NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step)）、批次效应处理等内容。
另外，git 给出了可能需要的操作命令，git add/rm, gitcheckout --
最早Git是在Linux上开发的，很长一段时间内，Git也只能在Linux和Unix系统上跑。不过，慢慢地有人把它移植到了Windows上。现在，Git可以在Linux、Unix、Mac和Windows这几大平台上正常运行了。
$ yum install curl-devel expat-devel gettext-devel openssl-devel zlib-devel
GitHub实战系列汇总：http://www.cnblogs.com/dunitian/p/5038719.html —————————————————————————————————————————————————————— 很多人问，明明有git gui 和 github可以直接图形化操作的吗？全部指令干啥？？？ 呃(⊙o⊙)…呃(⊙o⊙)… ===> 装逼~ O(∩_∩)O~，开玩笑的，其实就是为了通用和熟悉git，linux里面照样这样用，多熟悉点基础指令很有用的， 如果觉得顿时不开心了、无爱了=
如果你想在 Linux 上用二进制安装程序来安装 Git，可以使用发行版包含的基础软件包管理工具来安装。 如果以Centos 上为例，你可以使用 yum：
Git 是一个免费的开源分布式版本控制系统，用于软件开发和其他几个版本控制任务。它旨在根据速度、效率和数据完整性来处理从小到大的项目。
1、使用git add filename ；可分多次使用，添加多个文件到暂存区
如果你用过Word文档写过文章，那么你一定会有这样的经历。 我觉得某一段或者某一句写得不够好，但是，删掉之后我可能会后悔把它删掉了，进而又想把删掉的段落找回来，这时，你想到了一个好办法，将每次的修改都作为一个文章版本保存起来，这样虽然能够解决你的问题。但是，随着你的修改次数越来越多，你会发现，电脑桌面上出现了N多个Word副本，这时，你已无法分清每个副本对应的是什么时候作的修改。 于是你想，如果有一个软件，不但能自动帮我记录每次文件的修改，还可以让同事协作编辑，这样就不用自己管理一堆类似的文件了，也不需要把文件传来传去。如果想查看某次改动，只需要在软件里瞄一眼就可以，岂不是很方便？ 既然有这样的想法，那么你就应该学习一下git。 那什么是git？ git是目前世界上最先进的分布式版本控制系统。 既然是最先进的，我们当然是要去学好它，掌握好它了。 那么，从该篇博客开始，我将记录git教程系列，作为学习资料提供给大家。
很多人都知道，Linus 在1991年 创建了开源的Linux操作系统，此后的三十多年里，Linux 系统不断发展，已然成为全世界最大的服务器系统软件了。
想删除一个段落，又怕将来想恢复找不回来怎么办？有办法，先把当前文件“另存为……”一个新的Word文件，再接着改，改到一定程度，再“另存为……”一个新文件，这样一直改下去，最后Word文档变成了这样。
注： 每部操作之后都可以使用“git status”查看当前状态，可以根据提示信息进行后续操作。
他们分别是Bash终端模式，GUI图形界面模式。个人建议使用Bash，一方面能够更加锻炼自己的动手能力，另一方面也为自己能够为操作Mac或Linux打下良好的基础，或实时的复习操作命令。当然，你也可以使用GUI界面。能够更加形象的查看文件状态及分支等，更简单的实现版本控制及项目管理
我们写代码写完后总要进行管理，以前写的很多代码虽然写的不是很好，但因为没有一个比较好的代码管理习惯，所以很多都遗失掉了，为此现在都还觉得很可惜，近来在学习使用git来进行代码管理，git是一个很强大的分布式版本控制系统。
学完这些基础的 Git 命令，你便可以一个人在 GitHub 上玩耍。Git 的命令上和 Linux 的命令操作有很多的相同之处，比如文件操作这一块吧，用 Git 创建文件夹和文件和 Linux 下命令都是一样的，在 Git 里面也有和 Linux 一样的 Vim 编辑神器，熟悉 Linux 的话对这个肯定不陌生，但这些都不是要说的重点，简单了解一下即可。下面的 Git 命令都有一个特点，就是命令的开头都是以 git 开头的。这些 Git 命令都是很常见的单词组合，使用过几遍后，记住也是自然而然的事，不信就往下看呗。
前言：在经过前面两篇学习，大家对Linux开发工具都有一定的了解，而在此之前最重要的两个工具就是vim，gcc。
git init会初始化一个空的仓库（empty Git repository，同时在我们执行git init后会在当前目录下自动创建一个.git的目录，这个目录是Git来跟踪管理版本库的。
GitKraken：面向Linux的Git客户软件 主页链接：https://www.gitkraken.com/ 2. Git-cola Git-cola是一种功能强大、易于配置的Git客户软件，面向Linux，它为用户提供了一种漂亮的GUI。它是用Python编写的，采用GPL许可证来发布。 Git-cola界面包括几个协作工具，它们可以根据用户需要来隐藏和重新排列。它还为用户提供了许多实用的键盘快捷键。 额外的功能特性包括如下：
