做单细胞数据分析的时候,我们经常会用小提琴图来展示一些marker在不同细胞亚群中的表达情况。R的Seurat包中就有一个函数叫VlnPlot,专门用来画小提琴图的。...,还有右侧的图注。...如果不想要右侧的图注,可以使用NoLegend() VlnPlot(scRNA, features = "CD3E")+NoLegend() 如果散点图也不想要,这个时候我们就要去研究一下VlnPlot...是控制点大小的,因此我们可以把点的大小设置成0试试 VlnPlot(scRNA, features = "CD3E",pt.size = 0)+NoLegend() 看样子是work的 可能有些人想同时把箱型图也画出来...其实也很容易,VlnPlot这个函数实际上是基于ggplot写的,所以可以通过geom_boxplot()来添加箱型图 VlnPlot(scRNA, features = "CD3E",pt.size=
Pyecharts-10-绘制箱型图 本文中介绍的是如何利用pyecharts绘制箱型图。由于箱线图不像柱状图、折线图那样简单常见,许多人都对它敬而远之。...两种数据 连续型数据 离散型数据 箱型图介绍 5个统计量 绘图 常见的两种数据 在数值型数据中,常见的数据类型有两种:连续型数据和离散型数据,分别解释为: 连续型数据 连续型数据:在一定区间内可以任意取值的变量叫连续变量...大多数图表可视化的都是这类数据,比如柱状图、折线图等。 什么是箱型图 发明者 箱图的发明者John Tukey。Tukey先生1915年出生于美国麻省的新贝德福德。...箱型图 箱线图(Boxplot)也称箱须图(Box-whisker Plot),是利用数据中的五个统计量:最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数与最大值来描述数据的一种方法。...特点 箱型图的最大特点就是不受异常值的影响,能够准确稳定地描绘出数据的离散分布情况,同时也利于数据的清洗。 如果数据中存在异常值,箱型图会自动识别为异常。
当然,不同的箱型图,指标也不尽然全都一样,比如PowerBI中的一个可视化工具Box Whisker chart就是其中的一种,又叫做盒须图。 所以就用Box Whisker chart来说明。...当然,有一些箱型图并不是按照上面的指标比如下面这张图,它其实没有上下边界,取而代之的是上下1.5个IQR的界限,而有些值超过了上下界限,就定义为异常值(圆圈的位置)。 ?...比如我们选择销售表中的各分公司、销售员和销售额可以得到如下的箱型图: ?
效果图: 直接上代码吧: <!...tooltip: { trigger: 'item', //触发类型,数据项图形触发,主要在散点图,饼图等无类目轴的图表中使用...}, series: [{ name: 'boxplot', //箱形图
carbon.png
默认的箱型图如下所示: 但是有时,我需要将箱子中默认的中位数那条线,改为平均值。...箱型图中的横线为平均值: library(dplyr) library(ggplot2) library(ggpubr) theme_set(theme_pubclean()) plot <- ggplot...theme_classic() print(plot) pdf(file = 'pair1.pdf', height = 4, width = 4) print(plot) dev.off() 箱型图中的横线为中位数
导语 GUIDE ╲ qqboxplot作为ggplot的扩展,可以实现q-q箱线图的绘制。 背景介绍 箱形图(Box-plot)又称为盒式图或箱线图,是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。...R包安装 BiocManager::install("qqboxplot") library(qqboxplot) 可视化介绍 01 比较箱线图、q-q图和 q-q箱线图 使用来自一名自闭症患者和一名对照患者的随机基因样本...panel.grid.major = element_line(colour = "grey70"), panel.grid.minor = element_line(colour="grey80")) #常规箱型图...rep("t distribution, df=8", 1000), rep("t distribution, df=32", 1000))) 使用模拟数据绘制箱型图...element_rect(fill="white"), panel.grid = element_line(colour = "grey70")) 小编总结 qqboxplot在箱型图和
箱图 简单点数就是像一个箱子的图,用于表征数据的分布。 百度定义:箱形图(Box-plot)又称为盒须图、盒式图或箱线图,是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。因形状如箱子而得名。...数据 使用R自带的数据 代码 导入数据,不想解释各行各列没什么意义,分为两类,一个单一箱图,一个并列的箱图 input1<- mtcars[,c('mpg')] input2 <- mtcars ?...做一个单一的箱图,就是只是一个mpg boxplot(input1, main = "Box plot", ylab = "mpg",xlab='x')!...imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240) 然后制作一个表示mpg与vs的关系的并列的箱图 boxplot(mpg~vs, data = input2...imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240) 箱图修改每个箱子的标签 boxplot( mpg ~ vs, input2, names = c(
