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library(data.table) library(org.Hs.eg.db) library(clusterProfiler) setwd("examp...
手机已经具有白天切换白天的壁纸，晚上切换晚上的壁纸的功能，这时候我可以做到白天工作一种心情，晚上休息一种心情。但是苦于电脑一直没有这种功能，于是用vb写...
前面已经依序安装了meerkat 的环境和meerkat，运行了预处理一步，在相对应的bam文件目录下生成了大批文件，因此，当要用meerkat处理某个...
meerkat 0.189版本和以前的版本相比，支持bwa mem 输出的bam文件，还支持全外显子数据count SV。
R语言data.table包是自带包data.frame的升级版，用于数据框格式数据的处理，最大的特点快。包括两个方面，一方面是写的快，代码简洁，只要...
sed 传入变量： 1 chrI="chr2";sed -n "/$chrI/p" clippointpos.csv #变量用$var表示，把sed的单引号...
R语言data.table包是自带包data.frame的升级版，用于数据框格式数据的处理，最大的特点快。包括两个方面，一方面是写的快，代码简洁，只要一...
SNP是单核苷酸多态性，人的基因是相似的，有些位点上存在差异，这种某个位点的核苷酸差异就做单核苷酸多态性，它影响着生物的性状，影响着对某些疾病的易感性。S...
处理基因组数据，很多时候我们会觉得直接看序列文件不够直观，如果绘图的话，把n多G把数据用画图出来不仅费劲，就算操作也不方便。因此我们可以用UCSC开发出的gen...
#include <iostream> using std::cin; using std::cout; using std::endl; using std:...
使用Rcurl包可以方便的向服务器发出请求，捕获URI，get 和 post 表单。比R socktet连接要提供更高水平的交互，并且支持 FTP/FTPS/...
参照百度的方法，使用同步助手。安装同步助手--连接手机（安卓苹果均可)--点击“其他功能“--点击微信图标即可进入聊天记录导出界面（非常简单）。
对于不同的分布，有特定的偏度(skewness)和峰度(kurtosis)，正态分布、均匀分布、逻辑斯谛分布、指数分布的偏度和峰度都是特定的值，...
75.0 64.0 47.4 66.9 62.2 62.2 58.7 66.6 64.0 57.0 69.0 56.9 50.0 72.0 63...
文章对已知的多种细胞系混合后进行单细胞10X RNA测序，研究多克隆之间的互作模式。我们这里介绍里面的单细胞测序基因表达细胞分类操作。不过文章选用的是已知固有S...
因为使用conda下载数据有时候因为网络问题下载非常慢，因此我把conda的环境备份好，到时可以直接使用conda的conda create -n 新环境名字 ...
Sushi包能绘制多种常见的基因组格式的图，包括bed, bedpe, bedgraph,Hic矩阵，也能绘制Manhattan图,基因结构图。
在Linux下直接用pip install packageName，有些文件会被放到根目录下，如果没有sudo权限的话，是会安装失败的。这个以后我们就需要指定安...
Logistic回归虽然名字叫”回归” ，但却是一种分类学习方法。使用场景大概有两个：第一用来预测，第二寻找因变量的影响因素。
比如想下载hg19_gwava数据，那么需要下载原始txt数据和idx文件，路径如下
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