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ChAMP甲基化芯片分析官方流程学习

ChAMP(Chip Analysis Methylation Pipeline)是一个用于Illumina 450K和850K DNA甲基化芯片数据分析的R包。它是一个全面的工具包，可以从数据预处理到差异甲基化分析和功能注释提供一站式解决方案。它特别适用于甲基化数据的批处理分析和高通量研究。

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2025-01-17

1000

Chip-seq上游分析流程学习(四)

本次分析步骤包括：环境部署——数据下载——查看数据(非过滤)——数据质控清洗——数据比对——去除pcr重复——peaks calling——可视化

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2024-11-21

1590

Chip-seq上游分析流程学习(三)

转录组数据对比之后是进行定量，而在chip-seq中后续的步骤是去除pcr重复，peaks calling，以及可视化。

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2024-11-20

850

Chip-seq上游分析流程学习(二)

本次分析步骤包括：环境部署——数据下载——查看数据(非过滤)——数据质控清洗——数据比对

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2024-11-19

1460

Chip-seq上游分析流程学习(一)

这次用到的数据集是GSE274995，里面包含了3个样本的头颈部鳞癌细胞系(Cal27细胞)数据。

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2024-11-17

1190

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