Gaussian view使用简介
GaussView 是专为 Gaussian 用户开发,帮助建立输入文件和查看输出结果而设计的图形用户界面程序 GaussView 并没有与 Gaussian 的计算模块整合,而是作为 Gaussian 使用的前端和后台使用的辅助工具,是独立模块 GaussView Gaussian 用户在以下三个方面提供帮助。
(1)通过 GaussView 的可视化工具,快速绘制大分子模型图,然后对这些分子进行简单的旋转、平移或缩放操作,输出像 PDB 这类标准格式的文件。
(2) 通过 GaussView 可以方便地建立各类高斯计算的输入文件。为 些常规计算任务,以及像 ONIOM 这类高级方法的使用 QST2 QST3过渡态结构优化 CASSCF 算、周期边界条件 (PBC) 的计算以及更多复杂计算的输入文件的编写提供了十分简便的方法 使用GaussView 能在装有 Gaussian 的同一台计算机上运行 Gaussian 任务,同时还可定义默认设,命名计算模板以加速计算处理速度。
(3) 通过 GaussView 的图形显示技术,按以下图形方式查看 Gaussian 的计算结果:①优化后的分子结构和分子轨道; ②来自密度计算 的电子密度表面;③静 电势能表面 (EPS) ;④磁性质表面;⑤性质等高线; 原子电荷与偶极矩; 应振动频率的简正振动动画; ⑧红外、拉曼 核磁共振及其他光谱(I Raman MR VCD) ⑨分子的立体化学信息;⑩几何优化的动画、 IRC 反应路径 势能面扫描 ADMP BOMD 轨迹 两变量势能扫描三维图 ;⑩总能量图 (Plots of the Total Energy)本章内容作为 GaussView 的人门指导,首先介绍如何在 GaussView 创建分子模型(分子与分子集合) ,然后介绍如何采用 GaussView 编制 Gaussian 输入文件,最后介绍如何从Gaussian 计算的输出文件查看输出结果,包括各类图形与光谱图的输出。
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