越来越快，同时出现了很多用于处理气象数据的python包。比如和NCL中的 WRF_ARWUser库类似的 wrf-python模块。...如果指定值的话，那么从每个文件中提取变量时，指定值将应用于每个文件。在具有多个时刻的多个文件中，这样做可能是没有意义的，因为每个文件的第 n 个索引可能表示不同的时刻。...然而，在字典中所有的WRF文件都应包含相同的维度。结果是一个数组，最左侧的维度是字典中的键。同样允许使用嵌套字典。...=start_point, end_point=end_point, latlon=True) 使用中心点和角度 # 在网格坐标中定义中心点和角度, 中心点在网格的中心 pivot_point = CoordPair...插值2D场到一条线使用 wrf.interpline 函数可以沿着一条线对2D场进行插值，这类似3D场的垂直剖面插值。为了定义插值的线，可以是线的起始和终止点。

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xarray系列｜WRF模式前处理和后处理

这一篇主要来说一下WRF模式的前处理和后处理部分，后处理分为：数据提取、投影转换、插值和可视化。...WRF模式前处理 WRF模式后处理数据提取投影转换插值可视化本文除了xarray之外，主要使用了 salem 和 xesmf 这两个库，salem 主要是进行前处理和部分后处理操作，xesmf...这里就数据提取、投影转换、插值和可视化几个部分说一下。由于WRF模式的输出并不完全兼容NetCDF格式的CF标准，所以无法直接利用 xarray 的很多函数。...数据提取数据提取和之前说的类似，主要是利用 .sel 和 .isel 等函数。这里还是以提取站点数据为例，强调一个数据提取需要注意的问题。...如果改为 xy[0].data 和 xy[1].data 得到的将是站点数x站点数的网格信息。这是因为在提取站点信息时，.sel这些函数接受的参数应该是 DataArray 对象。

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