Linux 下可以使用 pdfunite 命令来合并多个 PDF 文件。如果你的 Linux 发行版上没有该命令，需要安装 poppler-utils（Debian 系）或 poppler（Arch 系）软件。pdfunite 命令的语法格式如下：
在 Linux 上合并和排序文本的方法有很多种，但如何去处理它取决于你试图做什么：你是只想将多个文件的内容放入一个文件中，还是以某种方式组织它，让它更易于使用。在本文中，我们将查看一些用于排序和合并文件内容的命令，并重点介绍结果有何不同。
合格的程序员都善于使用工具，正所谓君子性非异也，善假于物也。合理的利用 Linux 的命令行工具，可以提高我们的工作效率。
云豆贴心提醒，本文阅读时间7分钟 sort是什么 Sort是用于对单个或多个文本文件内容进行排序的Linux程序。 Sort命令以空格作为字段分隔符，将一行分割为多个关键字对文件进行排序。 请注意，除
Cat命令(concatenate的缩写)是Linux操作系统中使用最广泛的命令行实用工具之一。它是一个标准的Linux实用程序，用于查看文件的内容，而不需要在任何文本编辑器中打开它。cat命令的另一个主要用法是将多个文件串联到一个文件中。在Linux中还有其他几种cat命令的用法，我们将在本文中讨论这些用法，以便您了解它在不同场景中的工作方式。
ps命令能给出当前系统中进程的快照。下面我们列举几个常用的选项 使用 -a 参数。-a 代表 all。同时加上x参数会显示没有控制终端的进程。 ps -ax 通过我们会查找某类或包含某些指定关键字的进程，这是会使用管道结合grep命令来进一步过滤结果。 例如查找java相关的进程ps -ax | grep java 有时我们则需要根据CPU和内存的使用情况来过滤排序筛选结果，这样便于快速找到哪个进程最耗CPU、内存 ps -aux 根据CPU的使用升序排序 ps -aux --sort -pcpu 根据内存使用升序排序 ps -aux --sort -pmem 上述两个命令合并一起，如下： ps -aux --sort -pcpu,+pmem 只显示前几个进程，例如显示前十个，需要使用管道结合head命令。 ps -aux | head -n 10
paste命令用于合并文件的列，把文件内容列列合并。简单就是列追加，类似R中的cbind命令
Sort 是一个 Linux 程序，用于打印输入文本文件的行并按排序顺序连接所有文件。排序命令将空格作为字段分隔符，将整个输入文件作为排序键。重要的是要注意 sort 命令实际上并不对文件进行排序，而只是打印排序后的输出，直到您重定向输出。
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在Linux下，有时候需要对文本内容进行排序，例如按照字典顺序排序，按照数字排序或者按照特定列排序等等。今天我们就借助一个命令-sort来满足我们对文本排序的需求。
sort命令 sort命令用于将文本文件内容加以排序，可针对文本文件的内容，以行为单位来排序。 语法 sort [OPTION]... [FILE]... sort [OPTION]... --files0-from=F 参数 -b, --ignore-leading-blanks: 忽略前导空格。 -d, --dictionary-order: 只考虑空格和字母数字字符。 -f, --ignore-case: 将小写字符转为大写字符。 -g, --general-numeric-sort: 按一般数值进行
一、linux系统简介 》 图片 命令格式：命令+参数+文件 图片 举例 tar -zxvf Data.tar.gz 二、文件夹与文件管理命令 1.pwd：printworking dire
Linux 下可以使用 img2pdf 工具来将图片转为 PDF 文件。如果你的 Linux 发行版上没有安装 img2pdf，可以使用包管理器（Ubuntu 上的 apt、ArchLinux 上的 pacman 等）手动安装，或者直接使用 pip 进行安装 pip install img2pdf。img2pdf 的基本语法格式如下：
问题导读 1.Shell该如何学习？ 2.Shell和传统编程语言有哪些相同？ 3.Shell和传统编程语言有哪些不同? 4.你认为Shell还有哪些便捷的地方？ 由于行业的发展，对程序员的要求越来越
