作物遗传资源表型信息系统建模

本研究描述了支持多站点田间表型数据采集的Web接口综合数据和对象模型，这些数据和对象模型是多年来在欧洲植物遗传资源合作计划中为中央作物数据库所开发的，可作为表型信息系统的研究方案，植物表型资讯介绍如下：

表型信息的记录是生物多样性、作物建模、育种、生态学和进化研究、关联研究、基因发现、回顾性统计分析和数据挖掘、QTL重定位、选择品种和计划杂交等领域的优先需求。目前，缺乏获取表型信息的技术是植物遗传资源利用的限制因素之一。表型数据十分复杂，收集这些数据的背景信息也是不可或缺的。本研究描述了支持多站点田间表型数据采集的Web接口综合数据和对象模型，这些数据和对象模型是多年来在欧洲植物遗传资源合作计划中为中央作物数据库所开发的，可作为表型信息系统的研究方案。

作为原始或聚集数据的表型观察

作者假设实体关系和对软件开发有用的对象模型可以描绘领域专业知识，类似于领域本体，并在建模水平上讨论了科学信息系统。从统计分析、元分析和知识发现的信息需求出发，考虑了包括作物本体在内的几种标准化和建模方法来讨论模型。遵循面向对象的建模方法，本文将数据和对象模型紧密地联系在一起并与领域概念保持一致。如此一来，领域专家将会更好地理解和使用数据库和软件，并支持在各种专业领域之间共享软件的模块化使用。

性状方法论的背景数据

类和实体表示具有自然分配给它们的属性领域概念，通常用于评估植物遗传资源和植物育种的田间试验。表型观察可以作为原始数据或聚合数据列出，与描述实验处理和农业干预的解释元数据、观察特征和观察方法、实地计划和地块设计以及作为地理实体的实验地点相关联。根据明确定义的类型，可以更好地识别到其他领域（例如地理信息系统）中信息系统的潜在链接。此工作流程显示为Web应用程序，可用于生成田间计划、现场工作簿、模板、上传电子表格数据和图像。

图片上传流程图及截图

来源：

Germeier C U. and Unger S, Modelling Crop Genetic Resources Phenotyping Information Systems, Front. Plant Sci. | doi: 10.3389/fpls.2019.00728