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    R中的sweep函数

    函数的用途 base包中的sweep函数是处理统计量的工具,一般可以结合apply()函数来使用。...函数的参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理的原数据集 MARGIN:对行或列,或者数列的其他维度进行操作...…… 下面我们结合几个具体的例子来看 #创建一个4行3列的矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行的均值 #方法一,通过rowMeans函数来计算每一行的均值...sweep(M,1,rowMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一行的均值,MARGIN=1,对行做操作 sweep(M,1,apply(M,1,mean)) 2.每一行列都减去这一列的均值...#方法一,通过colMeans函数来计算每一列的均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一列的均值,MARGIN=2,对列做操作 sweep(M,2,

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    「R」tidyverse 中的公式函数

    img 公式保存了创建它的环境 使用到 R 的朋友几乎都用过公式,它在统计建模方面给了我们极大的方便。不过,公式相比于数值、逻辑值这些数据类型,有什么特点吗?...")=R_GlobalEnv> 从属性部分我们可以看到公式保存了创建它的环境。...基本用法 假设我们要对 df 中的 x 和 y 列进行归一化处理,在不使用 scale() 函数的情况下,我们可能会手写一个函数: scale2 <- function(x) { (x - mean...计算残差 最开始的图形显示了 x 和 y 是一个线性关系,假设我们目前有一个任务:构建回归模型并手动计算残差,绘制结果图。 我们来看看如何操作。...在公式中,我们可以直接使用前面已经定义的变量,这里是 cfs。

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    R中的替换函数gsub

    R中gsub替换函数的参数如下 gsub(pattern, replacement, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE,...vector举例如下: > x R Tutorial","PHP Tutorial", "HTML Tutorial") > gsub("Tutorial","Examples",x) #将...Tutorial替换成Examplers [1] "R Examples" "PHP Examples" "HTML Examples" 还有其他的一些例子来灵活使用这个函数,结合正则表达式。...,我们知道组织病理分期分成stage I,stage II,stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组,并转换成因子 我们使用gsub函数...,并转换成因子 我们还是使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾的A,B或者C等字母,例如Stage IIIA,Stage IIIB stage=gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage

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    【R语言】热图绘制-heatmap函数

    前面给大家介绍过 1.超详细的热图绘制教程(5000余字),真正的保姆级教程 2.R语言绘制基因表达热图(简易版) 3.一个R函数搞定风险评估散点图,热图 4.R绘制甲基化和表达谱联合分析热图...其实每一张热图后面都对应一个表达矩阵。如上图所示,每一行是一个基因,每一列是一个样本。每一个小的色块,就是这个基因在这个样本中的表达量。...因为绘制热图的一个目的,也是为了展示和检查挑选出的差异表达基因是否能够很好的将不同类型的样本区分开,这里有tumor和normal两种类型的样本。...下面我们结合一个具体的例子来讲解如何使用R的heatmap函数绘制热图 #读取所有miRNA的表达矩阵 expr=read.table("miRNA_expr.txt",header=T,row.names...: 1.超详细的热图绘制教程(5000余字),真正的保姆级教程 2.R语言绘制基因表达热图(简易版) 3.一个R函数搞定风险评估散点图,热图 4.R绘制甲基化和表达谱联合分析热图 5.R语言中的颜色(一

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    R」R 的函数

    首先构造一个函数,它有一个参数x。这个函数的参数列表中还包含了一个省略号,因此这个省略号将成为我们调用的summary函数的参数。...这有点类似于shell中通过$引用相应的参数。看来很多的编程语言都存有相同的参数传递机制。 函数的属性 R中包含了一系列的函数用于提取函数类型对象的信息。...NULL 如果我们想要在R代码中对函数的参数列表进行操作,formals函数是一个很好的工具,它会返回一个配对列表对象(对应参数名和设定的默认参数值)。...注意,formals函数仅能运行在R写的函数上(类型为closure的对象),而不能在内嵌函数(bulti-in function)上运行。...解释器将这样递归地在各个环境中寻找直到找到该符号或到达全局环境。加入解释器在到达全局环境时依然没有找到var,那么R会在全局环境中指定var的值为value。

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    R中的stack和unstack函数

    我们用R做数据处理的时候,经常要对数据的格式进行变换。例如将数据框(dataframe)转换成列表(list),或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样的功能。 这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠,就像下面这张图展示的这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样的功能呢?下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框的第二列的分组信息,将第一列的数据划分到各个组,是一个去堆叠的过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体的例子 例如现在我们手上有一个数据框,里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 中的内容,第一列是重量,第二列是不同的处理方式...,后面小编会使用这两个函数来给大家举个真实的应用案例,敬请期待。