原文：https://opensource.com/article/19/10/advanced-awk
shell脚本可以让降低大家的工作强度，提升大家的管理能力和薪资报酬，还可以让大家有时间学习提升自己，更能让你有时间喝茶撩妹子。所以，学好shell那就是非常必要的啦，那么在学习shell之前我们得热热身，做一下准备工作了。
Linux是一个多任务、多用户的操作系统，因此它允许多个进程同时运行而不相互干扰，进程是Linux操作系统的重要基本概念之一，进程是程序的执行实例，在操作系统中执行不同的任务。Linux为我们提供了一个名为ps的实用程序，用于查看与系统上的进程相关的信息，它是process status进程状态的缩写，ps命令用于列出当前正在运行的进程，它们的pid以及一些其他信息取决于不同的选项，它从/proc文件系统中的虚拟文件读取进程信息，/proc包含虚拟文件，这就是它被称为虚拟文件系统的原因，process status命令ps显示有关活动进程的信息，类似于windows的任务管理器，每个操作系统的ps版本都略有不同，因此若要是需要获取详细情况则需要查阅操作系统的wiki。
linux中存在着管道，它是一个固定大小的缓冲区，缓冲区大小通常为1页，也就是4K字节。
linux文本处理命令是一类对文件进行操作的命令，通过使用文本处理命令，可以轻松的对文件进行排序，拆分，合并等操作,熟练掌握文本处理命令，在生物信息文本处理中，有十分重要的意义。
sort命令是在Linux里非常有用，它将文件进行排序，并将排序结果标准输出。sort命令既可以从特定的文件，也可以从stdin中获取输入。 语法：
在上一篇文章Linux系统入门系列之三：初识Bash中，我带大家初步认识了Bash这个Linux系统中的Shell，并学习了使用vim编辑、处理文本信息。事实上Bash拥有非常多的工具命令，并且很多工具命令已经集成化，可以完成多种多样的任务，就像Windows系统中的Office软件一样。接下来将带大家认识更多的工具命令以及数据的输入与输出，从而便以后各种生物信息数据的处理。
每个程序员，在职业生涯的某个时刻，总会发现自己需要知道一些Linux方面的知识。我并不是说你应该成为一个Linux专家，我的意思是，当面对linux命令行任务时，你应该能很熟练的完成。事实上，学会了下面8个命令，我基本上能完成任何需要完成的任务。 注意：下面的每个命令都有十分丰富的文档说明。这篇文章并不是来详尽的展示每个命令的各种功用的。我在这里要讲的是这几个最常用的命令的最常见用法。如果你对linux命令并不是很了解，你想找一些这方面的资料学习，那这篇文章将会给你一个基本的指导。 让我们从处理一些数据开始
1、列出当前系统上所有已经登录的用户的用户名，注意：同一个用户登录多次，则只显示一次即可
文件描述符是Linux系统内部使用的一个文件代号、它决定从哪里读入命令所需的输入和将命令产生的输出及错误显示送到什么地方。
Linux_文件查看、操作、统计命令 文件的6种看法 （1）head ：查看文件头10行 （2）tail：查看文件末尾10行 head / tail -n ：查看文件的前/后 n 行，默认 10 行 例如：head -n 2 Data/example.fq （3）cat：查看文本文件的内容，将文件所有内容输出到屏幕 常见参数 -A ## 打印所有内容，包括特殊字符，如制表符 -n ## 打印出所有行号，-b 参数仅打印非空白行行号 常见用法： cat #输入 cat > file1 #重定向，往fi
要对进程进行监测和控制，首先必须要了解当前进程的情况,也就是需要查看当前进程，ps命令就是最基本进程查看命令。使用该命令可以确定有哪些进程正在运行和运行的状态、进程是否结束、进程有没有僵尸、哪些进程占用了过多的资源等等.总之大部分信息都是可以通过执行该命令得到。
Linux常用命令中，除了cat还有很多其他用于文本查看的命令。本文将简单介绍一下这些文本查看的命令。
运行非常成功！结果正常输出！然后我就愉快地去重并call variant，但是当我查看g.vcf文件时发现样本名为W0
以行为单位对文本文件的内容进行排序，将结果显示在标准输出，比较原则是从行首字符向后，依次按ASCII码值进行比较，最后按升序输出。如果file参数指定多个文件，那么 sort 命令将这些文件纵向连接起来，当作一个文件进行排序。
