10月14日,我们曾经介绍过一个实时定量PCR的内参基因知识库。
文章链接如下:
今天,补充一个引物数据库:
定量PCR引物数据库qPrimerDB
论文题目:
qPrimerDB: a thermodynamics-based gene-specific qPCR primer database for 147 organisms
发表期刊:Nucleic Acids Research
数据库网址:
http://biodb.swu.edu.cn/qprimerdb/
研究团队:西南大学农学与生物科技学院李加纳教授团队
147个物种,5100+万引物
该数据库包含人、小鼠、家蚕、斑马鱼、线虫、酵母、拟南芥、水稻、玉米和油菜等147个物种的全基因组qPCR引物设计和验证分析,包含80种动物(37种哺乳动物、17种昆虫、10种鱼类、4种鸟类和12种其他动物)、66种植物(39种双子叶植物、18种单子叶植物和9种其他植物)和1种真菌(酵母)。
基于这些数据,构建了qPrimerDB数据库,收录了147个物种共3331426个基因的51091785对qPCR引物,提供了查询、批量下载和BLAST比对等工具,并定期更新。
/End.
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