在上一篇文章里,我们给大家介绍了之前系列里提及的线性回归的扩展部分,详情点击:R语言系列五:①R语言与多元回归 但医学工作者最常接触的结局预测变量多为二分类变量,比如阳性、阴性,病例、对照乃至生存、死亡这样的变量...关于逻辑回归模型,需要注意的是,他与线性模型不同,没有误差项。我们是对一个事件发生的概率直接建模,而二元输出的变异性将由此概率来确定。因此,与正态分布不同,这里没有方差这个参数。...我们这里按照数据的原始类型分类来讲解不同的原始数据应该怎样通过R语言建立逻辑回归模型。 ? A. 表格化数据的逻辑回归 ?...《R语言统计入门(第二版)》人民邮电出版社 Peter Dalgaard著 2....《R语言初学者指南》人民邮电出版社 Brian Dennis著 3.Vicky的小笔记本《blooming for you》by Vicky
不过模型设定和结果输出等内容与前面系列讲过的关于回归分析和方差分析的内容差别不大,链接:R语言系列第四期:②R语言多组样本方差分析与KW检验、R语言系列第四期:④R语言简单相关与回归。...) 与之前谈到简单回归一样,lm函数返回的结果有限。...另外,我们在平常使用线性模型中也经遇到一些问题,比如共线性,交互效应等问题,我们会在这个系列的番外——R语言系列5番外为大家介绍。 好了,这部分的内容就先介绍到这里,我们下期再见。 参考资料: 1....《R语言统计入门(第二版)》人民邮电出版社 Peter Dalgaard著 2....《R语言初学者指南》人民邮电出版社 Brian Dennis著 3.Vicky的小笔记本《blooming for you》by Vicky
fev1+rv+frc+tlc) 上面的公式意味着变量pemax可由一个由变量age、sex及其他变量组成的模型来描述(pemax是指患者的最大呼气压力,数据集cystfibr中其他变量的解释可以参考R中的数据集解释...) 与之前谈到简单回归一样,lm函数返回的结果有限。...: 0.6373, Adjusted R-squared: 0.4197 F-statistic: 2.929 on 9 and 15 DF, p-value: 0.03195 #Tips:...模型筛选 R中有一个按照赤池信息准则(Akaike Information Criterion)进行模型筛选的函数step()。...《R语言统计入门(第二版)》人民邮电出版社 Peter Dalgaard著 2.《R语言初学者指南》人民邮电出版社 Brian Dennis著
——荀子 这篇文章讲述的是R语言中关于向量与矩阵的相关知识。希望这篇R语言文章对您有所帮助!...超过部分 NA自动补齐 > letters[1:30] [1] "a" "b" "c" "d" "e" "f" "g" "h" "i" "j" "k" "l" "m" "n" "o" "p" "q" "r"...:4) > b [1] 1 2 3 4 > solve(a,b) [1] 0.894783 3.750849 4.723690 -8.572473 8、eigen()函数 用来求矩阵的特征值与特征向量
常用算术运算符 运算符 描述 + 加法 − 减法 * 乘法 / 除法 ^或** 求幂 %% 求余 %/% 整数除法 注意,R 区分大小写。...acos(x)、atan(x) exp(x) log(x)、log2(x)、log10(x) round(x, 保留位数) ceiling(x) floor(x) trunc(x):截取 x 的整数部分 R...R 对象 在 R 语言中,“一切皆对象”。数据分析包括很多步骤,从数据整理、探索、建模到可视化,每个步骤都需要处理不同的对象,例如向量、矩阵、函数、模型等。...工作空间管理 工作空间(workspace)就是 R 的工作环境,所有创建的对象都被临时保存在工作空间(也可称为全局环境,.GlobalEnv)中。...ls() 工作目录(working directory)是 R 用来读取文件和保存结果的一个文件夹。
对于R语言用户来说,深度学习还没有生产级的解决方案(除了MXNET)。这篇文章介绍了R语言的Keras接口,以及如何使用它来执行图像分类。...文章结尾会通过提供一些代码片段显示Keras的直观和强大 Tensorflow 去年1月,R语言中的Tensorflow 发布了,它提供了从R语言中获得的Tensorflow API的方法。...然而,对于大多数R语言用户来说,R语言的Tensorflow接口和R语言并不是很像。下面是训练模型的代码块。...Github的快速搜索发现使用tensorflow为R语言提供的代码不到100个。 Keras 所有这一切都将随着Keras和R语言而改变。...Keras接口使R语言用户更容易构建和细化深度学习模型。
