有时候有一些蛋白是对称单元组成的,如铁蛋白,但是晶体结构pdb坐标只有一部分,另外一部分写在信息里,我们如果想看全部或者需要全部的pdb坐标,可以使用如下方法实现:
Assembly
该功能需要PyMOL 1.8以上
设置对称单元,如下:
BiologicalUnit/Quat
该方法可以重构pdb的另外一边
python代码
使用方法非常简单:
以下是前后的区别:前
后:
参考资料:PyMOLwiki: BiologicalUnit
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