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平台教程丨量化计算(ORCA 4.2)使用指南

前言

Introduction_

ORCA 4.2是一款强大的计算工具,能够处理从分子能量计算到光谱模拟等多种任务。本指南将为您提供详细的操作步骤,帮助您快速上手ORCA 4.2,确保计算任务的顺利执行。

请确保您已准备好分子结构文件,接下来,我们将一起探索如何高效使用ORCA 4.2程序。

01ORCA 4.2概述

ORCA 4.2是一个先进的量子化学计算程序,它能够执行多种计算任务,包括计算分子的单点能、进行几何结构优化、预测分子的振动频率,以及模拟电子圆二色谱(ECD)和紫外光谱(UV)、核磁共振(NMR)、红外(IR)和拉曼光谱。

02操作步骤

1

进入【量化计算(ORCA 4.2)】

2

上传分子结构文件

上传具有良好3D结构的分子文件,支持mol、mol2、pdb、sdf和sd格式。

3

设置净电荷、自旋多重度和选择溶剂模型

在进行量子化学计算时,需要为所有分子统一设置净电荷、自旋多重度和溶剂模型这三个参数,因为它们对所有分子都同样适用。

上传进行计算的分子结构必须具有相同的电荷和自旋多重度,如果分子的性质不同,比如电荷或自旋状态不同,或者需要考虑不同的溶剂效应,那么应该分别为这些分子建立独立的计算任务。

自旋多重度等于单电子数加1,对于大多数有机化合物来说,由于它们通常是闭壳层结构,自旋多重度为1,但在自由基、三线态氧和激发态等特殊情况下,自旋多重度会大于1。

溶剂模型是一个预设项,只有当指定了具体的溶剂时,计算中才会考虑溶剂效应

4

设置计算步骤

添加计算步骤,并为每个步骤选择相应的作业类型、理论水平和溶剂环境。

这些步骤将按照从上到下的顺序依次执行,并且所有的计算结果会被保存在同一个文件中,方便您进行查看和分析。

如果您在溶剂选项中留空,那么计算将在气相环境中进行,即不考虑溶剂效应。

3

添加高级配置

对于某些特定的计算任务,如ECD/UV和Raman光谱计算,除了基本的净电荷、自旋多重度和溶剂模型设置外,还需要进行额外的配置。您可以通过点击“高级配置”栏的【添加】按钮,在弹出的对话框中根据提示进行设置。

例如,在进行ECD/UV计算时,需要选择激发态的数目,这会影响图谱覆盖的波长范围和计算所需的时间,数目越多,覆盖范围越广,计算量也越大,软件默认设置为30个激发态

同样,在进行Raman光谱计算时,需要指定入射光的波长,如532 nm,如果需要使用其他波长,平台提供了选择或填写的功能

3

点击【确认】,提交任务

03关于付费

1

当您的可用余额低于100元时,需要充值后才能提交任务

本计算服务采用后付费模式,即您在使用服务后,根据每个分子的实际计算时间来支付费用,因此可先计算一个构象分子的费用,并通过用户中心的费用账单查看实际费用,以此估算需要计算的构象分子总数和预计的总费用。

2

若充值后的余额大于实际费用,可在计算完成后,通过用户中心的提现管理退回余额

3

若充值后的余额小于实际费用,系统会发出欠费通知

为防止因欠费导致正在进行的计算任务被终止,请在欠费超出延停额度前及时充值。您可以通过用户中心首页查看当前的延停额度。及时充值不仅能避免任务中断,还能确保计算过程的连续性。

默认的通知方式是短信,但您也可以通过消息提醒设置其他通知方式,以便及时收到余额预警和欠费通知。

  • 发表于:
  • 原文链接https://page.om.qq.com/page/O8TSqC7DAFxk4QY5Ly0u5rtA0
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