miRBase 22
经过漫长的等待,昨天,我们终于迎来miRBase 22的官方发布了!上一次miRBase 21的发布已经是2014年的事了。经过近四年的寂静,miRBase 22给等待它的人带来了什么惊喜呢?快来了解一下!
So, what is new in miRBase 22 ?
序列数目增加了三分之一!
正如研究者所期盼的,这次miRBase 22所收录的miRNA序列数量大增——超过了原本的三分之一!增加的这部分主要来自于之前数据库中没有的物种的新miRNA注释。具体地说,这次发布的版本新收录的物种达到了48个。尽管如此,miRBase发言人Sam认为他们仍然疏漏了部分已发表的miRNA注释,并表明会更加努力查缺补漏,更勤快地更新数据库。
深度测序数据集的收录和管理方法优化
在这次的新版本中,深度测序数据集的数目跃升为831个。miRBase现在拥有约1,000多个数据集,之前遇到的数据库技术问题以及网页的速度问题,都已经得到修复,使浏览数据时体验变得更好。更新后,希望数据库中越来越多的miRNA可被归类为“高可信度” (high condifence) 。
可跟踪查看miRNA序列的新变化
miRBase 22使用了新研发的接口,可一直保持跟踪miRBase的变化更新,点击"change log"链接即可进入查看。
除了上述的更新亮点,miRBase还即将推出收集序列信息的网页程序化服务。
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