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如何在AWS linux操作系统中安装trimmomatic、bowtie2、samtools、seqtk等生物信息库?
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我找不到一种方法在基于AWS linux的操作系统中安装Bioinformatics和其他受支持的软件包,而这些软件包在ubuntu中工作,他们的文档显示它们支持基于linux的操作系统。有什么命令可以解决这个问题吗?
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提问于2021-04-22
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什么是熵饥饿
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我在看书时迷路了 “了解Linux在熵饥饿期间的行为(并能够找到原因)使我们能够有效地使用服务器硬件。” 在中。然后,我在linux的上下文中使用了'‘的含义。但是,仍然不清楚“熵饥饿”是什么以及上面引用的句子的含义。
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提问于2014-01-06
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生物信息学最好的操作系统?
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生物信息学工作最好的操作系统是什么?大多数工具是针对64位Windows,还是针对Linux/Unix,还是针对OS X?
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提问于2009-04-21
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语法的RAID技术是基于什么的?
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我很好奇Synology的RAID技术是基于哪个linux内核模块的。根据服务中心的说法,这似乎是MD+LVM,但我不太确定。或者文件系统上的RAID函数也是可能的。
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提问于2020-09-01
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几何对象代数计算软件?
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最近我开始对某种几何学感兴趣,在这种几何学中,物体是基于一组函数来描述的,这些函数是基于无理数的。 例如,考虑这个长方体: 长度: 📷 宽度: 📷 身高: 📷 是否有一个软件,你可以用一种让你代数计算它的体积的方式来定义这样的身体。 📷 )或者其他任何财产? 数字(例如4.54176.)你可以用电脑辅助设计软件,如OnShape,但这不是我要找的。 我主要使用(Fedora) Linux,所以开源解决方案将是最好的解决方案,但我也可以使用windows 10和付费软件,只要它是供个人使用,而不是一辆小型车价格的公司许可证。 因为我有一点编程经验(Python,R,Java),即使是一个库
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提问于2021-09-01
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如何发现系统中的任何问题?
我的问题很简单,我怎样才能对我的系统进行全面检查?我真的不知道是不是出了什么问题,但是有一些错误我无法按照在线步骤来修正,或者我甚至不确定是否需要担心。我在哪里可以检查我的系统怎么样了?或者有什么程序可以诊断我的系统?我知道GNU/Linux应该是非常可定制的,但我真的想知道我的机器是否有任何问题。
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提问于2022-08-30
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Linux平台上的伽罗瓦域计算
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Linux上有没有可用于伽罗瓦域积分的软件?
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提问于2010-12-20
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回答
带有冒号的XML语法意味着什么?
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什么是: <rd:...> </rd:.....> 在XML格式的RDL文件意味着和它的目的?请给我解释一下。我刚开始学这个。
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提问于2016-07-12
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在不同的arm工具链之间“转换”共享库
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我有两个共享库作为.so,使用工具链arm-bcrm-linux-gnueabi(A)创建,另一个设备使用工具链arm-linux-android-eabi(B),有没有办法将.so从工具链A“转换”到工具链B?我不能接触到源代码
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提问于2021-04-27
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在Java/J2EE和.NET中有哪些用于Cold聚变的库?
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我一直在coldfusion中做web应用程序,不久前,我需要为一个特定的web应用程序生成条形码,所以我搜索了其中一个结果: 在这个解决方案中,coldfusion利用Java的烧烤库生成条形码 在感冒文档中,我一直在读这样的东西: ColdFusion构建在一个与J2EE兼容的Java技术平台上。这使ColdFusion应用程序能够利用J2EE元素并与之集成。ColdFusion页面可以执行以下任何操作: 在页面上包括JavaScript和客户端JavaScript。 使用JSP标记。 与JSP页面进行互操作。 使用Java。 使用Java对象,包括JavaBeans
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提问于2010-09-14
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回答
R加载错误- libproj.so.13:无法打开共享对象文件:没有此类文件或目录
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我正在尝试安装CRAN群体遗传学软件包;但是打印了以下libproj.so.13错误: > install.packages("hierfstat") Installing package into ‘/home/ecoevo/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6’ (as ‘lib’ is unspecified) trying URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/hierfstat_0.04-22.tar.gz' Content type 'applicatio
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提问于2020-05-19
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自动移除尝试做什么?