最近接到锅让画几个数据图。其实第一反应是用origin来画图,但问了一圈周围没有用Origin画过箱形图的,有些问题无法解决又百度不到。...但好在略懂一点python的matplotlib画图,于是决定换个更适合程序员的画图工具。 人生苦短,我用python。 话不多说,为节约搜索画图方法小伙伴的时间先展示一下最终效果。...', '5000', '6500', '10000'] pos = [math.log10(int(x)) for x in text] #调整每个box的位置,因为一组数据中有9个box,而由于箱形图的特殊性其...'top'].set_linewidth(2) ax.spines['left'].set_linewidth(2) ax.spines['right'].set_linewidth(2) 此时画出的图是这样的...[1:]])+1.2) #由于x轴是手动指定的刻度(并不是真正的表示数值),因此用x轴的长度来调整右侧宽度 ax.set_ylim(1, 20000) #由于y轴是数值型的因此直接对应刻度来调整限制范围
的科学计算版块 今天讲讲seaborn模块: 箱形图 Part 1:示例 ?...已知df_1,有4列["p1", "p2", "p3", "p4", "from"] 根据from类别输出p1的箱形图,就是以from为分类标准,将p1列进行分类,对每类输出箱形图 不考虑from列,输出..."p1", "p2", "p3", "p4"的箱形图 图1 p1的箱形图 ?...图2 "p1", "p2", "p3", "p4"的箱形图 ? Part 2:代码 ?...传送门 Python-科学计算-seaborn-02-热力图 Python-科学计算-seaborn-01-矩阵图 本文为原创作品,欢迎分享朋友圈
箱形图(Box-plot) 又称为盒须图、盒式图或箱线图,是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图,因形状如箱子而得名。它能显示出一组数据的最大值、最小值、中位数、及上下四分位数。...箱形图绘制须使用常用的统计量,能提供有关数据位置和分散情况的关键信息,尤其在比较不同的母体数据时更可表现其差异。...箱形图的绘制主要包含六个数据节点,需要先将数据从大到小进行排列,然后分别计算出它的上边缘,上四分位数,中位数,下四分位数,下边缘,还有一个异常值。...异常值之外,最靠近上边缘和下边缘的两个值处,画横线,作为箱线图的触须。...小提琴图 小提琴图 (Violin Plot)是用来展示多组数据的分布状态以及概率密度。这种图表结合了箱形图和密度图的特征,主要用来显示数据的分布形状。跟箱形图类似,但是在密度层面展示更好。
distribution),也称高斯分布(Gaussian distribution),具体详细的介绍可自行网上查阅资料; 其次,如下图中所示的:分位数、中位数、众数等; 再者,就是今天要重点介绍的箱型图...,如下图所示 待会要分享的Python程序就是对箱型图中上下边缘值的计算实现。...箱型图上下限取值为什么要使用 IQR = Q3 -Q1 上边缘 = Q3(上四分位数) + 1.5IQR 下边缘 = Q1(下四分位数) - 1.5IQR 原因在于Q3(上四分位数) + 1.5IQR与...Q1(下四分位数) - 1.5IQR比较接近于正负3sigma的界限值,如下截图所示: 二、上面简单介绍了下正态分布及箱型图的知识,接下来就看如何用Python来实现大数据量的数据中上下边缘值的计算吧...在贴代码之前简单说下需求背景,即:公司网页上某个指标数据需要每天check下展示给用户看到的数据是否正常,且这个数据每天都会随实际的线下营业情况而不同,所以不能简单判断是否为一固定值,经过分析可以采用箱型图的上下边缘值来做判断
为体现组间差异,可能大部分人都会第一个想到箱图(boxplot)来展示;但是当审稿人看到满屏Figure都是箱图的时候,肯定会觉得作者团队数据可视化能力还有待提高,如何给审稿人美好的第一印象,科研数据的可视化非常重要...,相同的数据,除了箱图,我们还可以使用小提琴图或者密度分布图来展示结果,而且尽量让一些统计学结果体现在图里。...group, y=weight, fill=group)) + geom_boxplot()+ scale_fill_brewer(palette="Dark2") bp 下面使用密度分布图来展示结果...= group)) + scale_fill_brewer(palette="Dark2")+ geom_density(alpha=0.56) dp 接着我们试图将一些统计学参数加上,增加图可视化和信息量...grp.median), linetype="dashed",color = "grey") 说到统计学指标,这里墙裂推荐ggstatsplot;不用吹,看图就知道多强大了;出图的时候还顺带帮你把统计学比较做完了
——《月亮与六便士》 文章目录 一、数据获取 二、折线图 三、箱形图 一、数据获取 数据来源:http://www.tianqihoubao.com/aqi/chengdu-201901.html...from pyecharts.globals import CurrentConfig CurrentConfig.ONLINE_HOST = 'D:/python/pyecharts-assets-master...按月统计).html') 运行效果如下: [4l4j77nd9w.gif] 三、箱形图 箱形图(Box-plot)又称为盒须图、盒式图或箱线图,是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。...boxplot.prepare_data(y_data)) boxplot.set_global_opts( title_opts=opts.TitleOpts( title='2019年成都季度AQI指数箱型图...opts.AxisOpts(name='季度'), yaxis_opts=opts.AxisOpts(name='AQI指数') ) boxplot.render('2019年成都季度AQI指数箱型图
要用到matplotlib: from matplotlib import pyplot as plt a=range(1,10) plt.boxplot((a...
