BLAST＋的安装使用以及配置本地NCBI的NR/NT库

NCBI开发的BLAST几乎是生命信息中应用最广泛的软件，本文将从Linux系统和Windows系统别介绍BLAST+的安装和使用。

下载地址：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/

Manual使用手册：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279690/

Help Manual 帮组手册：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1762/

参考文献： Camacho C, Coulouris G, Avagyan V, Ma N, Papadopoulos J, Bealer K, Madden TL (2009) BLAST+: Architecture and applications. BMC Bioinformatics 10: 1–9

文献网址：

https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2105-10-421

一、BLAST+安装

1、linux 安装

（代码可左右滑动，下同）

2、windows 安装

下载地址：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.7.1+-x64-win64.tar.gz

解压：

win+R 快捷键组会进入运行程序。输入cmd进入命令行模式。（下面两图）

先到解压后所在磁盘E盘，然后输入解压后blast可执行程序路径，进入。

二、运行BLAST+、参数以及结果介绍（linux和winows系统）

三、配置BLAST本地NCBI的NR/NT库

1、建立NR/NT/WINDOW_MASKER库配置文件

参考地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279695/#usermanual.Configuring_BLAST_via_configu

说明：

NT：non-redundant nucleotide 非冗余核苷酸序列库

NR：non-redundant protein 非冗余蛋白质序列库

2、下载NT/NR库