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数据处理是日常科研工作中很重要的一部分,这里就会涉及到统计学知识。但说真的,统计是一个难倒了很多人的学科,科研本身就是个被动掉头发的事情,遇到了统计之后,很多人...
美图神器ggstatsplot-专为学术论文而生 在CRAN(comprehensive R Achive Netwokrk)中已有13000多个R包了 简单讲...
RNA也分为很多种了,像miRNA、mRNA、lncRNA、circRNA等,前面也有蛮多的文章介绍过了,咱们今天主要介绍mRNA的研究路线。
在circBase(http://www.circbase.org/cgi-bin/listsearch.cgi)中,我们可以通过circRNA名称(hsa_c...
2016 年,韩春雨作为通讯作者在《自然 – 生物技术》Nature Biotechnology 发表文章报道了一种新型的基因编辑技术,随后由于多个实验室未能重...
最近发现了一个专门收集整理了肿瘤转移数据的数据库工具——HCMDB,网址:http://hcmdb.i-sanger.com/index。该工具由华东师范大学的...
此次例子,我们选择了一套GEO数据库的肺癌数据,数据编号为GSE19804,120个样本,其中包含60个癌症样本和60个癌旁正常样本,前面我们使用t检验,并对p...
过去生物学家一次研究单个基因,而现在我们可以使用高通量技术同时分析成千上万个基因。高通量技术的本质要求生物信息学工具专注于基因集而不是单个基因,例如,微阵列和蛋...
今天给大家介绍一个闻着伤心听着落泪的网站,分析TCGA数据的工具这么多,我只服这一个,让人不得不感叹,做肿瘤真好!
RNA及其相关互作广泛参与多种生理及病理过程,是生命活动的重要参与者。近年来随着生物技术的快速发展和不断进步,广泛开展的各种类型RNA相关互作研究迅速产出海量数...
笔者认为,这些功能的好处在于能够比较方便的用简单几行代码做一些固定的分析,恰恰这也是它的缺点,这样的话包的灵活性就大打折扣了,不能够很好的整合用户的其它分析流程...
经常有小伙伴跟我抱怨,没时间没精力去学代码,太复杂了。当然也有些小伙伴确实打起精神开始学,从网上搜了一大堆R语言资料,和生物信息学资料,甚至还买了本R语言实战的...
还记得我们在系列2开始的时候为大家介绍的几个特别的函数吗,rnorm(),dnorm()…?如果你忘记了,详情点击:R语言系列第二期:②R编程、函数、数据输入等...
谈起TCGA分析工具,我知道你肯定要说什么 GEPIA,cbioportal……, 但是 TCGA甲基化呢? 这些碉堡的神器瞬间就黯然失色了吧,数风流神器,还看...
TCGA数据库目前是科研中最常用的数据库之一,其中储存着多种疾病的各组学的数据,借助该数据库,帮助了很多研究生们发表了自己的文章,达到了毕业条件。但是,如果你是...
大家好,我是白介素2同学,想必小伙伴们早已开工了,白介素同学这个春节实在是没怎么学习呀(所谓人在江湖,身不由己,容我甩个锅),惭愧惭愧,悟已往之不谏,知来者之可...
这里分享一篇利用数据挖掘+实验的文章,这篇文章发表在BMC Cancer上,IF为3.28。
该杂志偏重收录以下研究方向:肿瘤、分子生物学、细胞生物学、基金、蛋白、信号、代谢、免疫等。
单细胞测序技术是当下的一个热点,发了不少大文章,逐渐成为 CNS 的标配了。目前,单细胞测序相对来讲还是属于比较昂贵的技术,没钱做不起怎么办?
文献检索是科研的基本功。传统检索文献的方法大多以关键词、主题词、作者、期刊名称等为线索,查找符合要求的文章。然而,这种检索方法忽略了科技论文的精髓–插图。在查阅...
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