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🤩 velocyto.R | 可以用R语言做单细胞RNA速率啦！~
可视化
数据
cell
colors
velocity
生信漫卷
2025-02-05
81
1
🤩 Cellchat | 空间转录组也可以做细胞通讯啦！~（二）（多个数据集篇）
通信
网络
data
可视化
数据
CellChat是一个专门用于分析细胞间通信的强大工具，现在也是支持空间转录组的分析了。🧐
生信漫卷
2025-01-07
122
0
🤩 scDiffCom | 看过来吧！~细胞间通讯怎么做差异分析呢！？
数据
数据库
cell
object
可视化
该工具包结合了最新的生物学知识库和单细胞表达数据，通过识别配体-受体相互作用来揭示细胞间的信号传递关系。💪
生信漫卷
2024-11-26
213
0
🤩 Cellchat | 空间转录组也可以做细胞通讯啦！~（一）（单个数据集篇）
spatial
可视化
数据
网络
data
CellChat 2 现在支持多种数据类型，除了单细胞转录组数据（scRNA-seq），还扩展支持 空间转录组数据（spatial transcriptomics）。😘
生信漫卷
2024-11-23
330
0
🤩 TrendCatcher | 一把做动态差异表达分析的利剑！~（三）
数据
统计
list
可视化
量化
TrendCatcher是一个用于RNA-seq数据动态通路行为分析的R包，尤其适合比较两组数据（例如对照组与处理组）在多个时间点的通路变化差异。💪
生信漫卷
2024-11-23
120
0
🤩 TrendCatcher | 一把做动态差异表达分析的利剑！~（二）
go
heatmap
time
工作
数据
今天继续之前的TrendCatcher，大家做完时序上的差异基因，然后就是想知道这些基因的功能，这就要用到富集分析了。🧐
生信漫卷
2024-11-23
71
0
🤩 TrendCatcher | 一把做动态差异表达分析的利剑！~（一）
可视化
模型
数据
list
table
TrendCatcher 是一个专门用于识别时间序列数据中关键趋势变化的 R 包，特别适用于动态的生物学或医学研究场景，如单细胞转录组测序数据的时间或伪时间序列分析。
生信漫卷
2024-11-23
119
0
🤩 scRank | Cool~单细胞测序数据推断药物反应性！~
网络
函数
可视化
模块化
数据
在这个美好的中秋佳节，愿你的生活如月光般明亮，事业如圆月般圆满，心中永远充满温暖与喜悦。😀
生信漫卷
2024-11-23
148
0
🤩 Ragas | 有手就行！分分钟上手的单细胞分析R包！~
list
object
可视化
入门
数据
运行RunFindAllMarker从Seurat调用FindAllMarkers。😘
生信漫卷
2024-11-23
164
0
🤩 CytoTRACE2 | 新版CytoTRACE预测发育分化潜能！~
数据
data
集合
可视化
模型
没什么想再说的了，就到这吧，今天是新版的CytoTRACE，简单易用，大家学起来。😘
生信漫卷
2024-11-23
241
0
🤩 hdWGCNA | 单细胞数据怎么做WGCNA呢！？（五）（相关性分析）
可视化
排序
数据
变量
函数
今天继续之前的hdWGCNA教程，做完了前面的模块分割、鉴定，该和各种traits相关起来啦。😂
生信漫卷
2024-07-31
313
0
🤩 Mime1 | 终极机器学习算法大组合筛选你的最佳模型（二）（二分类结局篇）
可视化
模型
数据
机器学习算法
list
生信漫卷
2024-07-12
549
0
🤩 Mime1 | 终极机器学习算法大组合筛选你的最佳模型（一）（预后模型篇）
可视化
模型
数据
机器学习算法
list
今天讲一下机器学习的神包，Mime1，之所以写这个名字，是怕大家和Mime包混淆，影响安装。😂
生信漫卷
2024-07-12
1.2K
1
🤩 hdWGCNA | 单细胞数据怎么做WGCNA呢！？（四）（差异分析）
可视化
数据
cell
plot
函数
在这里，我们将group.by对每种细胞类型进行One-versus-all分析。🦀
生信漫卷
2024-07-12
311
0
🤩 hdWGCNA | 单细胞数据怎么做WGCNA呢！？（三）（pseudobulk data）
data
meta
可视化
数据
网络
今天没什么废话，主要讲讲如何用pseudobulk data做hdWGCNA。🙃
生信漫卷
2024-05-27
364
1
🤩 hdWGCNA | 单细胞数据怎么做WGCNA呢！？（二）（基础可视化）
函数
基础
可视化
数据
工作
明明是认真的完成了自己的工作，不过总有人觉得你过的太舒服，非要让你过上牛马一样的生活，他才觉得是正常的，真是不能理解。🙃
生信漫卷
2024-05-27
482
0
🤩 hdWGCNA | 单细胞数据怎么做WGCNA呢！？（一）（小试牛刀）
可视化
数据
存储
对象
函数
好久没更了，今天写一下hdWGCNA吧，单细胞和空间转录组都能用到的高级分析。🧐
生信漫卷
2024-05-27
714
0
🤩 CellMarker | 人骨骼肌组织细胞Marker大全！~（强烈建议火速收藏！）
min
raster
marker
分享一下最近看到的2篇paper关于骨骼肌组织的细胞Marker，绝对的Atlas级好东西。👍
生信漫卷
2024-05-08
693
0
🤩 GeneSelectR | 用多种机器学习方法筛选重要基因！~
机器学习
selection
工作
基础
可视化
GeneSelect是基于使用Python进行特征选择的。所以第一次用的时候需要安装相应的Python模块，需要为包创建工作环境。
生信漫卷
2024-04-23
656
1
🤩 catboost | 分量变量的梯度提升机器学习算法怎么用！?~（附shap解析！~）
变量
可视化
模型
算法
机器学习算法
CatBoost和XGBoost、LightGBM并称为GBDT的三大主流神器，都是在GBDT算法框架下的一种改进实现。
生信漫卷
2024-04-10
221
0
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