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    基于全基因组的基因家族分析(1):数据准备

    Sol Genomics Net:茄科基因组网络,里面包括了很多物种的基因组测序结果:番茄,土豆,茄子等。而且基因组更新最快,搜索了一下发现NCBI番茄基因组和Phytozome番茄基因组为ITAG2.4,而SGN已经是最新版本的ITAG3.2,当然以前的版本也都存在,特别方便。 此外,NCBI ProteinID是refseq accession(GENBANK文件格式有关于NCBI中ID的说明),在最后转换到番茄protein ID时会有问题,小编最后终于放弃,没有找到转换的方法(谁要是知道方法,麻烦告诉我一下,一直很苦恼)。而Phytozome要下载这些数据居然还要注册,真的有点烦,偷偷告诉你,SGN貌似也要注册(这个大家应该都没有什么问题,就直接跳过)。

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    《算法图解》第八章_贪婪算法_集合覆盖问题

    一、贪婪算法介绍 算法基本思路:从问题的某一个初始解出发一步一步地进行,根据某个优化测度,每一步都要确保能获得局部最优解。每一步只考虑一个数据,他的选取应该满足局部优化的条件。若下一个数据和部分最优解连在一起不再是可行解时,就不把该数据添加到部分解中,直到把所有数据枚举完,或者不能再添加算法停止。(摘自 贪婪算法_百度百科) 简单直接的描述,就是指每步都选择局部最优解,最终得到的就是全局最优解。 二、引入:集合覆盖问题 假设你办了个广播节目,要让全美个州的听众都收听得到,为此,你需要决定在哪些广播台播出。在

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    领券