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和大家分享一篇张锋团队最近发表在Nature上的研究“Programmable protein delivery with a bacterial contra...
对多种测序平台的测序数据进行差异表达基因(DEG)分析 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷 📷
免疫检查点阻断疗法(ICB)是肿瘤研究的热点,免疫检查点分子负向调控 T 淋巴细胞激活,维持机体免疫平衡,该机制被肿瘤细胞利用从而发生肿瘤免疫逃逸;ICB 可重...
在我的印象中,自2020年开始,“Spatial transcriptomics”开始成为生信这条大街上最靓的仔,一时风头无两,频频登上CNS顶刊和其旗下大子刊...
Bloom Filter 是一种有效的数据结构,可使用少量内存,在大量元素列表中进行快速查找。
confusion matrix 经常被用来表示两个类别重合的程度,比如在分类任务中,我们可以用 confusion matrix 来展示预测的 label 与...
Nature Inferring and perturbing cell fate regulomes in human brain organoids
IGV 经常被用于可视化检查 NGS 测序数据。由于它可以非常直观地展示突变信息,所以它被大量应用于肿瘤诊断行业以及 NGS 相关的科研领域中。
Automated reconstruction of whole-embryo cell lineages by learning from sparse a...
MRD 的概念最早在白血病诊疗中提出,是指白血病诱导化疗完全缓解(complete response, CR)后(或者骨髓移植治疗后),在体内残留少量白血病细胞...
医疗研究会产生大量不同类型的数据,最容易识别的是定量的数据。例如,直腿抬高 (SLR) 的受试者能够将腿抬高大于 0 度,这让我们可以计算两组的平均 SLR,并...
膀胱癌是常见的泌尿系统肿瘤,根据有无肌层浸润分为非肌层浸润膀胱癌(NIMBC)和肌层浸润膀胱癌(MIBC)。NIMBC五年生存率可达85%;MIBC五年生存率6...
鉴定合适的靶点(如基因、蛋白质、非肽基因产物和信号通路)进行表征是注释基因功能、药物发现和理解各种疾病发病机制的最关键步骤之一。TargetMine是一个综合数...
我们知道生命过程是建立在细胞时空动态调控的基础上的。比如,胚胎发育过程中,随着时间推进,细胞不断分裂、分化、成熟;其过程同时也受到空间信息的调控,比如周边细胞的...
因为课题需要,最近需要实现一个数据可视化的功能。因为ggplot2提供了扩展接口,所以就想着基于ggplot2实现这个功能。看了一些文档之后(见文末),就开始动...
小仙最近受到了一个打击,之前小仙以为自己写的教程已经比较适合入门了,初学的选手就跟着就能画出图。但是小仙却忽略了一点,粉丝们可能来自不同的行业,拥有不同的专业背...
上次给大家分享了蜜蜂图的画法,这篇文章是在上次文章的基础上进行了一些拓展。蜜蜂图基本的作图语句可以看这里 https://mp.weixin.qq.com/s/...
当小仙又打下"今天"这两个字的时候,小时候每天一篇日记的恐惧好像又回来了,过去这么久,我的文学功底果然没有一点长进!
不知不觉,距离小仙上次发文已经过去五个多月了。R语言作图系列的更新频率跟理想中的一月一次差别有点忒大了,不得不让小仙陷入深深的反思,对于时间的规划也有了一些新的...
PCA (Principal component analysis,主成分分析) 是一个经典的数据降维方法,可以将高维数据映射到低维空间中,使得低维空间中点在新...
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