工作空间 R语言的工作空间其实就是你当下R语言的工作环境,它包括任何你已经定义了的对象。当一个R进程结束时,用户可以将当前的工作空间保存下来,在下次启动R时就会自动加载,非常方便省事。...R语言是一个交互式界面,上翻和下翻键可以用来查看历史指令。...这里我建议大家使用RStudio,因为RStudio提供非常强大的R语言高度可视化操作界面,你可以在RStudio里写R代码,也可以写Python代码,同时可以使用Rmarkdown来写自己的文档。...R包 R包是R语言生态系统最为重要的一部分,每天R语言官网上都会更新一些高质量的R包。这些R包一般都集成了一系列用于完成某项工作的函数,我们通过加载R包就可以顺利调用里面的函数,完成后续分析。...("packages") # 从R官网安装指定的R包 library("packages") # 加载指定的R包 关于R包的寻找和安装,请参考往期内容。
熟练使用R软件 实践1:最初几步 x=1:100#把1,2,...,100个整数向量赋值到x (x=1:100) #同上, 只不过显示出来 sample(x,20) #从1,...,100中随机不放回地抽取...setdiff(x,z) #x和z之间的不同元素--集合差 sort(union(xz,z))#对xz及z的并的元素从小到大排序 setequal(union(xz,z),x) #对xz及z的并的元素与x...是否一样 intersect(1:10,7:50) #两个数据的交 sample(1:100,20,prob=1:100)#从1:100中不等概率随机抽样, #各数目抽到的概率与1:100成比例 实践...这里写代码片x=pi*10^2 class(x) #x的class typeof(x) #x的type class(cars)#cars是一个R中自带的数据 typeof(cars) #cars的type...实践5: 简单样本描述统计量等等 这里写代码片x <- round(runif(20,0,20), digits=2)#四舍五入 summary(x) #汇总 min(x);max(x) #极值, 与range
本文主要结构: 一、下载最新版本的R 二、最新版本R的下载与安装步骤 三、下载指定版本的R 一、通过清华镜像网址下载:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN...二、R语言下载与安装的步骤: 1.进入官方网址:https://www.r-project.org,点击download R ? 2.点击任一中国镜像网址均可 ?...5.点击Download R-4.3.1 for Windows 下载R安装文件 ? 下载完R安装文件后,运行安装文件并按照提示进行安装,安装完成后,可以点击R图标启动R软件。...以上是安装的最新版的R程序,因为一些R包并不支持最新版的R,所以我们可以再下载一个旧版本的R进行安装,如下图点击Previous releases。电脑支持安装多个版本的R程序。 ?...三、下载指定版本的R 选择旧版本的R进行下载并安装 ? 四、R下载及安装动画教程 ?
R的安装过程 1.1.首先附上清华线路的下载链接Windows版3.3.1 1.2. 选择安装路径 1.3. 注意根据自己的计算机位数选择,如我的是64位,便选择64位安装。 1.4....> 1+1 [1] 2 > a=5+10 > a [1] 15 > 2.2 图形 > t=0:100 > n=100*(1+0.2)^t > plot(t,n,type="l") 2.3 R脚本与函数
笔者:受alphago影响,想看看深度学习,但是其在R语言中的应用包可谓少之又少,更多的是在matlab和python中或者是调用。...———————————————————————————————————————————— Matt︱R语言调用深度学习架构系列引文 R语言︱H2o深度学习的一些R语言实践——H2o包 R用户的福音︱TensorFlow...:TensorFlow的R接口 mxnet:结合R与GPU加速深度学习 碎片︱R语言与深度学习 ————————————————————————————————————— 一、R结合H2O...C:/TMP/h2o_huangqiang01_started_from_r.err java version "1.7.0_25" Java(TM) SE Runtime...三、参考 1、R语言和深度学习:http://blog.csdn.net/easonlv/article/details/23427809 2、R语言结合H2O做深度学习 :http://blog.itpub.net
一.认识R和Rstudioplot() 函数 它主要用于绘制散点图和折线图 runif( ) 从连续的均匀分布中抽取样本,产生均匀的连续分布.图片二.设置字体大小三.R语言基本操作用Rproject管理工作目录显示文件列表加减乘除赋值
对于寿命数据的分析,在生物学和医药学中是非常重要的话题。除此之外,在工程应用中的可靠性分析中也非常重要。寿命数据往往是高度非正态数据,因此使用标准的线性模型可能...
而相对于逻辑回归的只有分类结局,只考虑终点事件是否出现的情况,详情点击:R语言系列第五期:③R语言逻辑回归预测和检验、R语言系列五:②R语言与逻辑回归建立 生存分析的结局还会考虑观察对象达到终点所经历的时间长短...《R语言统计入门(第二版)》人民邮电出版社 Peter Dalgaard著 2.《R语言初学者指南》人民邮电出版社 Brian Dennis著 3.