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    R中的grep和grepl函数

    在日常数据分析的过程中,我们经常需要在一个字符串或者字符串向量中查找是否包含我们要找的东西,或者向量中那几个元素包含我们要查找的内容。...这个时候我们会用到R中最常用的两个函数,grep和grepl。...其实grep这个函数也并非是R所特有的,在linux中模式匹配也用grep这个函数,前面我就给大家简单介绍过☞Linux xargs grep zgrep命令。...我们先来看看grep和grepl这两个函数的用法。 这两个函数最大的区别在于grep返回找到的位置,grepl返回是否包含要查找的内容。接下来我们结合具体的例子来讲解。...☞讨论学习R的grepl函数 参考资料: ☞Linux xargs grep zgrep命令 ☞讨论学习R的grepl函数

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    Linux不同共享库中同名函数的处理

    场景引入: 在一个尚未成熟的行业中,一般行业标准是先于国家标准。这就导致了开发人员需要做很多兼容工作,再就是会用到很多其他厂商提供的库与头文件,面对不同版本的标准,一般会更新库与头文件。...那么此时如果要兼容新库和旧库要做怎样的操作呢? ①当两个C语言共享库之间有同名函数,链接时会报错么? ②如果不报错,调用的顺序是如何确定的呢? ③如果我想兼容两个库,该如何操作呢?...(别人的库无法更改函数名、C++可以使用命名空间) 方法是肯定有的,这次先测试①和②效果。 一、创建两个具有同名函数的共享库 1. 文件目录结构 ?...两个共享库中有同名函数myPrintf(),输出内容不同。 二、测试共享库 1. 目录结构 ? myAppTest是程序执行环境 env.sh内容:export LD_LIBRARY_PATH=....一、小结 当两个共享库中有同名函数时,调用函数顺序取决于链接库顺序。

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    细说Python中的函数不同使用方法

    这是告诉Python,函数中sh使用的“x”变量应该是其他位置创建的全局变量,而不是一个局部变量。...所以程序第一行打印的是33,此后调用 函数sss,此时更行第四行中全局变量的值,再打印x的值时,为800 8、内建函数 内建函数要用到 “exec ”函数,最终的结果时再一个程序中运行另一个程序,听起来挺拗口的...,如果要改变的话,可以把返回值再存储到列表中  如果要返回列表的话,我们需要将返回值中的小括号改成方括号即可  10、接下来该考虑一下比较综合性的函数 我们就考虑做一个求平均值的函数,调用函数的代码有时候只用传入少许的参数...,但是有的时候却要传入多组数据,我们可以使用任意参数长度标记——星号(*),我们就可以编写接收不同参数数量的函数,下面是一个实例 def average(*numbers): # * 的作用是将数据变成一个元组存放...“拆分”,“拆分” 就是将列表 或者 元组中的元素拿出来,然后再放入函数中的名为numbers的元组当中 ,然后再进行平均数的运算

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    R中优雅的绘制环状sina图

    ❝在R中创建sina图使用geom_sina函数,sina图是一种用于显示单个分类变量的每个观测值的图形。它与箱线图和小提琴图类似,但是它显示了每个单独的数据点,这可以提供关于数据分布的更多信息。...❞ 「sina图的主要优点是它可以清楚地显示每个数据点,而不是简单地显示数据的总体分布。这使得sina图特别适用于小样本大小的数据集,其中每个数据点的值都很重要。」...gas_day_started_on)) 数据可视化 df %>% ggplot(aes(x=mth, y=gas_in_storage_t_wh,group=mth)) + # 使用ggforce包中的...geom_sina函数绘制sina图 ggforce::geom_sina(aes(color=gas_in_storage_t_wh), alpha=.5, shape=21)+ # 添加文本标签...), lab=c("2","4","6","8TWh")), aes(x=x, y=y, label=y),inherit.aes = FALSE)+ # 使用scico包中的

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    JS中函数声明与函数表达式的不同

    Js中的函数声明是指下面的形式: function functionName(){ }         这样的方式来声明一个函数,而函数表达式则是类似表达式那样来声明一个函数,如: var functionName...= function(){ }         可能很多朋友在看到这两一种写法时会产生疑惑,这两种写法差不多,在应用中貌似也都是可行的,那他们有什么差别呢?       ...事实上,js的解析器对函数声明与函数表达式并不是一视同仁地对待的。...对于函数声明,js解析器会优先读取,确保在所有代码执行之前声明已经被解析,而函数表达式,如同定义其它基本类型的变量一样,只在执行到某一句时也会对其进行解析,所以在实际中,它们还是会有差异的,具体表现在,...当使用函数声明的形式来定义函数时,可将调用语句写在函数声明之前,而后者,这样做的话会报错。

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