本文经AI新媒体量子位(公众号ID:QbitAI)授权转载,转载请联系出处。
“CNN已老,GNN当立!”
当科学家们发现,图神经网络 (GNN) 能搞定传统CNN处理不了的非欧数据,从前深度学习解不开的许多问题都找到了钥匙。
如今,有个图网络PyTorch库,已在GitHub摘下2000多星,还被CNN的爸爸Yann LeCun翻了牌:
它叫PyTorch Geometric,简称PyG,聚集了26项图网络研究的代码实现。
这个库还很快,比起前辈DGL图网络库,PyG最高可以达到它的15倍速度。
要跑结构不规则的数据,就用PyG吧。不管是图形 (Graphs),点云 (Point Clouds) 还是流形(Manifolds) 。
△ 右边是不规则的,非欧空间
这是一个丰盛的库:许多模型的PyTorch实现,各种有用的转换 (Transforms) ,以及大量常见的benchmark数据集,应有尽有。
说到实现,包括Kipf等人的图卷积网络 (GCN) 和Bengio实验室的图注意力网络 (GAT) 在内,2017-2019年各大顶会的 (至少) 26项图网络研究,这里都能找到快速实现。
到底能多快?PyG的两位作者用英伟达GTX 1080Ti做了实验。
对手DGL,也是图网络库:
在四个数据集里,PyG全部比DGL跑得快。最悬殊的一场比赛,是在Cora数据集上运行GAT模型:跑200个epoch,对手耗时33.4秒,PyG只要2.2秒,相当于对方速度的15倍。
每个算法的实现,都支持了CPU计算和GPU计算。
库的作者,是两位德国少年,来自多特蒙德工业大学。
△ 其中一位
他们说,有了PyG,做起图网络就像一阵微风。
你看,实现一个边缘卷积层 (Edge Convolution Layer) 只要这样而已:
1import torch 2from torch.nn import Sequential as Seq, Linear as Lin, ReLU 3from torch_geometric.nn import MessagePassing 4 5class EdgeConv(MessagePassing): 6 def __init__(self, F_in, F_out): 7 super(EdgeConv, self).__init__() 8 self.mlp = Seq(Lin(2 * F_in, F_out), ReLU(), Lin(F_out, F_out)) 9 10 def forward(self, x, edge_index): 11 # x has shape [N, F_in] 12 # edge_index has shape [2, E] 13 return self.propagate(aggr='max', edge_index=edge_index, x=x) # shape [N, F_out] 14 15 def message(self, x_i, x_j): 16 # x_i has shape [E, F_in] 17 # x_j has shape [E, F_in] 18 edge_features = torch.cat([x_i, x_j - x_i], dim=1) # shape [E, 2 * F_in] 19 return self.mlp(edge_features) # shape [E, F_out]
安装之前确认一下,至少要有PyTorch 1.0.0;再确认一下cuda/bin在$PATH里,cuda/include在$CPATH里:
1$ python -c "import torch; print(torch.__version__)" 2>>> 1.0.0 3 4$ echo $PATH 5>>> /usr/local/cuda/bin:... 6 7$ echo $CPATH 8>>> /usr/local/cuda/include:...
然后,就开始各种pip install吧。
PyG项目传送门:
https://github.com/rusty1s/pytorch_geometric
PyG主页传送门:
https://rusty1s.github.io/pytorch_geometric/build/html/index.html
PyG论文传送门:
https://arxiv.org/pdf/1903.02428.pdf
领取专属 10元无门槛券
私享最新 技术干货