一、R软件下载 下载地址:https://cran.r-project.org/ 图 1 R软件下载页面 下载之后是.exe执行文件,不是zip压缩格式文件,可以直接点击安装。...最后一步是设置系统环境变量: 四、R使用教程 图 2 R主界面 图 3 R中执行一个简单程序 五、RStudio使用教程 图 6 RStudio主界面 Source...可点击左上角的【File】→【New File】→【R Script】将Source区打开,如下图。 上面步骤将新建一个名为“Untitled1”的R代码文件(后缀名默认为.R)。...RStudio一些其它小技巧: 切换不同R版本 R允许多个版本共存,比如我在电脑上同时安装了3个版本(如下图)。通过RStudio可以很方便在各个R版本间进行切换。...老版本的R安装包下载链接,Windows:https://cran.r-project.org/bin/windows/base/old/,Mac: https://cran.r-project.org
这篇推文将帮助你了解如何从GDC(Genomic Data Commons)下载TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据,并在R中进行数据整理和处理。...在R中读取下载的TCGA数据 下载完成后,可以使用R加载这些数据,并进行整理。...获取样本名和文件名的对应关系 你可能需要获取样本与文件名之间的对应关系,以便后续分析。...可以使用以下代码提取这些信息: # 提取样本ID与文件路径的映射 sample_file_map <- data.frame( Sample = substr(allfiles...读取数据:在R中读取下载的.tsv文件。 整理表达矩阵:将数据提取并合并成一个统一的表达矩阵。 添加行列名:确保行名为基因ID,列名为样本ID。 获取样本与文件名对应关系:便于后续分析。
说明 在前一篇中,我们介绍了 R 语言和 R Studio 的安装,并简单的介绍了一个示例,接下来让我们由浅入深的学习 R 语言的相关知识。...本篇将主要介绍 R 语言的基本操作、变量和几种基本数据类型,好对 R 语言的使用方法有一个基本的概念。...通过本篇的学习,你将了解到: R 语言有哪些基本操作 什么是变量,以及如何给变量赋值 R 语言有哪些基本数据类型,如何确定变量的数据类型 R 语言的基本操作 R 语言的默认提示符是 > ,它表示正在等待输入命令...R 语言中变量是区分大小写的,x 与 X 是两个不同的变量。...数值型(numeric) R 语言中数字的默认类型为数值型,在运算时需要注意其精度问题,当整数部分大于等于7位时,将舍弃小数部分,当整数部分小于7位时,与小数部分一起最多保留7位数字。
总结了一下 R 语言中常用的一些操作与函数使用,抛砖引玉,分享一下给大家,如有错误的地方欢迎留言指正。 怎样显示 R 软件中某个包中包含的全部数据集?...libPaths() 查看该包里面所有的函数 ls('package:ggplot2') 查看已经安装的包目录 library() 载入mypackage 包 library(mypackage) 查看启动 R...,特别是 bioconductor 的包有 vignette,用函数查看 vignette('mypackage') 查看 vignette openVignette('mypackage') 搜索 R...网站上的 "helpinfor" 相关信息 RSiteSearch("helpinfor") 查看已经安装包的详细 HTML 文档 help.start() 查看当前载入的包 search() 查看 R...class") 查看某个对象的 slot slotNames(MyObject) 卸除已加载的包 > detach("package:RMySQL") # 注意是卸除,不是卸载,也就是说不是把包从 R
之前用python做过简单的爬虫与分析,今天尝试一下用R完成相应的功能。首先用R爬取了《了不起的麦瑟尔夫人》豆瓣短评作为语料,然后进行了词云绘制、关键词提取的基本操作。...代码实现 R语言中,有两种进行数据获取的方式。一种是RCurl包+XML包,过程与python中的urllib与bs4相似,先读取网页代码再对html代码进行解析。...观察文本结果,发现每条短评后面都有很多空格和\n,因此我们用gsub函数,去除文本中的\n与空格。注意,“[\n.* ]”中的“]”前面有一个空格。 ? ?...用wordcloud2绘制词云的方法在十九大讲话文本分析(R语言)中也有介绍,本次我们用自定义图片的方式设置词云形状,即设置figPath参数,注意,图片需要存放在wordcloud2中默认的文件夹下,
【开源中国 APP 全新上线】“动弹” 回归、集成大模型对话、畅读技术报告 R语言环境安装 安装文件下载地址:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/
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