要用Git，首先肯定要安装它。简要说一下Win，Mac和Linux三种平台的安装方法。 Windows Git的官网(http://git-scm.com)提供了Windows下Git客户端的安装包。也可以去msysGit项目的页面上下载： http://msysgit.github.com/ 安装好之后，你会得到一个Git的命令行工具Git-Bash和一个图形界面工具Git-GUI。在后面的教程里，会主要以命令行下Git的使用为主。掌握基本的命令之后，使用图形界面也就没什么问题了。 另外，GitHub提供
作为一名测试人员，在测试过程中，我们需要去部署测试环境，查看服务器上面的日志，登陆数据库，甚至做一些shell脚本类的工具开发，必不可少都会用到Linux命令。所以无论是开发还是测试，Linux命令已经成为常规操作，很有必要去学习。
git 是一个代码托管平台，它的创始人是大名鼎鼎的 Linux 之父： 林纳斯·托瓦兹，git的诞生可以使我们对已提交的代码历史版本进行回溯，这是一个十分重要的功能，除了查看历史版本外，git 还支持代码合并和打标签等诸多使用功能；简言之，有了 git 以后，我们可以随时随地的对代码进行管理
在上一篇有讲到，具体查看：Windows下git安装查看：https://blog.csdn.net/qq_31708763/article/details/82753846
简单说就是用于管理多人协同开发项目的技术。 没有进行版本控制或者版本控制本身缺乏正确的流程管理，在软件开发过程中将会引入很多问题，如软件代码的一致性、软件内容的冗余、软件过程的事物性、软件开发过程中的并发性、软件源代码的安全性，以及软件的整合等问题。 无论是工作还是学习，或者是自己做笔记，都经历过这样一个阶段！
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上篇文章我带着大家通过分析了一遍ASP.NET Core的源码了解了它的启动过程，然后又带着大家熟悉了一遍配置文件的加载方式，最后引出了依赖注入以及控制反转的概念！如果大家把前面几张都理解了，那么你也就入了ASP.NET Core的大门了。但是我们还需要一个版本控制工具来提高我们的编码效率。因此这篇文章我将带着大家了解下Git这个版本控制工具以及为什么选择它。 下面我们将通过故事的形式从Git的历史谈起，并讲述Git的强大之处。然后通过实战演练教你如何在Github以及码云上托管我们的代码并进行代码的版本控制。 这里还想说一句，这篇文章本来昨天就能发出来的，奈何出现了一点状况，所以今天才来写，为了不浪费大家的时间我会在文章的最后再来讲述原因，这里给大家说声抱歉了。 本篇文章已经收入.NET Core实战项目之CMS 第一章 入门篇-开篇及总体规划 有兴趣的朋友可以加入.NET Core项目实战交流群637326624 进行交流。
GitHub的是版本控制和协作代码托管平台。它可以让你和其他人的项目从任何地方合作。Git也是目前世界上最先进的分布式版本控制系统（没有之一）。最初编写用作Linux内核代码的管理。推出后，Git在其它项目中也取得了很大成功。Github目前已经有100多万的开发者，并且对于公共项目的托管免费。Github使得版本控制更加容易，多人协作编码变得简单。使用过SVN的同学应该知道，当没有网络的支持，开发者并没有办法提交已完成代码。Github支持离线提交，其实就是提交到本地仓库。每一个开发者clone下的项目代码都是一个完整的仓储，当远程或其他协作开发者代码无法恢复时，都可以方便使用本地的仓储进行恢复。当需要对代码进行分支时，其他版本控制软件在大量文件时会很慢，而Github几乎是瞬间完成这个操作，而且只需要一个命令即可。下面我们一步一步来搭建Github的环境（以windows操作系统为例）。
Git，最先进的分布式版本控制系统之一，最初是由Linux之父Linus为了更好管理开源Linux系统而开发的一个软件；
版本控制（Revision control）是一种在开发过程中用于管理我们对文件、目录或工程等内容的修改历史，方便查看更改历史记录，备份以便恢复以前的版本的软件工程技术。
上篇文章我带着大家通过分析了一遍ASP.NET Core的源码了解了它的启动过程，然后又带着大家熟悉了一遍配置文件的加载方式，最后引出了依赖注入以及控制反转的概念！如果大家把前面几张都理解了，那么你也就入了ASP.NET Core的大门了。但是我们还需要一个版本控制工具来提高我们的编码效率。因此这篇文章我将带着大家了解下Git这个版本控制工具以及为什么选择它。
Git是目前世界上最先进的分布式版本控制系统（没有之一），是程序员在公司工作必须具备的技能。
实际上,代码开发中也需要这样的软件来管理我们的代码. 例如我们经常会碰到如下的现象:
