biotrainee note 9

差异分析

探针注释

当多个探针对应1个基因时，可以：

1.随机去重

2.保留行和/行平均值最大的探针

3.取多个探针的平均值（最不常用）

差异基因的聚类分析

聚类的本质是将相同的行和列放在一起，用于观察组间基因表达的变化趋势

富集分析

多分组数据分析

获取数据

步骤同两分组

生成分组向量及探针注释

生成分组向量时，应将对照组放在第一个位置，实验组如果有递进关系，可分别放在2、3的位置

提取分组的关键词的时候，要选择“只有我有，大家都没有”的关键词作为分组依据

引用自生信技能树