作为一个后端开发者，Linux常用是必备的，不管是面试还是实际工作中，都是非常有用的。
精心整理了生物信息学中常用的 Linux 命令，很不容易。所有命令的用法都经本人亲自测试。掌握这些命令，是每一个生信人基本的自我修养。
作者精心整理了生物信息学中常用的 Linux 命令，很不容易。所有命令的用法都经本人亲自测试。掌握这些命令，是每一个生信人基本的自我修养。
二、管道 1.管道 （1）是什么? 命令从 标准输入 到 读取数据，并将 数据 发送到 标准输出 的能力，是使用了名为 管道 的 shell特性。 （2）管道操作符“|”（怎么做） 使用管道操
经过 uniq 命令的处理，重复的行被合并成一个，没有重复的行被保留，同时在行前面加上了出现的次数。
在许多UNIX说明文件里，都有RLF控制字符。当我们运用shell特殊字符">"和">>"，把说明文件的内容输出成纯文本文件时，控制字符会变成乱码，col指令则能有效滤除这些控制字符。
Linux以其强大的命令行称霸江湖，Shell命令是数据极客的必修兵器。探索性数据分析，在需求和数据都不太明确的环境下，使用各种命令进行一次探索与挖掘。从基础的文件查看到简单的统计，再到一些常用的探索性分析命令，其目的都只是为了更好的做数据分析与挖掘而已。 01 Shell命令行 对于经常和数据打交道的人来说，数据工程师应该也是常常和Linux打交道。Linux以其强大的命令行称霸江湖，因此，Shell命令也是数据极客的必修兵器。 利用Linux命令行的几个命令，就可以完成一些简单的统计分析工作，比如利用w
本文章总结了 21 条最频繁使用的 Linux 命令，也是面试官考察你对 Linux 系统熟不熟常问的面试题，可以收藏本文章，作为一个 Linux 命令速查手册。
文 | 豌豆 来源 | 菜鸟教程 豌豆贴心提醒，本文阅读时间5分钟，文末有秘密！ Linux col命令 Linux col命令用于过滤控制字符。 在许多UNIX说明文件里，都有RLF控制字符
sort命令在Linux里非常有用，它将文本文件内容进行排序，并将排序结果标准输出或重定向输出到指定文件。
语法： cut -d ‘分隔符’ [-cf] n [filename] （这里n是正整数） -d：指定分隔符号 -f：指定第几段 -c：后面只有一个数字表示截取第几个字符；后面跟一个数字区域，表示截取从几到几（该选项不和d，f共同使用）
可以看到，新的vcf文件的突变位点数量远大于旧的vcf文件。仔细查看新vcf文件，**发现是没有做基本过滤，比如测序深度大于20等等指标。**所以我就顺便把它过滤一波，代码如下：
虽然有点难度，但其实确实是可以的，对生信工程师来说，就是整理流程（把Linux命令替换成为R语言代码）工作量比较大。如果大家感兴趣而且确实有需求，不妨看看这个文档：《RNASeqR : RNA-Seq analysis based on one independent variable》
离线数据分析平台实战——130Hive Shell命令介绍 02（熟悉Hive略过） 导入数据 Hive的导入数据基本上可以分为三类， 第一种是从linux系统上导入数据到hive表中， 第二种是从hdfs上导入数据到hive表中， 第三种是从已有的hive表中导入数据到新的hive表中。 其中第一种和第二种语法基本类似； 在前面介绍的使用create table ... as... 命令创建表并导入数据，也属于第三种导入数据方法。 使用前两种方式导入数据，只是复制或者移动数据文件，并不会对数据的
碎碎念：今天马拉松入门课程已经结课了，而我才补课到12天，呜呼！原本觉得自己R学的很好想直接跳到转录组，没有linux的基础根本听不懂，还得一步一步慢慢来。直播课连上3小时已经很难坚持了，补课的时候没有互动更加难熬，唯一的好处是听不懂的地方可以反复拖回来看，只能用这个勉强安慰一下自己了(；′⌒`)
-d 制定分隔符，默认是tab空格，用 \t 表示，但不只可以指定标点符号位分隔符，也可指定字母或者数字等字符为分隔符；
linux shell 可以用户定义函数，然后在shell脚本中可以随便调用。shell中函数的定义格式如下
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