3回答
我想用创建文件的步骤命名我的文件。步长以小数为单位，据我所知，用bash处理小数是很困难的。这是代码：
for i in $(seq 0.05 0.05 0.45)
do
.
.
.
mv POSCAR slipped_112_111_$(( i*2 )).vasp
done
我得到的错误如下：
./slip_loop.sh: line 3: 0.05: syntax error: invalid arithmetic operator (error token is ".05")
预期文件名：
slipped_112_111_0.10.vasp
slipped_112_11
浏览 0提问于2020-05-12得票数 0
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1回答
我正试图在VirtualBox上的ubuntu19.10中编译vasp 6.2.1。我安装了英特尔openApi (有ifortran编译器)和fftw3。我正在尝试使用ifort编译串行版本。但它给了我一个错误，如下。
if [ ! -d build ] ; then mkdir build ; fi
if [ ! -d build/std ] ; then mkdir build/std ; fi
cp src/makefile src/.objects src/makedeps.awk makefile.include build/std
make -C build/std VE
浏览 46提问于2021-10-24得票数 0
1回答
#!/bin/bash
totT=0
for a in `seq -w 3.5 0.1 4.5`
do
echo "a= $a"
cat >POSCAR <<!
Al FCC
1.0
$a 0.00 0.00
0.00 $a 0.00
0.00 0.00 $a
4
Direct
0.0 0.0 0.0
0.5 0.0 0.5
0.5 0.5 0.0
0.0 0.5 0.5
!
###I want to write a command to submit vasp.sh to PBS queue within the loop. How can I d
浏览 3提问于2021-03-05得票数 0
我安装完VASP之后对其进行测试，参考的是VASP最简单的安装方法（含全程视频演示） - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)中的VASP测试时，mpirun -np 4 vasp时出现一下问题，百度了也没解决
浏览 8提问于2024-09-28
2回答
使用pyiron运行Vasp计算，通过访问ElectronicStructure和Dos对象，我可以轻松地绘制状态的总密度，例如 from pyiron.project import Project
pr = Project('tmp')
pr.remove_jobs(recursive=True)
vasp = pr.create_job(pr.job_type.Vasp, 'vasp')
vasp.structure = pr.create_ase_bulk('Al')
vasp.run()
dos = vasp.get_electron
浏览 15提问于2020-01-14得票数 3
我的项目中有一个名为tmpInfo.txt的作业信息文件。tmpInfo.txt的内容如下： 875675 mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NP /opt/software/vasp/vasp-intel/vasp5.4/vasp5.4.1/vasp_std>o.$PBS_JOBID.out
875676 mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NP /opt/software/vasp/vasp-intel/vasp5.4/vasp5.4.1/vasp_std>o.$PBS_JOBID.out
浏览 46提问于2019-06-06得票数 0
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我添加了一个函数getAttendance，只有在单击表行时才应该触发该函数。如果我定义
<tr onclick={this.getAttendance} key={key}>运行良好，但如果我将其更改为将函数调用为<tr onclick={this.getAttendance} key={key}>或<tr onclick={()=>{this.getAttendance}} key={key}>，则会抛出上述错误。
import React, { Component } from 'react';
import &#
浏览 1提问于2019-02-14得票数 0
2回答
我正在尝试创建一个脚本来创建脚本(并做其他事情)。我的问题是，创建的这些脚本包含环境变量，当实际运行我的脚本时，它们不会出现在脚本中。
#!/bin/bash
for i in {001..116}
do
rm job
cat > job <<!
#PBS -S /bin/bash
#PBS -N $i-Fe63S
#PBS -j oe
#PBS -q default
#PBS -l nodes=1:ppn=24
#PBS -l walltime=48:00:00
#PBS -V
cd $PBS_O_WORKDIR
/opt/openmpi/bin/mpiru
浏览 2提问于2017-08-04得票数 0
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我已经编写了一个批处理脚本，用于打开bash终端并执行以下操作：
@echo off
SETLOCAL
set BASHPATH="C:\Program Files (x86)\Git\bin\"
set START_DIR=%CD%
set release=%1
echo Release outside cyg: %release%
set PATH=%BASHPATH%;%PATH%
%BASHPATH%\bash -l -c "echo Release inside cyg: $release \ && echo Directory: $ST
浏览 1提问于2017-03-23得票数 1
1回答
无法绘制p4vasp中的带结构。
运行时错误是：
vivek@vivek-Lenovo-Flex-2-14:~/apps$ p4v
(p4v.py:5002): libglade-WARNING **: Could not load support for `gnome': libgnome.so: cannot open shared object file: No such file or directory
(p4v.py:5002): libglade-WARNING **: Could not load support for `gnome': libgnome.
