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文章/答案/技术大牛

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YouGet 批量下载视频，以B站为例

贴上我需要下载的地址：https://www.bilibili.com/video/av71335007

暖月寒星 2020-05-222020-05-22 16:07:56

网络安全、https、http、python

R语言实现孟德尔随机化研究

孟德尔随机化（Mendelian Randomization, MR）是近几年流行起来的用来进行因果推断的有效方法，它以遗传变异为工具变量来推导结局和暴露的因果...

一粒沙 2020-11-162020-11-16 16:43:00

emr、编程算法

实时定量PCR（RT-qPCR）实验操作流程

一. RT-qPCR 基本原理和概念实时荧光定量PCR （Quantitative Real-time PCR）是一种在DNA扩增反应中，以荧光化学物质测每次...

DoubleHelix 2019-08-152019-08-15 17:17:16

编程算法

「R」Robust Rank Aggregation 算法介绍

那么要怎么根据手上的三组数据来获得一个相对可靠的排名来进一步确定要研究的对象呢？排名整合就可以帮助处理这种问题。

王诗翔呀 2020-07-092020-07-09 15:23:44

list、null

为什么一个基因可以既是lncRNA又是protein_coding

这个 gencode.v36.annotation.gtf.gz 文件也就是不到50M，所以很快就下载完毕，然后使用下面的代码格式化：

生信技能树 2021-02-042021-02-04 11:56:35

数据库、sql、https、网络安全、linux

CIBERSORT肿瘤免疫微环境分析，一文就搞定

免疫治疗是如何工作的呢？其主要通过激活人体本身的免疫系统，依靠自身的免疫机能杀灭癌细胞。目前已在多种肿瘤如黑色素瘤，非小细胞肺癌、肾癌和前列腺癌等实体瘤的治疗中...

用户6317549 2020-04-302020-04-30 17:05:15

r 语言

MAF:Mutation Annotation Format格式简介

Mutation Annotation Format，简称MAF, 是由TCGA制定的一种文件格式，用来存储突变注释信息。在TCGA中，对于突变数据有以下四种...

生信修炼手册 2019-12-192019-12-19 10:43:45

access

如何通过js将一base64编码的图片显示在html中

今天遇到了一个小问题，如何通过js将一base64编码的图片显示在html中？写了一个小的demo.

王小婷 2019-06-142019-06-14 20:39:24

html

项目中如何对数据库和redis进行加解密处理？

由于项目的需求要求对数据的账号密码和redis的密码进行加密处理，但又不知道用什么加密的方法，有一些加密的方式很容易破解，正在苦恼的时候问了一下其他的同事只要是...

技术从心 2019-08-062019-08-06 16:45:34

maven、编程算法、jar、数据库、sql

基因共表达聚类分析及可视化

共表达基因的寻找是转录组分析的一个部分，样品多可以使用WGCNA，样品少可直接通过聚类分析如K-means、K-medoids (比K-means更稳定)或Hc...

生信宝典 2018-02-052018-02-05 16:42:32

数据分析、r 语言、互联网医疗

lncRNA数据分析传送门

step1: 计算资源的准备如果有差不多配置的服务器，就可以从SRA/FASTQ格式数据开始走全套流程。不懂配置，请看前面转录组和表观组的传送门。如果只有个...

生信技能树 2018-03-092018-03-09 10:32:11

数据分析

转录组分析的正确姿势

转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较，寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本，并进行结果可视化、功能注...

生信宝典 2018-06-262018-06-26 11:16:28

数据库、linux

可能只是一个函数，却要耗费你大半天

好像不少人问过我一个聚类后的树如何根据肉眼观察到的cluster情况来提前指定的树的子集，有点类似于WGCNA分析把几千个基因划分成若干个module后能提取各...

生信技能树 2018-07-272018-07-27 12:58:02

其他

RNA-seq(7): DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart)

接下来，我们要查看treat versus control的总体结果，并根据p-value进行重新排序。利用summary命令统计显示一共多少个genes上调和...

Y大宽 2018-09-102018-09-10 11:43:19

其他

差异共表达网络-Co-expression networks

第一步，基于每对基因间的相关性或相互信息定义每2个基因之间的个体关系。这些关系描述了所有样本中基因对表达模式之间的相似性。不同的相关性方法已经被用了构建网络，包...

Y大宽 2018-09-102018-09-10 11:45:22

其他

关键基因和hub基因（生物网络角度）

这篇文章仍然来自几篇文章及自己平时的积累，主要阐述关键基因和hub基因。很多人误以为hub基因就是关键基因，甚至有人认为差异表达基因就是关键基因。在正式看本文章...

Y大宽 2018-09-102018-09-10 11:46:13

其他

ToppGene Suite中文使用指南

2007.12：Improved human disease candidate gene prioritization using mouse phenoty...

Y大宽 2018-09-102018-09-10 11:57:36

其他

给学徒的GEO作业

看懂文章：https://www.jci.org/articles/view/96060/figure/1 看其C子图里面的TRAF4基因在4个数据集的表达量，...

生信技能树 2018-09-212018-09-21 16:32:24

http、git、ide、nat

文献翻译：Statistical Approaches for Gene Selection, Hub Gene Identification and Module Interaction in...

信息基因的选择是基因表达研究中的重要问题。基因表达数据的小样本量和大量基因特性使选择过程复杂化。此外，所选择的信息基因可以作为基因共表达网络分析的重要输入。此外...

用户1359560 2018-09-292018-09-29 17:06:57

其他

时间序列芯片数据分析极详细完整流程

写在前面：从.CEL格式原始数据下载，到最终关键基因筛选（非hub基因）和初步验证，整个流程，目录还会增加。会涉及R及众多R包（最关键的是maSigpro和WG...

Y大宽 2018-09-302018-09-30 10:41:39

数据分析、go、erp

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TA 很懒，什么都没有留下╮（╯＿╰）╭

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