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R语言及实用科研软件

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🤩 Journal Club | 机械力触发自组装的中草药水凝胶用于伤口愈合!~
该研究开发了一种机械力触发自组装的中草药水凝胶(hydrogel),用于伤口愈合。
生信漫卷
2025-05-12
250
🤩 scanpy | 超高速完成单细胞分析!~(一)(预处理与聚类)
看现在的趋势,未来python可能才是未来,R再不做出改变就要被取代了。🙂‍↕️
生信漫卷
2025-05-04
2990
🤩 enrichment_all | 一键完成富集分析!~(配高颜值可视化!)
最近做这些富集分析实在太烦了,我就自己写了2个函数,run_enrichment_all()和plot_enrichment_all()。😂
生信漫卷
2025-04-28
1030
🤩 mLLMCelltype | 多种大语言模型助力细胞类型注释!~
最近发现了一个AI辅助的注释工具,非常不错,原作者也是向我毛遂自荐,用了一下确实不错。👍
生信漫卷
2025-04-21
1751
🤩 Journal Club | 单细胞多组学分析揭示巨噬细胞亚群在心脏修复中的作用
心血管疾病是全球主要死因,心肌梗死(MI)后心脏修复过程复杂,涉及炎症反应与组织修复的平衡。🫠
生信漫卷
2025-04-13
1050
🤩 Journal Club | 多组学整合揭示炎症与前肥大软骨细胞驱动骨关节炎软骨退变
本研究整合单细胞转录组(scRNA-seq)、空间转录组(Geo-seq)、GWAS和bulk RNA-seq数据,系统揭示OA膝关节软骨退变的细胞与分子机制。🧐
生信漫卷
2025-04-06
810
🤩 Journal Club | 单细胞与空间转录组学揭示骨骼肌纤维化中的关键巨噬细胞亚群
肌肉不仅是运动的引擎,更是高度动态的组织。在健康状态下,巨噬细胞像“维修工”一样清除损伤碎片、促进再生。😘
生信漫卷
2025-03-31
1680
🤩 velocyto.R | 可以用R语言做单细胞RNA速率啦!~
生信漫卷
2025-02-05
2361
🤩 Cellchat | 空间转录组也可以做细胞通讯啦!~(二)(多个数据集篇)
CellChat是一个专门用于分析细胞间通信的强大工具,现在也是支持空间转录组的分析了。🧐
生信漫卷
2025-01-07
2940
🤩 scDiffCom | 看过来吧!~细胞间通讯怎么做差异分析呢!?
该工具包结合了最新的生物学知识库和单细胞表达数据,通过识别配体-受体相互作用来揭示细胞间的信号传递关系。💪
生信漫卷
2024-11-26
2690
🤩 Cellchat | 空间转录组也可以做细胞通讯啦!~(一)(单个数据集篇)
CellChat 2 现在支持多种数据类型,除了单细胞转录组数据(scRNA-seq),还扩展支持 空间转录组数据(spatial transcriptomics)。😘
生信漫卷
2024-11-23
5310
🤩 TrendCatcher | 一把做动态差异表达分析的利剑!~(三)
TrendCatcher是一个用于RNA-seq数据动态通路行为分析的R包,尤其适合比较两组数据(例如对照组与处理组)在多个时间点的通路变化差异。💪
生信漫卷
2024-11-23
1350
🤩 TrendCatcher | 一把做动态差异表达分析的利剑!~(二)
今天继续之前的TrendCatcher,大家做完时序上的差异基因,然后就是想知道这些基因的功能,这就要用到富集分析了。🧐
生信漫卷
2024-11-23
780
🤩 TrendCatcher | 一把做动态差异表达分析的利剑!~(一)
TrendCatcher 是一个专门用于识别时间序列数据中关键趋势变化的 R 包,特别适用于动态的生物学或医学研究场景,如单细胞转录组测序数据的时间或伪时间序列分析。
生信漫卷
2024-11-23
1470
🤩 scRank | Cool~单细胞测序数据推断药物反应性!~
在这个美好的中秋佳节,愿你的生活如月光般明亮,事业如圆月般圆满,心中永远充满温暖与喜悦。😀
生信漫卷
2024-11-23
2420
🤩 Ragas | 有手就行!分分钟上手的单细胞分析R包!~
运行RunFindAllMarker从Seurat调用FindAllMarkers。😘
生信漫卷
2024-11-23
2200
🤩 CytoTRACE2 | 新版CytoTRACE预测发育分化潜能!~
没什么想再说的了,就到这吧,今天是新版的CytoTRACE,简单易用,大家学起来。😘
生信漫卷
2024-11-23
3740
🤩 hdWGCNA | 单细胞数据怎么做WGCNA呢!?(五)(相关性分析)
今天继续之前的hdWGCNA教程,做完了前面的模块分割、鉴定,该和各种traits相关起来啦。😂
生信漫卷
2024-07-31
4000
🤩 Mime1 | 终极机器学习算法大组合筛选你的最佳模型(二)(二分类结局篇)
生信漫卷
2024-07-12
6480
🤩 Mime1 | 终极机器学习算法大组合筛选你的最佳模型(一)(预后模型篇)
今天讲一下机器学习的神包,Mime1,之所以写这个名字,是怕大家和Mime包混淆,影响安装。😂
生信漫卷
2024-07-12
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