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本系列合集主要用于 3D-Genome (Hi-C ) 系列的分析,主要涉及三维基因组分析中的数据处理,重复性评估,Compartment/TAD/Loop 检...
本系列[1] 将开展全新的CUT&Tag 数据处理和分析专栏。想要获取更多教程内容或者生信分析服务可以添加文末的学习交流群或客服QQ:941844452。
目前最主流的标签转移方法,也就是 Seurat 中实现的基于锚点的标签转移。它的原理不算太复杂。首先,它会把参考数据集中用过的降维方式(比如 PCA)同样应用到...
本系列合集主要用于3D-Genome(Hi-C )系列的分析,主要涉及三维基因组分析中的数据处理,重复性评估,Compartment/TAD/Loop检测,差异...
CUT&Tag 插入文库的构造,采用 Tn5 适配器和带有条形码的 PCR 引物,具体如下所示:
本系列开启 R 中scRNA-seq数据分析教程[1],持续更新,欢迎关注,转发!想要获取更多教程内容或者生信分析服务可以添加文末的学习交流群或客服QQ:941...
Tensorflow是由Google开发的一个强大的开源库,用于机器学习和深度学习任务,研究人员,开发人员和数据科学家广泛使用,以构建和培训机器学习模型。
质量检查参考:https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/bad_secorence_f...
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Transfer.txt 是一款简单、便捷且高效的命令行文件共享服务。它支持最多 10GB 的文件上传,文件会免费存储 14 天。
在真核细胞的核里,DNA 上发生的所有动态活动,比如基因表达调控,都离不开一个由核小体(包括它们的化学修饰)、转录因子和相关蛋白复合物组成的染色质环境。不同的染...
在我们之前的文章里,我们已经讲过怎么去数一个目录里文件和子目录的总数。这篇指南会教你在 Linux 系统里,把所有文件和目录的名字改成小写字母。
本系列[1] 将开展全新的转录组分析专栏,主要针对使用 DESeq2 时可能出现的问题和方法进行展开描述。想要学习更多内容可以添加文末的学习交流群或客服QQ:9...
在这个节奏飞快的时代,程序员们总是在寻找提升工作效率和简化工作流程的途径。得益于人工智能(AI)技术的飞速进步,如今程序员们有了众多 AI 辅助工具可供使用,这...
将Python编写的桌面和命令行程序发布到PyPI是一个简单直接的分发方式,PyPI上存放着成千上万的第三方程序包。这些程序包里很多都带有可以直接运行的脚本,但...
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无论你是自己组装了新电脑,还是请了最好的定制电脑制造商为你组装,接下来要做的就是如何处理你的旧电脑。当然,你可以把它卖掉或送给游戏好友,但要看你拥有它的时间有多...
除了 Harmony 和 Seurat,Evan Macosko 实验室开发的 LIGAR 也是被基准论文重点介绍的另一个数据整合工具。LIGAR 通过集成非负...
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