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Cython是用来加速Python程序性能的一个工具,其基本使用逻辑就是将类Python代码(*.pyx扩展格式)编译成
笔者尝试过不少编程环境搭建的方案,例如常见的Ubuntu、Deepin、CentOS,也用过很多人力荐的Manjaro,这些发行版在需要办公的条件下,一般都需要...
在前面的MindSponge教程系列博客中,我们已经介绍过MindSponge分子动力学模拟框架的基础功能使用方法,例如MindSponge的安装与使用、定义分...
在传统的分子动力学模拟软件中,对于分子体系的控制,例如控制体系的相对位置亦或是绝对位置,通常都是通过施加一些约束算法来实现的。例如用于限制化学键的LINCS算法...
对于等高线,大家都是比较熟悉的,因为日常生活中遇到的山体和水面,都可以用一系列的等高线描绘出来。而等高面,顾名思义,就是在三维空间“高度一致”的曲面。当然了,在...
这里推荐一个Ubuntu 20.04下可用的本地视频播放器,VLC。可用直接打开本地视频,速度也不错,可用使用apt安装。一般顺序是先安装媒体加码器:
在MindSpore深度学习框架中,我们可以使用mindspore.grad对函数式编程的函数直接计算自动微分,也可以使用mindspore.ops.GradO...
分子动力学模拟中的控制器(Controller)可以被用于修改模拟过程中的原子坐标和原子速度等参量,从而达到控制系统特定参量的目的。例如控温器可以用于实现NVT...
统计力学是一门通过粒子的纯粹微观量来表示系统宏观量的学科,从统计分布出发,用无偏/有偏估计来研究各种不同的系综。本文内容部分参考自郑伟谋老师所著《统计力学导引》...
接上一篇文章,我们继续记录统计力学中的一些基础的概率论知识。这一篇文章主要介绍的是一些常用的概率密度函数的对应参数计算,如期望值、方差等。
在MindSpore深度学习框架中,我们可以向construct函数传输必备参数或者关键字参数,这跟普通的Python函数没有什么区别。但是对于MindSpor...
PyTorch是一个非常常用的AI框架,主要归功于其简单易用的特点,深受广大科研人员的喜爱。在前面的一篇文章中我们介绍过制作PyTorch的Singularit...
在Markdown和Latex中,如果只是写公式,不论是行内公式还是行间公式,都可以直接使用^和_这两个符号实现上下标。但有个问题是,如果只是使用公式来做上下标...
在前面的几篇博客中,我们分别介绍过Histogram算法的使用、Plumed安装与简单使用。Plumed一般就是两种用法:要么在运行分子动力学模拟的过程中实时的...
自动微分技术,在各大深度学习框架里面得到了广泛的应用。但是其实究其原理,就是一个简单的链式法则。要实现一个自动微分框架是非常容易的事情,难的是高阶的自动微分和端...
直方图是一种经常被用于统计的图形表达形式,简单来说它的功能就是用一系列的样本数据,去分析样本的分布规律。而直方图跟核密度估计(Kernel Density Es...
Tkinter是一个Python自带的GUI框架,虽然现在主流的还是用pyqt的多一些,但是Tkinter在环境配置上可以节省很多工作,可以用来做一些小项目。如...
在运行MindSpore程序时,设置device_target为GPU,结果运行时报错:
这篇文章来源于MindSpore仓库中的一个Issue,简单描述问题就是,如果你用MindSpore开发了一个python软件供别人使用,那么很有可能涉及到编译...
一个比较容易理解的概念,我们在做计算的过程中,很多时候都要做截断。不同精度的混合计算之间也会有截断,就比如一个float32单精度浮点数,符号占1位,指数占8位...
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