星球上有个童鞋问我,
老板就给了她一个miRNA和疾病的方向,
让她自己考虑下一步要怎么办?你们真的是我带过最差的一届万事屋读者了
,这以前都教过你们的啊……
唉,这个吧,实际上可以利用思维导图,给你们把整个思路理清楚。当然,我们在发散性思维的过程中,
可以暂时不考虑逻辑的严谨性,因为逻辑是要在课题开展后,
通过假设——以及假设的迭代进行一步步调整的。
那夏老师带你们看看,我们现在有些什么吧?差不多就是这些吧:
第一步,就是要把miRNA和疾病首先联系起来:
那要怎么才能使得miRNA和疾病联系起来呢?首先是表达的相关性:
miRNA和疾病之间,只有当miRNA的表达与疾病相关,才有可能将两者首先联系起来。那表达相关性要从哪里来呢,这个其实也不难吧,芯片、qPCR、数据库,
甚至是文献中的。
如果有相关性,那下一步就要进行验证了,使用柯霍氏法则,来进行表型的验证。
分析完表型,那下一步,我们可以进一步思考一下,与miRNA差异表达相关的其他基因了:
与miRNA相关的基因,可以分为上游和下游两部分,首先是下游吧,下游就是所谓的靶基因
:
通过数据库分析,蛋白表达检测和Luciferase实验,就能进行分析了。那miRNA的上游基因呢?上游就是调控miRNA表达的,与miRNA相关的启动子有关联的转录因子
或者与miRNA表达有相关性的信号通路也可以挖掘一下:
这样一看,其实你老板给你的东西还挺多的呢……不是么?
只要沉下心来,
仔细想想看,就会发现,即使只给你一个基因和一个疾病,也能有很多事情可以做。好了,夏老师就带你们思考到这儿,想要这个miRNA的思维导图的话,就回复“公克”(不要再在评论区回复了),今天就先策到这里吧,祝你们心明
眼亮。
领取专属 10元无门槛券
私享最新 技术干货