bedtools intersect可以对两个基因组特征 (genomic features) 进行overlap，找到两者重合的区域。...默认用法为： bedtools intersect [OPTIONS] -a \ -b \ -b 其中a和b提供的文件为BAM/BED/GFF/VCF格式...下边举例几种常见用法： 1.默认 默认情况下取两个文件的交集区域： cat A.bed chr1 10 20 chr1 30 40 cat B.bed chr1 15 18 intersectBed
墨墨导读：MySQL EXPLAIN下 Using intersect交集。...一次优化的过程中，MySQL执行计划选择了单独的3个二级索引中的2个索引，通过Using intersect算法进行index merge操作。从字面意义来上intersect就是 交集的意思。...MySQL没有intersect这样的语法，但EXPLAIN使用索引交集的算法。...其中Using intersect 就是一种。 ?...通过intersect分析，MySQL完全可实现intersect语法的支持，希望后续8.0版本里把这部分加进去。
核心代码 bedtools intersect -a A.bed -b B1.bed B2.bed [-wa or -wb -v ] > A[B].bed intersect 图解“A intersect...“A intersect B (-wa)”只显示了数据集A中与B交集的部分。“A intersect B (-v)”则展示了数据集A中不与B重叠的部分。"...格式与性能参数 -ubam：输出未压缩的BAM文件，默认输出压缩的BAM。 -bed：如果使用BAM输入，则将输出写入为BED格式。 -sorted：对已排序的输入使用"chromsweep"算法。...这些参数提供了丰富的功能选项，可以满足基因组区间重叠分析的各种需求 bedtools intersect 常用代码操作 #1输出A和B有交集的区域 bedtools intersect -a A.bed...bedtools intersect -a A.bed -b B.bed -wa -wb > AoverlapB.bed #5只输出文件A中不与文件B重叠的特征 bedtools intersect
DATE_FORMAT(date，format)：根据参数对date进行格式化。...2016 -> 16th 16 Sat 16 01 Jan 016 -> 22 22 10 10:23:00 PM 22:23:00 00 6 -> 2016-01-16 22:23:00 format的格式都列出来...Saturday ) %U 星期(0……52), 这里星期天是星期的第一天 %u 星期(0……52), 这里星期一是星期的第一天 %% 字符% ) TIME_FORMAT(time,format)： 具体用法和
符 号 描述 %c 格式化字符及其ASCII码 %s 格式化字符串 %d 格式化整数 %u 格式化无符号整型 %o 格式化无符号八进制数 %x 格式化无符号十六进制数 %X 格式化无符号十六进制数（大写...） %f 格式化浮点数字，可指定小数点后的精度 %e 用科学计数法格式化浮点数 %E 作用同%e，用科学计数法格式化浮点数 %g 浮点型数据 会去掉多余的零 至多保留6位 %G 浮点型数据 会去掉多余的零...0 显示的数字前面填充'0'而不是默认的空格 % '%%'输出一个单一的'%' (var) 映射变量(字典参数) m.n. m 是显示的最小总宽度,n 是小数点后的位数(如果可用的话) format用法...'g' - 一般格式。将数值以fixed-point格式输出。当数值特别大的时候，用幂形式打印。 'f' - 浮点数。将数字以浮点数形式输出，默认6位小数。 'n' - 数字。...format(20)) 20.000000 >>> print('{:n}'.format(20)) 20 >>> print('{:%}'.format(20)) 2000.000000% format的用法变形
+{id},' 使用上面的语句，可以查询出来 用FIND_IN_SET() 更简单 SELECT * FROM linkinfo WHERE FIND_IN_SET('1',pingid 原来以为mysql
背景 有这么一张表，记录名字和分数，现在需要按照成绩排名，存在并列名次的情况 解决方法 思路：按照score从大到小排序，第一行数据就是第一名，第二行就是第二名...
