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    Nat. Biotechnol. | 用于单细胞组学数据概率分析的Python库

    本文介绍由美国加州大学伯克利分校计算生物学中心的Nir Yosef为通讯发表在 Nature Biotechnology 的研究成果:本文作者提出了scvi-tools,这是一个用于对单细胞组学数据进行深度概率分析的 Python 库。此工具主要作用是整合多种概率模型,并解决不同概率模型之间接口不一致的问题。它集成了多种高效的概率方法,涵盖多项基本分析任务,可通过标准化、易于使用的界面访问并接入到Scanpy、Seurat和Bioconductor工作流程中。通过这种标准化方式,开发人员能够在不同模型之间开发新功能。它还为以scvi-tools为基础的可扩展软件构建块提供了一个开发环境,在该环境中,可以有效地开发、基准测试和部署用于单细胞组学的新概率模型。

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