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Seuraavat paketit POISTETAAN: libevent-core-2.1-7 libevent-pthreads-2.1-7 libmecab2 linux-headers-5.4.0-52 linux-headers-5.4.0-52-generic linux-image-5.4.0-52-generic linux-modules-5.4.0-52-generic linux-modules-extra-5.4.0-52-generic mecab-ipadic mecab-ipadic-utf8 mecab-utils 为什么自动删除要删除这些包?我很确定我不应该
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提问于2020-11-17
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NAS新手:如何确保对Windows、Linux、Mac的网络存储进行加密(最好是在传输和使用中)
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我想为我的家庭办公室买一台~8TB的NAS* (我猜它被称为“私有云”)。 我想从Windows、Linux、Mac、Android和iOS连接到它。 如何确保网络存储在静止时加密(最好是在传输和使用中)? 我突然意识到,在我开始寻找要考虑购买的模型之前,我应该了解如何完成加密。 在我的Mac电脑上,我启用了FileVault,在我的Windows上,我启用了比特锁。 *也许类似于这,但我需要一个能与Windows、Ubuntu一起工作,并且能够更可靠地处理Machine备份的工具。基本上,我的目标是用一个安静的,高效的存储设备取代我的吵闹的桌面和它的驱动器。但我不想牺牲加密。
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提问于2022-08-29
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在密码学中应用LFSRs的最佳教材是什么(完全覆盖)?
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在密码学中应用LFSRs的最佳教材是什么(完全覆盖)? (除Beker &Piper的密码系统外)
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提问于2013-12-18
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我已经读过C编程语言了,我该怎么做呢?
我已经读过“C编程语言”了,我现在该怎么做?书中有没有什么重要的C语言遗漏了?我对Linux方面的开发特别感兴趣,那么关于Linux中的C语言,有什么我应该学习的重要知识吗?(我已经知道了一些基础知识)。 如果这个问题看起来有点笼统,我很抱歉,但我有点迷茫,不知道下一步要学什么。
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提问于2009-12-03
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我想学习打开Gnu/Linux上的手机手电筒。
我想打开我的手机手电筒从卡利Linux,但当我寻找有关它的任何东西,没有任何关于这个问题。有人在这个问题上有经验吗?
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提问于2020-03-22
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回答
在什么情况下,我将使用非默认的Java密码提供者?
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我的应用程序是一个web (Hibernate,Spring),没有移动客户端。我需要一个带有256个密钥大小的AES算法来保护后端表中的财务敏感数据。我对密码学很陌生。 除了Java密码体系结构之外,还有其他提供程序,比如Bouncy城堡。只考虑到AES。在Java密码API中,我看到了对它的支持。为了解决什么性质的要求,我应该考虑其他提供者,如Bouncy城堡或Jasypt?标准Java密码的限制是什么?
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提问于2014-05-09
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回答
Linux内核中的异步并行算法
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在Linux内核配置中,我看到以下选项: config CRYPTO_PCRYPT tristate "Parallel crypto engine" depends on SMP select PADATA select CRYPTO_MANAGER select CRYPTO_AEAD help This converts an arbitrary crypto algorithm into a parallel algorithm tha
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提问于2013-11-27
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回答
Python危险
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危险垫被认为是安全的吗? 下面是引用从他们的医生那里的一句话: 这是一个“危险材料”模块。只有当你100%确信你知道自己在做什么的时候,你才应该使用它,因为这个模块充满了雷射枪的地雷、龙和恐龙。 这是令人困惑的,因为没有进一步的解释。如果这句话是指it安全,那么就连谷歌也在用这个很有趣。
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提问于2018-10-06
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为什么我的Linux薄荷冻结?