1991年，Linus创建了开源的Linux，世界各地的志愿者为Linux编写代码，但是绝大多数的内核维护工作，都花费在提交补丁和保存档案的繁琐事务上。这期间所有的源代码，都由Linus手工合并。Linus坚定反对CVS和SVN，因为这些集中式的版本控制系统，不仅速度慢，而且必须联网才能使用。
在网上，查了好多资料，不过网上说法有好多坑，所有自己特意写了一篇，以便看此博文的人少踩坑！！ #一、Git相关配置（Windows） ##1.安装git和git flow Windows下git客户端：Git-1.9.2-preview20140411.exe 参考文档，来自github的gitflow的wiki，链接：https://github.com/nvie/gitflow/wiki/Windows 这里只介绍msysgit环境下的gitflow安装。 首先需要下载两个文件：getopt.e
Linus（林纳斯）是一个伟大的黑客，曾就职于美国加州硅谷的一家科技公司，是Linux系统的创始人，坚持开源精神，竞争对手是微软。
相信很多初入编程的朋友们或多或少都听说过git的大名，毕竟github这个全球最大同性交友平台不是吹出来的。
开局先来一个故事吧，故事看完如果不想看枯燥无味的指令，或者说你已经熟练掌握git的使用了，可以直接跳到总结部分（一个好玩的游戏）去检验下你掌握的熟练程度。
Git知识点范围：基本常识 集中式版本控制系统：CVS、SVN； Git是分布式版本控制系统； 1991年Linus创建了Linux，2002年Linus又写了Git，2008年GitHub上线了； Git没法跟踪二进制文件word的改动，只能判断图像文件大小的改变； Linux哲学：没有消息就是好消息，说明运行成功了； 提交的-m是对提交的版本进行备注说明； 如果有文件被修改，用diff查看修改内容； git log查看版本记录，加上–pretty=online可以让显示记录更简明； 回退上一个版本：gi
持续集成是指开发者在代码的开发过程中，可以频繁的将代码部署集成到主干，并进程自动化测试
开局先来一个故事吧，故事看完如果不想看枯燥无味的指令，没关系我已经把这篇文章的内容录制成了一个视频，点击文末阅读原文就可以观看。或者说你已经熟练掌握git的使用了，可以直接跳到总结部分（一个好玩的游戏）去检验下你掌握的熟练程度。
• 轻量标签（lightweight）：本质上是将提交校验和存储到一个文件中，没有保存任何其他信息；
水电费在git中，我们使用git config 命令用来配置git的配置文件，git配置级别主要有以下3类：
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版本控制是一种记录一个或若干文件内容变化，以便将来查阅特定版本修订情况的系统。开发中，我们仅对保存着软件源代码的文本文件作版本控制管理，但实际上，可以对任何类型的文件进行版本控制。
因为在下是苦bee大学僧，经常去教室上课，mac又是放在宿舍里的，所以有些非单一场景独占的掩饰有时是mac终端，有时是Windows Git Bash，这两者除了外观不一样，基本操作都是一样的～～
$ sudo add-apt-repository ppa:git-core/ppa
比如：执行checkout -f 或 reset -hard 或 branch -d删除一个分支
Git 是一个免费并且开源的分布式版本控制系统，旨在快速高效地处理从小到大所有项目的版本管理。Git 是目前最流行的版本管理工具，目前绝大部分公司都是使用 Git 作为项目的版本管理工具。目前最火的开源社区 Github，就是基于 Git 版本控制系统，所以掌握 Git 技能很重要。由于 Git 开发效率高、团队协作方便，现在很多 IDE 都集成了 Git，并且提供一些相关的图形化操作。也有很多很优秀，专门用来简化 Git 操作的 Git GUI 工具，例如 Sourcetree，Tortoise 等。我刚接触 Git 的时候，就是从 GUI 入手的，使用 Sourcetree 可视化版本控制工具进行操作。Sourcetree 底层也是对常用的 Git 命令进行封装实现的，傻瓜式操作，使用非常方便，但是我用完什么都不懂，Git 的内部原理也不易理解，决定在回头仔细学习一下 Git 命令行。学习完 Git 命令行后发现，命令行很好学，非常灵活，而且使用起来非常帅气。因此，直接 Git 命令，才是最灵活的操作。
我使用的是 mac 系统，本文用到 tree、watch 命令，mac 默认是没有这两个命令的，需要先安装下这两个命令
1. Windows下载安装git 下载链接：https://git-scm.com/download/win 2.git环境变量设置及版本查看 添加环境变量： . 找到git文件夹下的cmd路径（shit + 鼠标右键 ： 复制文件所在地址） 如： C:\Program Files\Git\cmd .环境变量添加： 名：git 值：C:\Program Files\Git\cmd 2.查看git是否安装成功 cmd : git --version 3.vscode设置git路径 1. set
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