浏览 0提问于2017-07-31得票数 0
4回答
我正在使用一个只能在bash中运行的科学软件(名为vasp)，并使用Python创建一个脚本，该脚本将为我多次运行。当我正常地使用subprocess.check_call调用函数时，它工作得很好，但当我添加'| tee tee_output‘时，它就不工作了。
subprocess.check_call('vasp') #this works
subprocess.check_call('vasp | tee tee_output') #this doesn't
我是python和编程的新手。
浏览 2提问于2012-03-08得票数 4
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我想在Cray XC MPP机器上编译VASP 5 (5.4.1)的最新版本。有人有我可以使用的设置吗？VASP发行版没有为Cray提供示例。
构建系统已经从5.3.5版本改变了。
浏览 6提问于2015-07-16得票数 1
我有一个新的和编译版本的VASP，它执行磁力约束的局部时刻方向在飞行，这是我想测试和使用的比铁。
请您提供指南和步骤，以便将此版本的VASP添加到pyiron作为多一个可执行文件？
谢谢你，爱德华多
浏览 3提问于2022-09-05得票数 0
2回答
我有一个python脚本，它调用一个shell脚本，然后调用一个名为.exe的iv4_console。为了调试目的，我需要打印iv4_console的标准输出。我使用了这个: Python：
import sys
import subprocess
var="rW015005000000"
proc = subprocess.Popen(["c.sh", var], shell=True, stdout=subprocess.PIPE)
output = ''
for line in iter(proc.stdout.readline, &#
浏览 5提问于2017-03-25得票数 0
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在我的HPC上通过pysqa适配器运行pyiron作业时，我遇到了一些问题。我不小心擦除了包含pyiron、projects和resources文件夹的pyiron主目录。我已经从另一个集群中复制了所有三个。我认为唯一会引起问题的是resources文件夹中的sqlite.db文件。以前，我通过适配器运行交互式VASP作业没有任何问题。我猜在删除事件之后发生了什么。 我使用的pyiron版本是: 0.2.17 下面是一个使用Interactive vasp作业的最小示例，我已经尝试过了： from pyiron import Project
pr = Project('Al-test
浏览 41提问于2020-11-23得票数 1
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1回答
因此，我们试图在Ubuntu14.04LTS上编译VASP 5.4.1。下面是这里描述的类似的安装步骤：。但是，当测试vasp可执行文件(vasp_std等)时，程序终止时会出现分段错误--无效内存引用错误。
我们目前拥有的makefile.include是：
# Precompiler options
CPP_OPTIONS= -DMPI -DHOST=\"IFC91_ompi\" -DIFC \
-DCACHE_SIZE=4000 \
-DMPI_BLOCK=8000 -DscaLAPACK -Duse_collective \
浏览 7提问于2016-06-22得票数 0
下面的文件名为ABCD.vasp
# A B C D
1.000000
13.85640621 0.00000000 0.00000000
4.61880236 13.06394496 0.00000000
0.00000000 0.00000000 45.25483322
A B C D
32 32 32 32
Selective dynamics
Direct
0.00000000 0.00000000
浏览 2提问于2020-06-24得票数 1
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下面的文件名为ABCD.vasp
# A B C D
1.000000
13.85640621 0.00000000 0.00000000
4.61880236 13.06394496 0.00000000
0.00000000 0.00000000 45.25483322
A B C D
32 32 32 32
Selective dynamics
Direct
0.00000000 0.00000000
浏览 4提问于2020-06-24得票数 1
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如何使用argparse和变量nargs进行条件循环？因此，基本上，它应该运行或不带参数。我正在尝试：
parser = argparse.ArgumentParser(description="output parser")
group = parser.add_mutually_exclusive_group()
group.add_argument("--dos", help="get DOSCAR for plot",
nargs="?", metavar=("int"
浏览 14提问于2016-06-30得票数 4
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7回答
在配置文件中拆分文本
、、、、
我试图编写一个配置文件的简单解析器，例如，可能有一个名为INCAR的文件。
NSW = 1000
POTIM = 1
