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关于分子力场中键能项和角能项的思考

而势能表达式前的系数 \frac{1}{2} 主要是为了使得力的形式符合胡克定律,更方便理解,但实际上很多力场中把这个系数融入到了参数 k_b 中,且 k_b>0 。...再计算 k_b(\textbf{r}_B-\textbf{r}_A) 再计算 k_bb(\textbf{r}_B-\textbf{r}_A) ,一共是 6P 次乘法运算。...如果我们选择用CPU上(如果选择用GPU计算,那么评估标准会有所不同)的Python来计算一个bond force的话,那么就可能有这么几种思路: 用现有的自动微分框架,只需要实现一个bond_energy...的计算函数,就可以自动求得每个原子上的力; 用for循环来实现一个bond_force函数,使得计算满足最低的复杂度要求; 用Python的向量化运算来实现一个vector_bond_force函数,可以直接调用比较成熟的...总结概要 本文介绍了在分子力场中经常有可能被使用到的键长和键角项的谐振势模型,并且分别从自动微分的Python代码实现以及解析形式的矢量化编程形式给出了初步的实现方案。

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    上知天文,下晓地理!

    既然要实现算法必然离不开代码,对于数据分析以及数据可视化做的最好的也就是 Python 了,但是仅仅使用 Python 的数据分析以及数据可视化的模块或者包远远不够,天文学的东西太多了,如果一个一个自定义根本不切实际...,于是有人想到要把这些天文学的东西封装起来,然后就出现了即将要讲解的 Python 模块——astropy。...01 上知天文 我们首先来看一下模块 astropy,astropy 是一个社区的针对天文学的 Python 库。...astropy 包包含关键的功能和用 Python 进行天文学和天体物理学研究的工具。...8.85418782e-12 F/m 电常数 g0 9.80665 m / s2 标准重力加速度 h 6.62607004e-34 J s 普朗克常数 hbar 1.0545718e-34 J s 约化普朗克常数 k_B

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    PythonPython 包 ① ( Python 包引入 | Python 包概念 | Python 包结构 | 创建 Python 包 | 导入 Python 包 )

    一、Python 包简介 1、Python 包引入 之前 介绍了 Python 模块 , 每个 Python 源码文件 , 都可以定义为一个 Python 模块 ; 如果 定义的 Python 源码模块很多..., 有几百上千个 , 则会出现管理繁琐 , 混乱的问题 ; 这里引入 新的代码结构 " Python 包 " ; 2、Python 包概念 Python 包 概念 : 包是 Python 模块 Module...的扩展 , 将若干 相关的 Module 模块 组织起来 形成一个 Python 包 , 可以更好地 组织 和 管理 Python 代码 ; 在 Python 包中 可以 定义 变量 / 函数 / 类..., 可以 更好地 组织 和 管理 Python 代码 ; 除了 自定义 Python 包之外 , Python 还提供了 Python 标准库 和 其他人编写的第三方 Python 包 来扩展 Python...包 右键点击 PyCharm 中的 Python 工程根目录 , 选择 " New / Python Package " 选项 , 输入 Python 包名称 , 然后点击回车 , 创建 Python

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    Python教程: Python 介绍

    Python教程: Python 介绍 1、Python 命令行解释提示符下 输入control + p 命令提示符向上查找 输入control + n 命令提示符向下查找 2、在交互模式中,最后打印的表达式的值被赋予给变量...most recent call last):   File "", line 1, in IndexError: string index out of range 12、Python...13、Python 2.0以后引入了新的存储文本的数据类型,Unicode对象。他可以很好的存储、维护Unicode数据并提供自动转换。 Unicode常被用来解决国际化。...注:\u0020表示Unicode字符0x0020(空格) 15、原始模式字符串,字符串引号前添加'ur'前缀,Python使用Raw-Unicode-Escape编码。...主:原始模式是非常实用的,例如:正则表达式需要原始模式 除了Python标准的编码,Python提供了完整的方式从一个已知的编码建立Unicode编码。

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    Python】1“Hello,Python!”

    Python简介 Python的由来 Python是著名的“龟叔”Guido van Rossum在1989年圣诞节期间,为了打发无聊的圣诞节而编写的一个编程语言。...发展方向选择性多 Python的缺点: 运行速度慢 代码不能加密 安装Python3.6 我在张雪峰老师的博客里学习,在他提供的云盘下载了MacOS的Python3,并安装。...△ 因为macOS已经装了了Python2.7,所以我在终端键入“Python”时,即进入Python的交互式界面,在我安装了Python3.5后,再键入“Python”依然显示2.7版本,这让我折腾了好一会...△ 最后我在教程最后一行看到“MacOS 键入 Python3 即可进入Python3.6版本的交互式界面”。 第一个Python程序 ?...##至此,我将坚持Python的学习以及通过写博客来记录学习过程。

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    PythonPython模块基础

    1、模块的四种形式 在Python中,总共有以下四种形式的模块: 自定义模块:如果你自己写一个py文件,在文件内写入一堆函数,则它被称为自定义模块,即使用python编写的.py文件 第三方模块:已被编译为共享库或...自定义模块,将我们自己程序中用到的公共功能,写入一个python文件,然后程序的各部分组件可以通过导入的方式来引用自定义模块的功能。...\Python38\python38.zip # C:\Python\Python38\DLLs # C:\Python\Python38\lib # C:\Python\Python38 # C:\PycharmProjects...python文件总共有两种用途,一种是执行文件;另一种是被当做模块导入。 每个模块都有一个name属性,当其值是'main'时,表明该模块自身在运行,否则是被引入。...在导入一个包的时候,Python 会根据 sys.path 中的目录来寻找这个包中包含的子目录。

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