not exists 是exists的对立面，所以要了解not exists的用法，我们首先了解下exists、in的区别和特点： exists : 强调的是是否返回结果集，不要求知道返回什么, 比如：
#去重复查询DISTINCT mysql> select * from student; +------+------+------+ | uid | name | age | +------+--...26 | | 4 | ccc | 20 | | 4 | ccc | 30 | +------+------+------+ 5 rows in set (0.00 sec) mysql...name | +------+ | hong | | aaa | | bbb | | ccc | +------+ 4 rows in set (0.00 sec) #使用AND和OR进行多条件查询 mysql...> select * from student where uid=5 and age<30; Empty set (0.00 sec) mysql> select * from student where...age | +------+------+------+ | 5 | eee | 31 | +------+------+------+ 1 row in set (0.00 sec) mysql
Mysql中REPLACE INTO用法，判断数据是否存在，如果不存在，则插入，如果存在，则先删除此行数据，然后插入新的数据 MySQL replace into 用法 在向表中插入数据的时候，经常遇到这样的情况...MySQL 中实现这样的逻辑有个简单的方法： replace into replace into t(id, update_time) values(1, now()); 或 replace into ...MySQL replace into 有三种形式： replace into tbl_name(col_name, ...) values(...) replace into tbl_name(col_name...另外，对于那些没有给予值的列，MySQL 将自动为这些列赋上默认值。...官方文档参见：https://dev.mysql.com/ 图片 首发链接：https://www.cnblogs.com/lingyejun/p/16884215.html
创建多列索引：ALTERTABLE people ADD INDEX fname_lname_age (firstname,lastname,age); 由于索引文件以B-树格式保存，MySQL能够立即转到合适的...MySQL只需一次检索就能够找出正确的结果！在没有扫描数据文件任何一个记录的情况下，MySQL就正确地找出了搜索的目标记录！ ...下面是MySQL文档关于ref连接类型的说明： 对于每一种与另一个表中记录的组合，MySQL将从当前的表读取所有带有匹配索引值的记录。...在本例中，MySQL根据三个常量选择行。 rows： MySQL所认为的它在找到正确的结果之前必须扫描的记录数。显然，这里最理想的数字就是1。...=…）,mysql将无法使用索引 类似地，在SQL里使用了MySQL部分自带函数，索引将失效，同时将无法使用 MySQL的 QueryCache，比如 LEFT(),SUBSTR(), TO_DAYS
我们如果想查询这张表里面age为11和1的人该怎么办呢？ 那么我们的 in 操作符就起作用了： SELECT * FROM table1 WHER...
判断上周日期的地方按下面写才不会有跨年的BUG： yearweek(sequence_date,1)=yearweek(DATE_SUB(now(),INTERVAL 7 DAY),1) 5.按分隔符取子串 例如，原始字符串格式如下
在shell脚本中经常会需要获取当前日期的地方，linux的系统时间在shell里是可以直接调用系统变量： 获取今天时期---date +%Y%m%d 或 da...
将特定字符串转换成Date格式 可以通过 new 一个 SimpleDateFormat 对象，通过对象调用parse方法实现 示例代码： String time = "2019-11-09"; SimpleDateFormat...dateTime = simpleDateFormat.parse(time); } catch (ParseException e) { e.printStackTrace(); } 将Date格式转化成特定字符串...System.out.println(sdf.format(date)); } } 注意：SimpleDateFormat 12小时制和24小时制的区别 使用SimpleDateFormat时格式化时间的...yyyy.MM.dd 为年月日； 如果希望格式化时间为12小时制的，则使用hh:mm:ss； 而如果希望格式化时间为24小时制的，则使用HH:mm:ss；
另外还有CROSS JOIN(笛卡尔积)，个人认为如果要理解MySQL中JOIN的各种连接，只需要理解笛卡尔积就足够了。
MySQL 的 case when 的语法有两种： 简单函数 CASE [col_name] WHEN [value1] THEN [result1]…ELSE [default] END 搜索函数
key_len的计算首先和字符集相关，如果是字符集是latin1，则一个字符占一个字节；如果是utf8则一个字符占3个字节；并且，如果类型是 varchar这种...
我的数据库信息 在环境搭建好的情况下仔细阅读下面代码，基本都是固定格式，需要改的地方很少 using System; using MySql.Data.MySqlClient;//新引入的命名空间 using...tabuser"); //重点，重点，重点，更新真正的数据库 sqlCon.Close(); sqlCon = null; } } 最后，我感觉我不喜欢这种用法
今天在工作的过程中碰到一个问题，要把数据库中某个列的所有值中含有"ceshi.test.com"的字符去掉，本来可以写个脚本，把所有的值都取出再导入进行处理，但是那样就效率非常低了，想到看试下能不能直接在MySQL...中用SQL语句直接来处理，就想到mysql的replace函数。...mysql replace用法 1. replace into replace into table (id,name) values('1','aa'),('2','bb'); 此语句的作用是向表...replace用法举例： 应用场景： 游戏数据库新服初始化没有更改组号id，开服后用户id全为初始化组号。 导致问题： 可能导致合服时出现重复id。
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