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我正在运行Linux 32位。我的问题是操作系统随机冻结。当这种情况发生时,我唯一的解决方案就是按下笔记本电脑的电源按钮,因为我的笔记本电脑的按键、鼠标和触控板都无法工作或响应。我在64位和32位版本中都遇到了这个问题。 一些相关信息: sai@SRKheaven ~ $ inxi -Fxz System: Host: SRKheaven Kernel: 3.2.0-23-generic i686 (32 bit, gcc: 4.6.3) Desktop: Gnome Distro: Linux Mint 13 Maya Machine: System: Acer (portable
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提问于2013-06-28
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什么是系统生物学标记语言?
有人能总结一下SBML是什么吗?这个首字母缩写代表什么,它的目的是什么?我听说它跟系统生物学和计算生物学有关?它用于什么类型的计算生物学?
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提问于2020-02-08
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1
回答
如何将我的服务器上传到虚拟机上?
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我有两个服务器在本地工作。第一个是Vuejs的前端,第二个是在水瓶中的后端.我从客户端请求api到第二个api。 我必须将这两者上传到远程Linux (Debian)上,为此我有凭据,可以通过PuTTy成功地连接它。 如何将我的两个目录传输到VM? 然后,我应该更改客户机用于服务器的api请求的地址,仅此而已?不然我就得做点别的了?
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提问于2021-01-05
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2
回答
计算集群与单个工作站的功率
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以同样的价格我们可以得到任何一个 工作:2x6核心Xeons 3.4GHz,128 is,600 is RAID 0 = 12芯,128 12 或 集群8x (4核i7 3.4GHz,16 i7,250 i7,Intel 82579 i7),千兆以太网网具交换机 = 32芯,128 32 哪种更好些呢?更多的失败等等?集群拥有3倍多的核心,这能弥补千兆以太网互连吗?(与同一总线上所有ram的工作站比较)。 它是用于运行自定义C程序,做生物信息学。 编辑这是一个真正的问题,因为想要它的人来询问这两个问题,工作站和"Linux集群“~ as 5000。通过网络搜索,我发现i7是80 80G
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提问于2012-02-02
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1
回答
更新Ubuntu中的回购问题
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在更新安装的Ubuntu或其他Linux的存储库索引文件(用sudo apt-get updates)以获得系统的一部分软件时,您对11到14 MBs的数据有什么看法? 不管你们认为Ubuntu和其他Linux操作系统有什么不好的地方,很多人因为带宽太慢而讨厌这个东西(更新)他们的系统。 所以我认为Ubuntu和其他Linux操作系统尽快改进它会更好。我建议开发任何脚本,通过这些脚本,人们只能更新特定的存储库,而不是整个存储库。谢谢,如果它只发生在我的系统中,请告诉我。
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提问于2012-08-07
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5
回答
不能使用OpenSSL 1.0.2g和Python2.7在DockerAlpinLinux3.3中"pip安装加密“
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解决了哇,这些家伙很快..。基本上就是这个 --原来是发布了openssl的安全更新(溺水攻击),而该更新包含了一个意外的函数签名更改,导致了不兼容,所以这对我来说只是运气不好。 我需要在运行Alpine的Docker容器中使用pip install cryptography。实际上,它是另一个模块,service_identity,但问题在于cryptography模块,它是一个依赖项。 我有下面的Dockerfile FROM alpine:3.3 RUN apk --update add build-base libffi-dev openssl-dev python-dev py-
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提问于2016-03-02
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回答
如何实现基于WPF 3D的刚体动力学
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我目前正面临使用C#的WPF 3D的问题。简单地说,我需要动一些简单的机械部分,只移动其中的两个(一次一次,或者两者同时移动)。下面是一幅描述情况的简单图: 因此,通过垂直移动(翻译) P1或/和P2部件,整个事物需要相应地移动。 我想,通过计算大量的角度并应用大量的转换是可能的,但这不是我的目标。 因此,我可以想象一些东西,比如用一个枢轴点把零件连接在一起。 使用WPF 3D预览它的首选方法是什么?