TEBEG = 300
如果我想提取POTIM的值，我可以采用awk在空白之间提取文本，并使用以下脚本：
#!/bin/bash
vaspT ()
{
if [ -f INCAR ]; then
local potim=$(grep POTIM INCAR | awk '{print $3}');
else
local potim=1;
fi;
echo "# Time st
浏览 20提问于2022-03-26得票数 2
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1回答
我有这样的文件：
ls CONFIG2
DOS DOSCAR KPOINTS PCDAT WAVECAR submit_vasp_beskow.sh
CHG EIGENVAL OSZICAR POSCAR XDATCAR vasprun.xml
CHGCAR IBZKPT OUT POTCAR error_file.e
CONTCAR INCAR OUTCAR PROCAR output_file.o
ls CONFIG2/DOS/
CHG EIGENVAL OSZICAR P
浏览 0提问于2019-03-26得票数 0
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我需要在Cray XC MPP机器上编译VASP 5.3.5。系统提供Gnu、Intel和Cray编译环境。还可以选择用于BLAS、LAPACK、ScaLAPCK的英特尔MKL或克雷LibSci。
哪一个是最好的编译器，最好的数值库和Makefile选项？
浏览 21提问于2015-06-25得票数 0
2回答
我想在目录中搜索一个名为file.txt的文件，并将这些文件中的整行替换为字符串aprun，替换为另一行vasprun = "mpirun -np 64 vasp"如何使用awk、sed或任何其他bash实用程序来完成此操作？
浏览 2提问于2016-05-22得票数 1
在Cray XC30上运行VASP 5.3.5时，我会看到以下错误：
Rank 4 [Mon Jun 1 14:58:35 2015] [c1-0c0s2n0] Fatal error in PMPI_Allgatherv: Invalid buffer pointer, error stack:
PMPI_Allgatherv(1235): MPI_Allgatherv(sbuf=0x49ead730, scount=1536, MPI_DOUBLE_COMPLEX, rbuf=0x49e95730, rcounts=0x494cdba0, displs=0x494d7360,
MP
浏览 7提问于2015-06-01得票数 2
1回答
我正在尝试使用Intel Vtune来分析我的MPI应用程序。在尝试运行以下两个命令时，我遇到了错误。
I_MPI_DEBUG=5. I尝试了两种方法：exportI_MPI_DEBUG=5 mpirun -np 4 aps ~/binary/vasp_std_2022mpirun -genv I_MPI_DEBUG=5 -np 4 aps ~/binary/vasp_std_2022
警告:在虚拟机中不支持内存带宽收集，因为无法收集uncore事件。要获得完整的功能，请考虑使用裸金属环境。警告:此平台不支持CPU频率数据收集。错误: perf :使用CPUID GenuineIntel-6-
浏览 7提问于2022-11-03得票数 0
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2回答
下面是VASP的代码框架。我的工作是在一个新的平台上移植它。当我使用那个平台的编译器时，我得到了错误。如果我注释掉了use m，并且我还得到了“，它必须有一个指定的显式接口。”，我只想做一个最小的修改，以避免在程序的其他部分产生错误。
module m
interface
subroutine a
end subroutine
end interface
interface
subroutine b
end subroutine
end interface
end module
subroutine a
use m
call b
end subroutine
浏览 6提问于2015-01-28得票数 1
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我正在使用来自maven存储库的Eclipselink 2.6.0-RC2，并尝试继承。
我有以下三门课：
@Entity
@Inheritance(strategy = InheritanceType.JOINED)
@DiscriminatorColumn(discriminatorType = DiscriminatorType.STRING, name = "CLASSNAME")
public abstract class Project {
@Id
@Column(length = 50)
private String id;
}
@Ent
浏览 0提问于2015-05-12得票数 0
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1回答
最近，我安装了Intel OneAPI，包括c编译器、FORTRAN编译器和mpi库，并使用它编写了VASP。
在提出问题之前，我需要在安装VASP时澄清一些技巧：
glibc 2.14 :集群是一台老机器，其glibc版本为2.12，其中OneAPI需要2.14版本。因此，我编译了GLIBC2.14，并导出了集群中的export LD_LIBRARY_PATH="~/mysoft/glibc214/lib:$LD_LIBRARY_PATH"ld :ld_path 2.24：ld版本为2.20，同时需要更高的版本。所以我安装了binutils 2.24.
