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阿榜的生信笔记10—R语言综合运用2

云原生分布式云中心

哈喽，我是学习生物信息学的阿榜！非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记，将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误，欢迎指正。让我们一起加油，一起学习进步鸭🦆一、apply()隐式循环apply() 函数是一种隐式循环函数，可以在矩阵、数组、数据框等对象上进行操作。它的基本语法如下：apply(X, MARGIN, FUN, ...)：对X的每一个维度（1对行、2对列）进行FUN函数操作X ：需要操作的对象； MARGIN： X 的哪个维度需要进行循环操作，1是行、2是列；FUN

2023-05-02

7150

阿榜的生信笔记9—GEO分析

云原生分布式云中心

哈喽，我是学习生物信息学的阿榜！非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记，将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误，欢迎指正。让我们一起加油，一起学习进步鸭🦆一、实验目的：通过基因表达量数据的差异分析和富集分析来解释生物学现象病变组织vs健康组织药物处理vs对照组开花前vs开花后动物/动物不同发育期高产/低产品种思路：有差异的材料→差异基因→找功能/找关联→解释差异,缩小基因范围二、明白三个概念GPL：用户测序使用的芯片/平台；GSM：用户提交给GEO的样本数据；GSE：一个完整的研

2023-05-02

2880

阿榜的生信笔记8—GEO图表介绍

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哈喽，我是学习生物信息学的阿榜！非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记，将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误，欢迎指正。让我们一起加油，一起学习进步鸭🦆这份学习目录可以让大家更容易地了解笔记里面的内容哦😊：一、热图输入数据：数值型矩阵或者数据框图片图例中的颜色深浅表示数值大小，相关性大小二、散点图和箱型图散点图通过在二维平面上绘制数据点来展示两个变量之间的关系。散点图可用于显示数据之间的关系，如相关性或聚集情况，以及异常值的存在。箱型图（又称箱线图）是一种展示数据集中值分布情况

2023-05-02

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阿榜的生信笔记7—R语言的综合运用1

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哈喽，我是学习生物信息学的阿榜！非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记，将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误，欢迎指正。让我们一起加油，一起学习进步鸭? 这份学习目录可以

2023-04-30

6600

阿榜的生信笔记6-R作图

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哈喽，我是学习生物信息学的阿榜！非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记，将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误，欢迎指正。让我们一起加油，一起学习进步鸭? 这份思维导图可以

2023-04-30

5720

阿榜的生信笔记5

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哈喽，我是学习生物信息学的阿榜！非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记，将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误，欢迎指正。让我们一起加油，一起学习进步鸭? 这份学习目录可以

2023-04-30

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阿榜的生信笔记4

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哈喽，我是学习生物信息学的阿榜！非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记，将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误，欢迎指正。让我们一起加油，一起学习进步鸭? 这份思维导图可以

2023-04-29

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阿榜的生信笔记3

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哈喽，我是学习生物信息学的阿榜！非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记，将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误，欢迎指正。让我们一起加油，一起学习进步鸭? 这份思维导图可以

2023-04-29

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阿榜的生信笔记2

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哈喽，我是学习生物信息学的阿榜！非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记，将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误，欢迎指正。让我们一起加油，一起学习进步鸭? 这份思维导图可以

2023-04-29

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阿榜的生信笔记1

云原生分布式云中心

哈喽，我是学习生信的阿榜。很高兴你能点进来看我的笔记，若有错误欢迎指正，一起加油鸭? 这张思维导图是笔记的大纲，大家可以先通过这张大纲了解笔记里面有什么内容。这份笔记带大家认识与R及RStudio有

2023-04-29

4620

阿榜的生信笔记

传媒云原生移动开发平台

---title: "生信R"author: "JB"date: "2023-04-14"output: html_document---R Markdown#重点：数据框#1.数据框来源# （1）用代码新建: #df1 <- data.frame(gene = paste0("gene",1:4), #change = rep(c("up","down"),each = 2), #score = c(5

2023-04-15

3790

阿榜的生信笔记

传媒云原生移动开发平台

#####2.3.对两个向量进行的操作#####x = c(1,3,5,1)y = c(3,2,5,6)#(1)比较运算，生成等长的逻辑向量x == y ##以x为主体进行比较## [1] FALSE FALSE TRUE FALSEy == x ##以y为主体进行比较## [1] FALSE FALSE TRUE FALSE#(2)数学计算x + y ##x,y对应向量进行加法运算## [1] 4 5 10 7#(3)连接paste(x,y,sep="

2023-04-13

5030

阿榜的生信笔记

传媒云原生移动开发平台

---title: "生信R"author: "JB"date: "2023-04-13"output: html_document---R Markdown#####2.1.向量生成🌟#######以下是向量生成的四种方法（不需要死记硬背，多操作几次即可）：#(1)用 c() 结合到一起c(2,5,6,2,9) ## [1] 2 5 6 2 9c("a","f","md","b")## [1] "a" "f" "md" "b"#(2)连续的数字用冒号“:” 1:5## [1] 1 2 3 4 5#(3

2023-04-13

5260

传媒云原生移动开发平台

---title: "R1~2dy"output: html_documentdate: "2023-04-06"---R Markdown#####2.1.向量生成🌟######(1)用 c() 结合到一起c(2,5,6,2,9) ## [1] 2 5 6 2 9c("a","f","md","b")## [1] "a" "f" "md" "b"c(2,5,6,2,9,"a") ## [1] "2" "5" "6" "2" "9" "a"c("a","f","md","b")## [1] "a" "

2023-04-13

2370

阿榜的技能书

传媒云原生移动开发平台

---title: "R1~2note"output: html_documentdate: "2023-04-06"---R Markdownhead(iris)## Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species## 1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa## 2 4.9 3.0 1.4

2023-04-06

3580

生信技能树

传媒云原生移动开发平台

title: "note" output: html_document date: "2023-04-05" knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE,message=F,warning=F) R Markdown head(iris) plot(iris$Sepal.Length) 引用自生信技能树图片

2023-04-05

4970

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