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提问于2014-03-05
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如何学习必要的人类学知识来创建社交软件?
Joel Spolsky今天一遍又一遍地重复着这一点,了解一点人类学知识对程序员来说非常有用,因为许多正在创建的东西都是社交软件。 已经了解计算机科学的人如何学习了解人类如何工作所需的人类学?有书吗?有什么讲座的录音吗?
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提问于2009-05-17
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1
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加密主数据Linux分区,使其只能由唯一的系统访问
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如何对Linux内部磁盘进行加密,使其只能通过安装在USB驱动器上的唯一系统(预装的Debian斗牛眼)访问?即使有人有加密密码和物理访问,没有USB驱动器持有其他系统,他不应该能够访问它。 有办法这样做吗?
浏览 0
提问于2021-12-03
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3
回答
是否有离线地图层可供传单使用?
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是否有离线地图层可供传单使用?我不需要细节,但基本几何学就足够了。
浏览 2
提问于2015-12-22
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1
回答
给出了错误
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我是博士的新手,我有一个很简单的问题。我希望我的应用程序在Linux系统上工作,但是我正在用Windows.So编写应用程序,我需要安装Docker还是Linux? 如果我在Linux上使用Docker运行,我无法选择在windows中运行,而且会失败(我知道这可能是其他一些无关的错误),但我需要确认我的方法是否正确。 我为Linux安装Docker是对的吗?另外,如果我打算搬到AWS,我需要什么码头在这种情况下。 谢谢
浏览 3
提问于2018-04-28
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1
回答
R中的pgmm函数和gmm函数
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关于R中的这两个函数,我有一个非常基本的问题。 当我尝试使用广义矩量法进行面板数据分析时,我意识到gmm和pgmm都是这种方法的函数。它们之间的区别是什么?我是否应该为面板数据使用pgmm one而不是gmm (我想做不同的GMM估计)? 提前谢谢你!
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提问于2020-05-13
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3
回答
推荐从事密码学工作的技巧
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首先,如果这是一个不恰当的问题,请允许我道歉。让我也要指出,我绝不寻求一个全面的答案,只是你的想法,什么是一个宝贵的资产,一个公司,如美国国家安全局。我是一名在美国的数学学生,我意识到解决问题的思维至少是上述问题所必需的。 其他一些我认为有帮助的回答包括课程作业,相关的编程语言,以及有用的书籍。我目前正在读施耐尔的书(原文如此?)应用密码学。
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提问于2013-05-24
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2
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学习系统安全的好资源列表是什么?
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我对学习系统安全很感兴趣。我正在考虑在我的一台空闲机器上安装Damn Vulnerable Linux进行测试。有人有什么建议,阅读,方法或教程吗?
浏览 1
提问于2011-05-14
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1
回答
在库本图安装日语
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我学日语,所以能在电脑上打字是很有帮助的。 我已经安装了iBus,在本地设置下,我安装了日语,尽管它只给了我翻译的选项。我进入了iBus,并试图添加日语,选项在那里,但不能选择。 我该怎么解决这个问题?
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提问于2012-03-15
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2
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为什么在引导过程中需要加载固件?
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我见过包含WiFi卡固件的软件包。 此外,在Debian安装期间,它要求我加载非自由固件。否则我的WiFi卡就不能用了。 Linux似乎在引导时加载了这个固件。 但是如何在引导过程中加载固件呢? 我知道路由器和显卡都有固件。但它存储在非易失性存储器(闪存)中。 那么,在引导过程中如何需要加载固件呢?它似乎被加载到易失性存储器(RAM)中。为什么它不像其他固件那样存储在闪存中呢?