有一台主计算机与集群
浏览 13提问于2022-05-21得票数 0
1回答
我有以下文件：
chr11_pilon3.g3568.t1 transcript:OIT01734 transcript:OIT01734 1.1e-107 389.8 1000 218 992 1 216 130 345 MDALTRHIQGDVPWCMLFADDIILIDETRAGVSERLEIWRQTLESKGFKISRSKTEYLECKFGDEPSGVGREVMLGSQAIAKRDSVRYLGSVIQGDGEIDGDVTHRIGAGWSKWRLASGVLCDKKIPHKLKGKFFRAMVRPAMFYEAECWPVKNSHIQRMKVAEMRMLRWMCGHTR
浏览 0提问于2020-11-10得票数 -2
回答已采纳
我正在Ubuntu14.04上编译一个Fortran程序(vasp)。
我在旧系统(13.10)上取得了成功，但是在重新安装我的机器后，我得到了一个符号查找错误：
/usr/lib/libmpi_f77.so.1:未定义符号: mpi_fortran_errcodes_ignore__
奇怪的是，这个符号似乎就在那里：
-W -s /usr/lib/libmpi_f77.so.1 \libmpi "errcodes_ignore“
16: 0000000000000000 0对象全局默认UND mpi_fortran_errcodes_ignore__ 142: 000000
浏览 1提问于2015-11-11得票数 0
我正在创建一个BASH脚本，并使用BASH getopt命令解析命令行参数。getopt返回提供给getopt命令的参数，而不是返回命令行上提供的参数。我不确定可能发生了什么，因为我的代码工作得很好，似乎突然停止了正常工作(不，我没有更新任何东西，也没有更改任何代码或环境设置)。我不能使用getopts (带有额外的“%s”)，因为出于某种未知的原因，它没有安装在将要运行此脚本的机器上。
尽管为脚本提供的命令行参数为零，但出于某种原因，getopt命令返回的是我提供的所有参数，减去-o标志，而不是表示选项结束的预期--值。我拥有的代码如下：
SHORT_OPTS=":hvso:l:d:
浏览 0提问于2013-02-27得票数 0
1回答
我正在创建一个SOAP请求到MMSC发布数字版权管理内容(.dm文件，这是一个3gp视频)。
我正在使用Saaj API来做同样的事情。我向其发送请求的MMSC表示，他们需要以下格式的SOAP请求，因为它是3gpp标准，用于提交VASP的SOAP请求。
POST / HTTP/1.1
Content-Type: multipart/related; boundary="XXX123456789PQR"; type=text/xml; start="<dna_003_mm7type>"
Content-Length: 14636
SOAPAction:
浏览 5提问于2010-11-24得票数 0
我正在开发一个安卓应用程序，应用程序使用FirebaseRecyclerAdapter从Firebase获取数据，我需要在该Recyler View中实现一个ProgressBar。
如何在数据为RrogressBar之前在RecyclerView中添加loaded..and，在加载数据后，需要取消加载屏幕
代码：
protected void onStart() {
super.onStart();
DatabaseReference reference = FirebaseDatabase.getInstance().getReference().child(&#
浏览 0提问于2019-08-15得票数 0
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1回答
我试图用pymatgen来绘制DOS (状态密度)，但我无法使它工作。第一次在python中遇到self和class函数，所以我感到很困惑。
这个解释了具有我需要的函数的包(我需要使用类CompleteDos的get_site_t2g_eg_resolved_dos(site)部分)。这个有这些函数的源代码。看看网上找到的，我做了这段代码
from pymatgen.electronic_structure.dos import CompleteDos
from pymatgen.electronic_structure.plotter import DosPlotter
from pymat
浏览 1提问于2017-02-21得票数 1
1回答
我已经安装了python包pymatgen，当我在我的Jupyter笔记本上使用它时，它可以完美地工作。但是，现在我想要按照这里指定的方式进行POSCAR设置：https://pymatgen.org/installation.html，但是当我在我的命令行(Linux)中运行：pmg config -p <EXTRACTED_VASP_POTCAR> <MY_PSP> (带有我的目录)时，它找不到它，并且我得到了错误： Command 'pmg' not found, did you mean:
