用户11414625

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发表了文章 7小时前2025-03-13 21:25:59

百万级别的单细胞数据是怎样完成注释的(R)

细胞数量太大时，单纯的一次降维聚类分群是无法搞定的，所以需要二次分群然后把注释的结果重新放回原来的对象中。

用户11414625 7小时前2025-03-13 21:26:00

基础、数据、表格、对象、函数

发表了文章 1天前2025-03-12 21:31:10

用qs替代RData：加速大型单细胞对象存储的终极方案

Rdata是R语言原生的保存变量的格式，用save保存，load加载，无需赋值，支持保存多个对象。

用户11414625 1天前2025-03-12 21:31:10

对象、数据、对象存储、大数据、测试

发表了文章 3天前2025-03-10 20:50:24

生信学习者专属的R包安装终极指南

CRAN（Comprehensive R Archive Network）是R语言的官方网站，管理着20000+个R包，各种用途的都有。

用户11414625 3天前2025-03-10 20:50:24

数据、网络、https、镜像、配置

发表了文章 7天前2025-03-06 21:57:59

小小配置一下，装github的R包畅通无阻

我写技术帖有一种曲高和寡的感觉，上次写了一个花我四个小时才解决的问题，阅读量 190 哈哈哈，4小时欸，怎么也得值个千儿八百的吧~~~幸好我也就记录一下，不指着...

用户11414625 7天前2025-03-06 21:57:59

发表了文章 7天前2025-03-06 21:57:02

百万级别的单细胞数据是怎样完成注释的(python)

adata.h5ad中存储的是已经初次注释好的对象adata。其中self_annotation列是细胞类型注释。

用户11414625 7天前2025-03-06 21:57:02

python、存储、self、对象、数据

发表了文章 13天前2025-02-28 15:58:21

震惊！自己电脑上的文件竟然没有权限打开

当我们企图在windows电脑上的linux部分(也就是ubuntu子系统)，双击/home/bio02这个文件夹，报错，无法打开。

用户11414625 13天前2025-02-28 15:58:21

服务器、权限、微信、安全、登录

发表了文章 16天前2025-02-25 09:03:56

不只是人类！340+物种的转录组表达矩阵Ensembl ID转换为symbol

转录组数据，我们能拿到的表达矩阵通常是以Ensembl ID 为行名的，一长串，格式是ENS...。

用户11414625 16天前2025-02-25 09:03:57

网站、翻译、函数、数据

发表了文章 16天前2025-02-25 09:03:12

0配置，全免费，腾讯递来一只满血版deepseek

✅ 服务稳定性保障，不会’服务器繁忙‘ ✅ 不需要自行配置，手机和电脑端都能用 ✅ 真的是免费的

用户11414625 16天前2025-02-25 09:03:12

数据、腾讯、DeepSeek、配置、手机

发表了文章 16天前2025-02-25 09:01:41

生信学习者专属的C盘瘦身终极指南--怒省50GB+

我现在的教学需要用到R语言和ubuntu子系统，经常有同学反馈C盘空间不够用的问题。今天在广州出差，刚好带了工作电脑，C盘空间仅有200G，适合拿来测试一下我收...

用户11414625 16天前2025-02-25 09:01:41

工具、管理、搜索、存储、微信

发表了文章 16天前2025-02-25 09:00:50

「踩坑实录」一个让我调试4小时的 dolomite-base 安装问题

这个包是celldex的依赖项，而celldex则是singler的配套参考数据包。所以我们安装celldex就会自动安装他。

用户11414625 16天前2025-02-25 09:00:50

pip、python3、编译、调试、build

发表了文章 2025-02-032025-02-03 14:29:16

真诚是永远的必杀技，带圈的UMAP图谁能不迷

输入数据是一个注释好的adata对象，示例数据请在公众号聊天窗口回复‘adata1030’

用户11414625 2025-02-032025-02-03 14:29:16

self、对象、公众号、数据、cell

发表了文章 2025-02-032025-02-03 14:28:30

Meta cell：拯救你那跑不动的单细胞大数据

现在的单细胞数据动辄十几万甚至几十万的细胞数量，对于没有服务器，用自己电脑进行分析的同学来说实在是很不友好。Meta cell算法是将相似的单细胞合并，减少细胞...

用户11414625 2025-02-032025-02-03 14:28:30

cell、meta、函数、数据、大数据

发表了文章 2024-12-272024-12-27 16:56:17

人和小鼠的基因怎么无缝切换？

今天给生信入门班和数据挖掘班的往期学员提供直播答疑遇到了一个好问题，给大家分享下。

用户11414625 2024-12-272024-12-27 16:56:17

对象、函数、技巧、入门、数据

发表了文章 2024-12-232024-12-23 13:54:31

Python & R 数据框操作详细对比

DataFrame不是原生的，而是由pandas提供，接受字典，每列是一个键值对的格式。

用户11414625 2024-12-232024-12-23 13:54:31

数据、统计、python、连接、排序

发表了文章 2024-12-202024-12-20 16:53:31

Python & R 控制流大比拼！建议收藏！

每种编程语言里都有条件语句和循环语句，今天把R和python的放到一起打打架！没办法现在就是这么卷，学不了两个也得学一个吧~

用户11414625 2024-12-202024-12-20 16:53:31

正则表达式、编程语言、函数、量化、python

发表了文章 2024-12-202024-12-20 16:51:26

Python & R 数据结构排序方法大全！建议收藏！

Hi~今天给大家带来Python和R两种语言中各种数据结构的排序方法。这两种语言都是一手一个的必备工具，虽然AI如此发达，但基本功还是要有，掌握它们的排序技巧可...

用户11414625 2024-12-202024-12-20 16:51:26

数据、python、数据结构、函数、排序

发表了文章 2024-12-202024-12-20 16:50:57

一个列表赋值的坑，让我懂了Python的对象机制

一个诡异的现象揭秘背后的原理Python对象的分两类1. 可变对象（Mutable）2. 不可变对象（Immutable）3.关键区别如何创建真正的副本？1. ...

用户11414625 2024-12-202024-12-20 16:50:57

python、数据结构、变量、对象、原理

发表了文章 2024-12-202024-12-20 16:48:54

python版的singler单细胞注释工具

网上可以搜到大量的R语言singleR的代码和教程，但python版的就比较少啦，恭喜你找到了我。

用户11414625 2024-12-202024-12-20 16:48:54

工具、数据、网络、python、data

发表了文章 2024-12-202024-12-20 16:47:55

gseapy-python版的富集分析

富集分析分为超几何分布检验（ORA）和基因集富集分析（GSEA）。R语言有clusterprofiler包可以做富集，python是用gseapy。这个包功能强...

用户11414625 2024-12-202024-12-20 16:47:55

python、集合、可视化、排序、数据

发表了文章 2024-12-202024-12-20 16:47:13

多样本数据的自动注释-harmony和celltypist

如上所见，工作目录下的04_data文件夹下有3个子文件夹，每个文件夹里是3个标准文件

用户11414625 2024-12-202024-12-20 16:47:13

数据、data、import、iteration、var

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