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maftools--肿瘤突变数据分析最强大的工具

癌症的异质性和复杂性对于癌症的治疗研究一直是重大的限制，为了解决这一问题，就需要我们了解各个患者的肿瘤基因变异情况，通过肿瘤突变谱的研究可以显示出癌症之间的高度...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:13:40

编程算法

克隆排序和进化可视化R包：ClonEvol

进化树在生物学中，用来表示物种之间的进化关系。生物分类学家和进化论者根据各类生物间的亲缘关系的远近，把各类生物安置在有分枝的树状的图表上，简明地表示生物的进化历...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:34:09

聚类算法、其他

选择合适的回归模型，你会了吗？

回归分析常常出现于我们的科学研究中，线性回归、Logisitic回归、Possion回归、Cox回归，这些名字你一定都不陌生，我们通常采用回归分析来探索影响疾病...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:37:04

编程算法

enrichplot的作者来介绍新功能啦，您不来看看吗？

enrichplot是一个非常受欢迎的R包，在官网上每年均有数万次独立IP下载。Bioconductor上共有1905个R包，enrichplot下载量排第45...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:37:43

git、github、开源

IF14分文章——免疫浸润高阶分析喊你来学习

Comprehensive analyses of tumor immunity: implications for cancer immunotherapy

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:38:05

交互式网络可视化—visNetwork

通常是使用Cytoscape、igraph包等来可视化网络，虽然能够创建美观的网络图，但它们只是静态的。对于创建交互式网络可视化，可以使用R中的特定包—visN...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:38:46

node.js

Nature Communication：Claudin-low亚型乳腺癌的综合特征分析揭示细胞起源对肿瘤进化的影响

Claudin是细胞间紧密连接的骨架蛋白，参与维持紧密连接的各种功能，异常表达可破坏上皮细胞及内皮细胞的结构，导致其功能严重受损。Claudin-low型乳腺癌...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:40:09

gaussian、na

【经典文章】基于基质和免疫打分评估肿瘤纯度

Inferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression da...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:40:23

访问管理

enrichplot—简而美的富集结果可视化！

enrichplot实现了多种可视化方法来解释富集结果。支持从DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler (Yu et al. ...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:41:06

临床样本怎样简单生信分析？对肝细胞癌建立分子和免疫分型

Comprehensive molecular and immunological characterization of hepatocellular car...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:41:21

R包survminer画生存曲线的实用技能，你get了吗？

生存分析是指将终点事件和出现此事件所经历的时间结合起来分析的一种统计方法，研究生存现象和现象的响应时间数据及其规律，在肿瘤等疾病研究中运用广泛。在R中进行生存分...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:42:12

编程算法

去势耐药前列腺癌分型分析

The genomic landscape of metastatic castration-resistant prostate cancers reveal...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:42:39

rpc、数据分析

肿瘤免疫浸润评估资源—TIMER

目前已有各种关于免疫浸润的计算方法。我们介绍过CIBERSORT[CIBERSORT零代码分析免疫细胞浸润]，它是一种很有影响力的反褶积方法，利用带有预定义的免...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:43:38

na、time

一文掌握小提琴图的所有画法

我们平时说的小提琴图其实是箱式图与核密度图的结合，箱式图展示了分位数的位置，小提琴图则展示了任意位置的密度，小提琴图可以展示密度较高的位置。下面我们一起来看看几...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:45:11

ggplot2

499元生信分析视频+代码免费领，速来围观吧。

目前国内的新冠肺炎疫情在慢慢消退，小伙伴们是不是对回归校园充满了向往？一场新冠肺炎让好多小伙伴的“work from home”的梦想实现了，但是滋味却是五味杂...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:45:58

腾讯云开发者社区

基于网络模块预测联合用药

Network-based prediction of drug combinations

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:46:14

database

强烈安利！！绘制可自定义填充图案的统计图-patternplot

饼图、环形图、柱状图和箱式图是我们论文写作和数据统计经常要绘制的统计图，常常是使用单一的颜色填充（ggplot2大家可能都用烦了吧），小编呕心沥血终于找到一个非...

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:47:01

jpeg、png

可应用于多种癌症的预测分子特征模型

Genetic determinants of the molecular portraits of epithelial cancers

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:47:19

如何在NCBI中下载SRA数据？

假设我们现在有一个样本号“IRIS_313-11156”，想下载该样本的所有SRA数据(注意：一个样本的SRA数据可能分不同次run上机)。

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:48:15

ftp

基于甲基化评估肿瘤纯度R包-InfiniumPurify

肿瘤样本中癌细胞所占比例称为肿瘤纯度（tumor purity），是肿瘤样本的内在因素，在差异甲基化、亚克隆反卷积和亚型聚类等多种分析中具有潜在的重要影响。

作图丫 2022-03-292022-03-29 14:48:27

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个人简介

暂未填写公司和职称
生信分析；R语言统计与绘图；文章思路总结；数据库数据挖掘。
暂未填写技能专长
哈尔滨医科大学 | 生物信息
暂未填写个人网址
其他
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