command 'mg' fro
浏览 104提问于2020-03-20得票数 0
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我正在使用柯达api集成照片打印功能在我的网站。一切正常，但在创建订单时会给出错误消息，如您在下面的URL中所看到的
如果您无法看到错误消息，则可以看到我已得到的错误消息。
？
HTTP Status 401
类型:现状报告
消息:不允许使用方法
说明:对请求的资源不允许指定的HTTP方法(不允许方法)。
GlassFish服务器开源版3.1.2.2
？
为此，我还与柯达api的技术支持部门进行了交谈，但他们说，在进行此调用时，请确保将正确的“请求方法”设置为POST，将“Content”设置为application/x form-urlencoded。
我使用cURL进
浏览 1提问于2014-04-17得票数 1
我有一个嵌套的XML文件，我希望能够搜索一些元素并将其存储到一个数组中。
我不知道该怎么做……
XML文件如下所示
<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
<modeling>
<generator>
<i name="program" type="string">vasp </i>
<i name="version" type="string">5.4.1 </
浏览 0提问于2016-04-13得票数 1
streamsets的createDpmUser接口怎么用？找了官方文档也没找到怎么用，求大神赐教
浏览 210提问于2018-07-16
我用MDCActivityIndicator表示iOS。
我可以用trackEnabled = true看到指示器后面的轨迹
但我不知道怎么改变音轨颜色。
你知道怎么做吗？
浏览 0提问于2019-01-10得票数 0
我怎么能用伯特-小..。我试着用这行加载bert-base-uncased
transformers.AutoTokenizer.from_pretrained("bert-base-uncased")
但我该怎么用伯特·蒂尼，拜托？
浏览 0提问于2022-02-20得票数 2
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我试图弄清楚如何在SL中使用DispatcherHelperftom MVVM工具包，但我找不到任何例子。
从这个框架的主页我知道
DispatcherHelper类，这是一个帮助您创建多线程应用程序的轻量级类。
但我不知道怎么用。
我怎么用，用什么？
浏览 1提问于2011-09-13得票数 7
回答已采纳
我需要使用用户名在MODx中获得一个用户对象。或者使用用户名的配置文件。我怎么能这么做？
我知道怎么用身份证。
我用的是MODx REvo。
浏览 3提问于2015-04-07得票数 0
回答已采纳
在Gruntfiles中，在JS版本中，经常可以看到类似的情况。我正试着用咖啡记录重写它。
require('load-grunt-config')(grunt);
你是怎么用CoffeeScript写的呢？我甚至不知道你会怎么称呼这种事。
浏览 6提问于2014-05-09得票数 0
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2回答
想象一下，我们正在建设一个图书馆系统。我们的用例可能是
借书
查册
管理会员资格
想象一下，我们可以通过图书管理员或机器来完成这些用例。我们需要实现这些用例。
我们应该针对不同的流绘制不同的用例实现吗？如果不是的话，从机器和人那里借一本书是很不一样的。我们该怎么处理呢？
此外，如果有一天我们已经更新了库机器的版本，该怎么办？(例如，一个用键盘，另一个用触摸屏)那我们该怎么办？流程保持不变，但是硬件和软件最终是不同的。
你会用什么来实现用例，为什么？
这可能是一个基本的问题，但我未能找到具体的例子来理解什么是正确的。先谢谢大家。
浏览 15提问于2022-01-25得票数 4
回答已采纳
2回答
我放了一个导航栏，但我不知道如何改变它的颜色，我试着用Main.storyboard做，但它不工作，然后我试着用代码做，但我不知道怎么做。有没有人能教我怎么做？
浏览 0提问于2015-11-08得票数 6
2回答
我想画曲线，但是我不知道用WebGL怎么做。我有很多想法，用gl.LINE_STRIP做一些事情，也许画圆(去掉角)，然后以某种方式画出弯曲的角，或者画圆像线或其他什么，怎么办？
浏览 14提问于2017-10-23得票数 3
5回答
如果我用chrome打开它，我创建的网站是很好的，但是，当我用firefox打开它时，菜单和内容之间有一个空间。。你知道怎么修吗？这个网站是在WordPress上开发的。所以我不知道怎么解决它。谢谢..
浏览 4提问于2015-04-24得票数 2
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