一、箱线图 ToothGrowth boxplot(len ~ dose, data = ToothGrowth) boxplot(len ~ supp, data = ToothGrowth) boxplot...dose == 0.5], ToothGrowth$len[ToothGrowth$supp == 'VC'& ToothGrowth$dose == 0.5]) 带凹口的箱线图...二、小提琴图 library(vioplot) vioplot(len ~ supp+dose, data = ToothGrowth, col = c("#66C2A5","#FC8D62
导语 GUIDE ╲ ggeconodist是开发者受Economist杂志独特风格的启发,开发的一款与普通绘制的箱型图不同风格的R包。...今天要给大家介绍的是一种箱型图的个性画法,功能由ggeconodist包提供,开发者受一款杂志Economist中绘图风格的启发,从而开发了这样一款绘图美观的箱型图绘图包。...首先让我们来看一下正常用geom_boxplot()绘制的箱型图和geom_econodist()绘制的箱型图有什么区别,上面是普通的箱型图,下方是改变后的图片,相比之下确实美观了很多呀!...p <- ggplot(mpg, aes(class, hwy)) + theme_ipsum_rc() ##将geom_boxplot改为geom_econodist即可用ggeconodist绘制箱型图...~color) 06 Economist中原图绘制 最后让我们一起来看开发者是怎么绘制Economist杂志中给予他灵感来源的箱型图的!
文章目录 Python中可以通过matplotlib模块的pyplot子库来完成绘图。Matplotlib可用于创建高质量的图表和图形,也可以用于绘制和可视化结果。...本文用python对一批运动员数据进行操作,读取数据、数据预处理、matplotlib数据可视化,熟悉用python进行数据分析和可视化的基本方法,并绘制箱形图、散点图和直方图。...绘制箱形图 箱线图,又称箱形图 (boxplot) 或盒式图,不同于一般的折线图、柱状图或饼图等传统图表,只是数据大小、占比、趋势等等的呈现,其包含一些统计学的均值、分位数、极值等等统计量,因此,该图信息量较大...使用箱形图展示出不同技术等级 (Skill_Moves) 的运动员的评分 (Rating) 分布情况,即横轴为运动员的技术等级,纵轴为评分。...median.set(color='black', linewidth=3) plt.xlabel('技术等级') plt.ylabel('评分') plt.title('不同技术等级的运动员评分分布箱形图
(7)设置箱型图box plot的大小size import seaborn as sns df = sns.load_dataset('iris') # Change width sns.boxplot...(8)修改箱型图颜色:基于corlorplatte # library & dataset import seaborn as sns df = sns.load_dataset('iris') #...(11)设置箱型图box plot颜色:高亮突出某一个分组 # Highlight a group import seaborn as sns df = sns.load_dataset('iris')...(12)设置亚型分组箱型图box plot 当我们同时有一个numerical variable,许多个 groups, 还有一个subgroups, 我们这个时候就需要分组小提琴图,也就是 grouped...但是,请注意,箱型图可以隐藏单个数据的值。因此,强烈建议在箱线图中显示所有观察结果值。而如果有许多观察结果,小提琴图可能是一个有趣的选择。
❝今天又遇到观众老爷提问如何给多组箱线图添加置信区间及P值与R值,想着可能其他朋友也有需求,那么就废话不多说直接开干,还是之前的绘图方案做了一些细微的改动,下面来看具体案例; ❞ 加载R包 library...coord_cartesian() ❝还是熟悉的配方,在此只需要注意 「aes(group=1)」 参数,此参数只能用于「局部映射」,图中若要改为添加R值只需将「rr.label」改为「r.label」,可以看到此图包含的内容十分丰富基本涵盖了我所知的所有分析
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