先前的研究表明,不同人类生活环境的微生物群落之间存在差异,甚至同一室内环境的不同元素之间也存在微生物群落的差异,如门把手、牙刷和淋浴喷头作为家庭环境中的元素,具有不同但经常交叉的类群。对建筑环境微生物群的研究主要集中在细菌成员或非细菌病原体上,尽管病毒很重要,但对病毒在建筑环境中所扮演的角色的研究却非常有限。
在西北大学牵头的一项新研究中,微生物学家发现淋浴喷头和牙刷上充满了种类极其丰富的病毒,其中大多数都是被首次发现。但好消息是这些病毒并不以人类为目标,而是以细菌为目标,这些进攻细菌的病毒通常被称为“噬菌体”,它们会钻到细菌体内进行复制和繁殖,最终杀死细菌。
本研究使用宏基因组测序技术评估了96个淋浴喷头样本和34个牙刷样本,利用为病毒组研究设计的生物信息管道确定了这些环境中的噬菌体,研究了它们与细菌群落的联系,并描述了它们在塑造它们的视角微生物组以及影响与这些环境相互作用的人类的健康方面发挥的潜在作用。
与淋浴头样本相比,牙刷样本的宏基因组覆盖率较低,宏基因组序列多样性的上界和范围较高,表明牙刷样本的微生物群落更多样化。
考虑到淋浴喷头和牙刷都以自来水作为微生物群落的输入途径,因此研究人员预计二者的群落组成会有一些重叠。他们比较了两种样本类型中排名最高的细菌类群的相对丰度和排名最高的病毒类群的归一化丰度,这些样本总共包含614种不同的病毒,而且没有任何重复。淋浴喷头和牙刷之间的病毒类型也基本没有重叠,而且任何两个样本之间几乎没有重叠。每个淋浴喷头和每个牙刷就像是孤立存在小岛,这凸显了病毒惊人的多样性。
虽然在样本中没有发现病毒分布的规律,但团队确实注意到分枝杆菌噬菌体比其他类型的噬菌体更多,这是一种感染细菌并在细菌内部复制的病毒。尽管研究人员对它们知之甚少,但噬菌体最近因其在治疗抗生素耐药性细菌感染方面的潜在用途而受到关注,因此,也许潜伏在我们浴室中的以前未知的病毒可能会成为探索这些应用的材料宝库。
西北大学麦考密克工程学院土木与环境工程副教授Erica M. Hartmann 领导了这项研究,他表示在这项研究中他们发现了许多之前知之甚少的病毒,以及许多其他以前从未见过的病毒:“我们周围有这么多未开发的生物多样性确实令人非常惊讶。我们甚至不必走很远就能找到它,因为它就在我们的眼皮底下。”
但是,大家也不必恐慌,Hartmann告诫人们不要担心生活在我们浴室里的看不见的病毒群落,因为虽然微生物无处不在,但其中绝大多数不会让我们生病。Hartmann表示我们可以将淋浴喷头浸泡在醋中以去除钙堆积,或者简单地用普通肥皂和水清洗,而不是拿起漂白剂,因为你用消毒剂攻击它们的次数越多,它们就越有可能产生耐药性或变得更难治疗。此外,人们应该定期更换牙刷头,但是Hartmann不喜欢抗菌牙刷,她说这会导致抗生素耐药性细菌。
主编微信
领取专属 10元无门槛券
私享最新 技术干货