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“ 我再次强调一下,我会的所有知识,我都看过5本以上的书,甚至把一本书看五遍,这个我觉得没有任何难道,任何事情想学会学好,本来需要付出的。 ”
这一篇微信文章是2017年2月写的了,距离现在7年,语言生动有趣跟现在的风格还有点不一样,那时候曾老师竟然一个个回点评还用颜文字嘞,而且17年就自称老一辈的生信...
2.连续型的信息(如年龄、基因表达量、风险)分为2or3组分开画:根据中位数;根据某个具体的数值;最佳截断值
2. 线粒体基因比例特别高的,往往细胞表达的nCount比较大,可以通过percent.mt过滤
今天曾老师还实战了一波现场装版本限制的monocle3包,手忙脚乱一直出岔子莫名其妙的样子竟然和菜鸟我本人平时遇到bug是一样的,瞬间心平气和对未来充满希望了(...
2.19-20年是单细胞的黄金时代,主要的分析步骤这个时段已经确定,看这个阶段的文献已经可以学到很多,虽然现在新出现了大量的工具方法,但对我们数据挖掘都不太有帮...
str_split之后得到的是matrix,之前用管道符是无法直接取列的,加个.就可以了
GSEA & GSVA:以一组基因为单位,来描述是否参与某种功能,直接注释的结果是得到大量的功能节点
今天的内容终于到转录组下游啦,R比起Linux易懂很多,基本上改改分组信息无脑run就好
转录组上游的内容终于上完了,今天的内容太抽象了,每一步处理的内容都不是很好理解,现在上完课也还是摸不着头脑,最大的收获似乎是多按tab键?
今天的主要内容是转录组上游的质控,设计到4个包:fastqc、multiqc、trim_galore、fastp
1、TCGA的tumor和normal是表达数据里自带的,因此不需要特地下载临床信息,但是如果需要筛选样本,如特定的癌症亚类或相关的信息就需要临床信息
啊啊啊,太伤心了,这一天的课小洁老师抽了我的数据集做师范,我竟然上一半跑路么有上和甜甜的小洁连麦的机会o(╥﹏╥)o
今天开始学习转录组测序的上下游分析了,艰苦地学完Linux之后感觉生活又光明了!虽然Linux的命令还不太熟悉,只能先想要做什么再从笔记里搜搜关键词,但基本上能...
碎碎念:完蛋了,虽然补完了linux的课程但是感觉linux对我来说还像新的一样,完全不知道怎么用以及有什么用,唯一能记住的东西只有自己以前在书上学过的部分,现...
anaconda:所有语言的包、依赖和环境管理器,几乎全平台(Windows、macOS、Linux)
实际容忍度很高,pattern写在左后,或者options写在pattern后面都可以
碎碎念:今天马拉松入门课程已经结课了,而我才补课到12天,呜呼!原本觉得自己R学的很好想直接跳到转录组,没有linux的基础根本听不懂,还得一步一步慢慢来。直播...
今天的内容主要是Linux入门,比R确实复杂枯燥很多╮(╯﹏╰)╭,使用的软件是Terminus,优点是可以同时完成登录服务器和ftp上传
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