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综合分析从不同细胞群收集的大规模单细胞数据有望提高对复杂生物系统的理解。虽然已经开发了几种用于单细胞rna测序数据集成的算法，但由于其内存和运行时间要求，许多算...
批效应（BEs）是组学数据中的主要噪声源，经常掩盖真实的生物信号。BEs在现有数据集中仍然很常见。目前的BE校正方法大多依赖于特定的假设或复杂的模型，可能无法充...
高通量测序技术[下一代测序（NGS）]越来越多地用于解决各种生物学问题。尽管NGS数据中包含丰富的信息，特别是来自NGDC基因组序列档案（GSA）等存储库的数据...
通常情况下，基因表达研究如微阵列和RNA-Seq会产生数百到数千个差异表达基因（deg）。理解如此庞大的数据集的生物学意义变得非常困难，尤其是在分析多个条件和比...
tidyplots----取代ggplot2的科研绘图利器。tidyplots的目标是简化为科学论文准备出版的情节的创建。它允许使用一致和直观的语法逐渐添加，删...
这个包扩展了ggplot2，提供了用于对齐和组织多个图的高级工具，特别是那些自动重新排序观察结果的工具，比如树形图。它提供了对布局调整和情节注释的精细控制，使您...
The following code can be used to generate figures for the saliva adhesion assay...
物种系统发育树（Phylogenetic tree），也称为进化树或系统进化树，是一种以树状分支图形来表示各物种或基因之间的亲缘关系的图表。它利用生物的形态特征...
人类肠道微生物群由数万亿细菌组成，对健康和疾病有重大影响。通过现代技术的进步，高通量分析提供了增强我们对微生物组与复杂疾病结果之间联系的理解的潜力。然而，目前的...
人类健康与微生物群之间的联系，包括在代谢水平上的潜在疾病风险，已得到充分证实。然而，由于涉及的大量数据和它们之间错综复杂的相互作用所造成的分析挑战，理解这种关系...
探究土壤中的ARGs (抗性基因)与环境的相关关系变化的文章，文章提供了完整的数据和代码，方便大家复现和借鉴。
本章节全面汇总了生存分析的相关各类分析方法，形成了一个系统化的生存分析教程。通过这个教程，读者可以深入了解生存分析所涵盖的多种分析技术。组合下列结果的可视化可见...
R包regplot：这个包提供了一个函数，用于绘制回归模型的列线图（Nomogram）。这种图形是一种可视化工具，用于展示预测模型的结果，使得模型的预测过程更加...
液相色谱-质谱串联（LC-MS/MS）是一种高效且灵敏的分析技术，广泛应用于多个领域中的化合物检测、鉴定和定量。在残留化合物检测方面，LC-MS/MS能够精确识...
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宏基因组数据的荟萃分析是一种综合多个独立宏基因组研究结果的方法，目的是揭示不同人群或样本中微生物群落的共同特征和差异。这种方法特别适用于跨区域、跨人群的大规模比...
pROC::roc函数能够使用一个指标（predictor）去区分两个或多个分组（response），并计算95%置信区间的原理基于以下几个关键点：
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