之前介绍了使用 Graphpad Prism 8 绘制小提琴图,今天介绍Origin 绘制小提琴图。注意软件版本至少为Origin2018版本,新版本如 Origin 2019 更好。
一、常规小提琴图
第一步,导入数据。
还是使用之前推送所用的数据。
2、选中数据,选择输出小提琴图类型。
3、图形调整。
类型1:Violin Plot。
(1)双击图中小提琴图,修改参数(各参数意义见下一步)。
(2)修改参数、修改后的结果如图所示。
类型2:Violin with box。
Group菜单栏下的各参数选择如下:
类型3:Violin with point。
Group菜单栏下的各参数中符号类型、符号颜色、符号填充颜色、分布填充选择逐个,其他保持默认格式即可。
类型4:Violin with Quantile。
分布填充选择逐个,其他默认。
其它比较重要的属性,如线条、箱体等根据需要设置。
类型5:Violin with Stick。
类型6:Half Violin。
二、分边小提琴绘制
1、数据设置。
用于绘制分边小提琴图的数据最后一列必须是组别,否则不能准确绘制分边小提琴图。如图中红框所示。
2、绘制分边小提琴图。
3、设置图形参数。
1.Origin的分边小提琴图的默认参数可见下图。
2.点击Distribution/分布 按钮下面的相关按键进行填充颜色、线条颜色、线型等修改即可。
在 Distribution 选项下,可选择密度曲线类型(Curve Type),如这里将默认的Kernel Smooth改为Normal,图形就变得“圆滑”了。
在该窗口也可改变Fill的颜色,可选择已有的配色方案,比如这里选Q01。
如果对Q01的颜色不满意,还可点右侧的,自定义颜色列表,如下图。
你也可以选中图例,右键,调整图例中的图形和文字。
3.通常只使用两种颜色进行区分,否则容易失去分边意义。
对比之下,还是 Graphpad Prism 8 绘制小提琴更方便快捷,默认的配色也更好看。自定义方面功能也更强大,外观、线条、颜色之类的设置,基本在一个页面就设置好了。Graphpad Prism 8 也可以在图中同时有中位数、四分线、数据点等元素,而Origin基本只能选择其中某一种。
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