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Vina 1.2.0 --一次10年的更新

AutoDock4.2 和 Vina 打分函数 支持多配体同时对接和虚拟筛选的批处理模式 支持大环分子 水合分子对接 可以写出以及导入 Autodock 的 maps Python3 binding Apache...新的对接手段 同时多个配体对接 水合对接 , 配体与受体之间含有水的相互作用时 AutoDock4 Zn ,可以提供一个特殊力场用于含有 Zn 的 ligand 进行对接 大环化合物构象采样 python...接口 案例: 软件准备 安装 vina 使用 conda, 推荐这样省时省力 conda create -n vina python=3 conda activate vina conda install...-o 1iep_receptor.pdbqt 配体准备 mk_prepare_ligand.py -i 1iep_ligand.sdf -o 1iep_ligand.pdbqt --add_hydrogen...AutoDock Vina 1.2.0: New Docking Methods, Expanded Force Field, and Python Bindings. ChemRxiv.

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