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提问于2020-02-17
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为什么在密钥长度超过一定长度的情况下使用加密会受到限制?
我正在编写一个java程序来加密使用256位AES加密的消息,但我得到了illegal key size error,我读到我必须使用一些JCE无限强的权限策略文件来加密/解密密钥为256位或更长的消息,但我不明白为什么使用密钥大小有限制?为什么在Java中默认禁用256位加密? 使用256位密钥加密/解密文件是犯罪吗?
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提问于2014-11-28
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1
回答
在将C代码从一个操作系统移植到另一个操作系统时处理静态库
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我一直在windows机器上编写一些C代码,现在我正在将它传输到Linux计算机,在那里我没有完全的权限。在我的代码中,我链接到几个静态库。 ,这些库需要为Linux计算机重新构建吗? 有关图书馆是GSL-1.13科学图书馆。 附带的问题是,有谁有上述Linux的预编译版本吗? 我尝试过使用automake在Linux机器上编译源代码,但是似乎没有创建makefile,也没有输出错误。 谢谢
浏览 8
提问于2013-09-12
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6
回答
受生物启发的软件
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我想知道有没有人知道任何利用生物学的软件技术?例如,在机器人的世界里,有很多,但是软件呢?
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提问于2009-11-28
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1
回答
澄清“神器”的含义
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我读过很多关于“工件”的定义,因为它属于it /软件世界。 在看了维基百科的和其他之后,我仍然很困惑。 当您卸载软件时,留下的任何部分都被认为是工件,这是公平的吗?(文件、注册表项、数据库记录等)
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提问于2016-01-04
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1
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密码学的子领域是什么?
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密码学的子领域是什么?在维基百科上,我只能找到一个子字段:纸巾 是否还有其他子字段,它们是否都已定义?
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提问于2016-09-08
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2
回答
2012R2存储空间内存和CPU需求
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我正在考虑可能使用Server2012R2中的存储空间来构建NAS。我希望在一个类似于安装的"RAID10“中构建一个相当大的单元,12-14个HDD(我知道存储空间不做RAID10,但类似的事情),使用SSD进行缓存。 我希望在未来可能会把另一个外部JBOD外壳挂起来,比如"RAID5-6“。 我不打算做减压或去复制。 我的问题是,我想要什么样的硬件?一个小西恩或奥普特隆能处理吗?或者我应该拍摄一个更大的2.4GHZ+ Xeon 4核心HT,或12核心Opteron,甚至去双cpus?系统需要多少内存才能达到最佳性能?我一直在为存储空间的设置搜索微软的硬件指南,但是我一直找不
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提问于2014-01-29
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1
回答
为什么linux内核使用linux代码来消除二进制blobs呢?
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我问这个问题是因为我很好奇Linux内核中的二进制blobs是否提供了某种性能优势。 既然许多这些问题已经被linux-libre中的代码所取代,那么为什么没有将相同的代码合并到kernel.org的Linux内核中呢?
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提问于2010-11-05
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1
回答
拒绝持枪拉链的权限
我正试着按照软件的安装说明: cp SOFTWARE-yyyymmdd.linux.tar.gz /usr/local/. cd /usr/local gunzip -c SOFTWARE-yyyymmdd.linux.tar.gz > SOFTWARE-yyyymmdd.linux.tar 但是,当我尝试这样做时,我会得到以下错误: -bash: SOFTWARE-yyyymmdd.linux.tar: Permission denied 这里有什么问题吗?
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提问于2017-08-22
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3
回答
组织生物信息学项目的最佳方法?
