随着医学技术的进步,人类对自身遗传信息的了解逐步加深,这些遗传信息对人类健康的影响已被广为接受,同时人类对各种重大疾病的研究不断取得突破性进展。
由广西医科大学完成的 “利用多中心数据整合分析研究复杂疾病的遗传信息与应用”项目,利用海量多中心生物数据,开发系统的生物信息学分析程序、算法软件及数据库,为复杂疾病遗传信息的挖掘提供重要方法与工具,同时结合分子实验找到了复杂疾病的重要靶点及通路。
首先,项目通过网络拟合表型间的相关性,利用Lasso的惩罚系数的趋零处理等进行基因组多区域与多性状联合分析。其次,通过基因富集及整合分析基因表达谱数据,找到前列腺癌和肾癌的重要通路;发现miR-182、miR-200c和miR-221能有效联合诊断前列腺 癌 发 生 ; 利 用 中 国 前 列 腺 癌 协 作 组(ChinaPCa) 的GWAS数据联合分析发现多个位点与前列腺癌发生有关,同时发现RTK/ERK信号通路上4个基因和5个位点与前列腺癌发生有关。再次,基于Boolean网络模型和文本挖掘分析基因调控网络,构建初步的调控网络,并计算出调控网络的多条稳定状态和每个节点的表达模式,聚类分析发现所有稳定状态明显分成2类。最后,基于疾病组联合分析多套已进行HNF1b干扰的表达芯片,找到前列腺癌中与 HNF1b 的互作基因,实验验证HNF1b与雄激素受体等有互作关系。
该项目构建了全面的生物医学相关数据库查询系统,可对医学相关分类目录查询数据库信息。目前,该项目已为广西疾病预防控制中心等4家单位的数据挖掘与分析提供重要方法软件,提高了我国复杂疾病的防治水平,具有良好的社会效益。
2017 年度广西科学技术奖
科学技术进步奖二等奖
项目名称:利用多中心数据整合分析研究复杂疾病的遗传信息与应用
主要完成单位:广西医科大学
主要完成人员:胡艳玲、陈阳、(第三位完成人员空缺)、李健玲、李柳铭、莫曾南、周青鸟、黄远洁、李天宇
推荐专家:广西壮族自治区教育厅
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