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3 文章6K 订阅数

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:25:37

MST3

MST3是哺乳动物STE20丝氨酸／苏氨酸蛋白激酶家族成员，1997年首次从hela细胞cDNA文库中分离出来，属于SPS1亚族，包含一个N端催化功能区和一个C...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:25:37

sf、教程

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:24:00

荧光探针分子与蛋白质的作用

通过分子对接和分子动力学模拟，验证探针分子与蛋白的作用形式和结合位置，解释荧光发光的机理。

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:24:00

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:23:39

淀粉样蛋白与探针分子作用（补充）

（应用户的要求，增加篇幅介绍上期的探针分子） Aβ淀粉样蛋白是由其前体蛋白经过分泌酶剪切而产生的多肽，其中Aβ40 和Aβ42 是主要的种类。阿尔茨海默病...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:23:39

sas

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:21:49

直播预告

不好意思最近都没有时间更新公众号了，各种的事情。先预告一下，下周一的直播，topic为常用的蛋白质靶点和分子对接口袋的设置。欢迎大家参加，谢谢。不过为了维持正...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:21:49

云直播

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:20:45

利用Chimera进行简单快速的MD

所需软件：Chimera1.11以上（免费，UCSF官网可以下），优点与AMBER无缝对接有一定的MD模拟基础，懂得一般的分子力学模拟的流程; Tools-...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:20:45

dynamic、production、sf、simulation、tools

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:20:18

如何建立膜蛋白体系的动力学模型

遥想快十年前，刚接触分子动力学方法，当时难度真是非常高，既要懂程序，又要有分子力学的基础知识。一直认为软件应为人所用而不是要求人去通过刻苦学习才掌握使用，所以软...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:20:18

其他

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:19:40

Fimh inhibitor

Fimh的络氨酸门(Tyrosin gate)在其抑制剂的活性影响重大,本文详细研究了几种Fimh蛋白和抑制剂的复合物，讨论了络氨酸门和抑制剂结构和活性之间的关...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:19:40

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:18:47

GPU加速分子模拟

电脑配置：X5650*2=24core，48G ecc+reg内存显卡：nvidia C2050*4 6GB DDR5存储器 *4 fermi架构 448个c...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:18:47

其他

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:13:50

3D-QSAR

软件：OPen3dQSAR(这个很重要，免费)，可以实现SYBYL等软件的构效关系模型建立，命令窗口形式运行，但是有教程，跟着教程操作难度不大，如果有其它软件的...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:13:50

field、model、教程、软件

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:13:24

构象搜索案例(Hyperchem)

在这里抛砖引玉，以教科书上的环己烯为例，讲述构象搜索（confromation search）的使用。其实不光Hypercherm可以，Avogadro也可以而...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:13:24

其他

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:12:56

DOCK教程

DOCK是经典的分子对接软件，很多对接软件的思路都是它的基础上发展起来的，但是无奈操作太复杂，上手的或者用来做科研的论文上少见。我也不想去写（翻译）它的教程，但...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:12:56

翻译、教程、论文、软件

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:12:30

除草剂小分子的虚拟筛选

以质体醌生物合成酶为靶点，使用VINA软件，小分子采用ZINC的数据库，300万个类药小分子。

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:12:30

数据库、软件

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:12:09

分子对接案例

brassinolide，被称为第六种植物生长激素，本案例主要考察它与BRI1受体的结合情况，研究其作用机制。采用Leadit软件，对接了19种衍生物。

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:12:09

软件

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同源建模

背景：通过实验对比了几种糖苷类化合物在葡萄糖苷酶的水解速率，希望通过计算机解释其水解机理。但是RCSB数据库中只有少量几种beta葡萄糖苷酶的晶体数据，不包含...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:11:51

其他

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:11:29

分子对接

细胞色素P450(Cytochrome,CYP450)是一类以还原态与CO结合后在450nm处具有最高吸收峰的含血红素的单链蛋白质。有业务需求的，请联系微信号...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:11:29

com、gmail

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:11:10

MD，分子动力学

有计算需求的，请联系客服微信号wbf3ng或邮箱wbf3ng@gmail.com

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:11:10

com、gmail

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:10:47

Molecular docking study of antibody-ligand complex

抗体与抗原的之间存在着特异性的识别机制，但是抗原与抗体的结合区域通常是柔性最大的loop区域。图上黄色的表示是抗体的beta-sheet，绿色表示loop区域，...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:10:47

alpha

发表了文章 2018-07-032018-07-03 15:10:16

Human Hemoglobin

血红蛋白是高等生物体内负责运载氧的一种蛋白质。也是红细胞中唯一一种非膜蛋白。人体内的血红蛋白由四个亚基构成，分别为两个α亚基和两个β亚基，在与人体环境相似的电解...

用户2493118 2018-07-032018-07-03 15:10:16

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