、
我来自计算机科学。背景,但我现在在做基因组学。 我的项目包括很多生物信息学,通常涉及:调整序列、比较序列之间的重叠等,以及不同类别的生物样本、时间过程数据、、高通量测序(,虽然实际上是目前的一代)数据,这类数据。 这种分析的工作流程与我在计算机科学研究中所经历的完全不同:没有UML和精心设计的对象,它们闪耀着崇高的优雅,没有版本管理,没有适当的文档(通常根本没有文档),根本没有软件工程。 相反,每个人在这个领域所做的都是逐个删除一个Perl-脚本或-一行,通常用于一次使用。 我认为原因是输入数据和格式变化太快,问题需要尽快回答(截止日期!),似乎没有时间进行项目组织。 举一个例子来说明这一点:
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提问于2010-09-21
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1
回答
使图像中的文本更薄用于OCR
、
我正在Ubuntu上用Python制作一个自动文本识别脚本。 我使用的是,识别渲染太低了。 例: 输出:_O4_4E34E_4_O4_ 我认为图像中的类型太粗体了,所以我想问是否有一种方法可以使用python库或linux命令使其更薄。
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提问于2014-01-13
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1
回答
什么能阻止视频卡在Linux上被充分利用?
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为什么视频卡在Windows上有更好的质量?Linux有什么东西可以阻止视频卡被充分利用吗?怎样才能从Linux上的显卡中得到最好的图形呢?
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提问于2013-04-20
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1
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为所有PostgreSQL系统构建Linux13.1可重定位包
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PostgreSQL曾经为Linux x86_64版本10.15之前的版本提供EDB包,比如postgresql-10.15-1-linux-x64-binaries.tar.gz。 现在我们想要将PostgreSQL升级到13.1版本,但它的EDB包不可用。 因此,我们希望使用documentation link创建我们自己的包。但是我们能够编译包,但它不包括所有必需的文件,如SSL的头文件和库,tar。 如何生成一个完整的可重定位包,如postgresql-10.15-1- Linux -x64-binaries.tar,以便在RHEL6/7/8SuSE,SLES12/15Linux版本
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提问于2020-12-10
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2
回答
在linux上安装cisco VPN客户端
、
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我目前正在使用Windows与Cisco VPN客户端版本5.0.01.0600 我想用Linux取代Windows,无论是RedHatVersion5.x还是6.x 我的问题是,为了与Cisco VPN客户端使用的同一个VPN网络完全兼容,我可以在Linux机器上安装什么等效的VPN软件。 在哪里可以下载用于Linux的Cisco VPN客户端版本5.0.01.0600?
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提问于2014-04-06
得票数 2
1
回答
在对我来说是新的生态系统中,有什么方法可以确保密码库是可靠的呢?
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密码学是一个核心的安全服务,通常被认为是一个很难得到正确的专业,除非你知道他们在做什么。此外,密码API的误用是横行,也是造成许多安全漏洞的原因。这个问题指的是使用密码库作为软件开发人员。 例如,在任何给定的语言(例如Python )中,我都在寻找一种合理的方法,从安全的角度来确定哪一种图书(Es)最适合使用。我听说并看到了pycryptodome,pycrypto,cryptography,PyOpenSSL,libnacl,python-nss等的页面.还有许多类似于其他语言的库。 我和另一个非生态系统的老手还不清楚,这些库中哪一个是最更新、最安全、最受支持的。显然,在所有加密服务都内置到
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提问于2022-06-26
得票数 10
1
回答
Orange中的推荐插件
、
我想在本学期晚些时候在我的班级中探索推荐插件的使用。该附加组件不会出现在界面附带的列表中,但当我单击右上角的add-more,并键入Recommendation时,框中会出现一个列表以及相关的版本号,当前为0.3.1。 我选择安装,Orange告诉我重新启动程序,当我这样做时,小部件和部分建议在UI中不可见,附加组件在附加部分中也不可见。如果我再次输入"Add more“,我会看到它被选中,并提示它已安装。 是否需要调整设置才能通过UI显示此工具集?
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提问于2019-04-07
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