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    Python作图三维等高

    技术背景 对于等高线,大家都是比较熟悉的,因为日常生活中遇到的山体和水面,都可以用一系列的等高线描绘出来。而等高面,顾名思义,就是在三维空间“高度一致”的曲面。...等高线作图 如果是Python中画等高线,这个用Matplotlib就可以实现,这里就直接放一个Matplotlib的官方示例: import matplotlib.pyplot as plt import...]]+gap) ax.set_xlabel('X') ax.set_ylabel('Y') ax.set_zlabel('Z') plt.show() 但是因为画出来的效果也是比较一般..., file=save_file) except ValueError: # 导出图片需要依赖kaleido环境 os.system('python3...但是我们可以把这个密度投影到一个三维的等高曲面上,这个曲面就称为等高面。本文介绍了一个python中性能比较好的画等高面的工具:Plotly。

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    单细胞等高线图

    等高线也可以看作是不同海拔高度的水平面与实际地面的交线,所以等高线是闭合曲线。在等高线上标注的数字为该等高线的海拔。...流式等高线图   流式等高线图与流式散点图相似,一张流式等高线图也能同时显示两个通道的信息,所不同的是,它借助地理等高线图的形式。...下图显示的是正常C57小鼠脾脏淋巴细胞分群的流式等高线图。 单细胞等高线图 其实单细胞数据也可利用等高线图来做展示,今天小编就来给大家演示一下。...Seurat) library(ggplot2) library(patchwork) #加载pbmc3k这个seurat对象 pbmc=readRDS("pbmc3k_final.rds") #绘制UMAP...DimPlot(pbmc) UMAP如下: 接下来我们来用ggplot2这个包里面的geom_density_2d()来绘制等高线 首先需要先准备一下数据格式 #获取每个细胞UMAP的横纵坐标值

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    R可视乎|等高线图

    简介 等高线图(contour map) 是可视化二维空间标量场的基本方法[1],可以将三维数据使用二维的方法可视化,同时用颜色视觉特征表示第三维数据,如地图上的等高线、天气预报中的等压线和等温线等。...使用ggplot2包中的geom_tile()或者geom_raster()绘制热 力分布。...添加等高线 使用geom_contour()在上图基础上添加等高线,同一轮廓上的数值相同。...添加等高线的具体数值 在上面的基础上,利用directlabels包的direct.label()添加等高线的具体数值,从而不需要颜色映射的图例,同一轮廓上的数值相同。...本篇视为《R语言数据可视化之美》学习笔记,并进行函数详细介绍与解释,其他可视化可参考在菜单命令中搜索得到。对应代码与相关数据,请在我的github中获取(文末原文)。

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    Python学习笔记之Matplotlib模块入门(直线图、折线图、曲线图、散点图、柱状、饼状、直方图、等高线图和三维的绘制)

    什么是Matplotlib Matplotlib 是一个Python的 2D绘图库。通过 Matplotlib,开发者可以仅需要几行代码,便可以生成绘图,直方图,功率谱,条形,错误,散点图等。...Matplotlib是Python的库,又是开发中常用的库。 2....绘制柱状 使用bar函数可以绘制柱状。柱状需要水平的x坐标值,以及每一个x坐标值对应的y坐标值,从而形成柱状的。柱状主要用来纵向对比和横向对比的。...绘制等高线图 【示例】使用pyplot绘制等高线图 # 导入模块 import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np # 生成100个-10-10之间的等差数列..., 10, 100) # 计算出x,y相交的点X,Y X, Y = np.meshgrid(x, y) # 计算Z Z = np.sqrt(X**2 + Y**2) # 计算括号内值的开方 # 绘制等高线图

    4.1K21

    工具 | R语言数据可视化之数据分布(直方图、密度曲线、箱线图、等高线、2D密度)

    数据分布简介 绘制基本直方图 基于分组的直方图 绘制密度曲线 绘制基本箱线图 往箱线图添加槽口和均值 绘制2D等高线 绘制2D密度 数据分布简介 中医上讲看病四诊法为:望闻问切。...直方图的分组和本系列前面一些博文中讲的一些分组不同,它不能进行水平方向的堆积 – 这样看不出频数变化趋势;也不能进行垂直方向的堆积 – 这样同样看不出趋势。...绘制2D等高线 本例选用如下测试集: ? 绘制2D等高线主要是调用stat_density()函数。这个函数会给出一个基于数据的二维核密度估计,然后我们可基于这个估计值来判断各样本点的”等高”性。...接下来首先给出各数据点及等高线的绘制方法,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 也可以通过设置密度函数美学特征集中的colour参数来给不同密度的等高线着色,R语言实现代码如下: ?...绘制2D密度 本例选用如下测试集: ? 等高线图也是密度的一种,因此绘制密度等高线图用的是同一个函数:stat_density(),只是它们传入的参数不同。

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