生信技能树学习笔记 图片 在读取一行文本时，会用预定的字段分隔符划分每个数据字段，并分配给一个变量 默认的字段分隔符是任意空白字符（如空格或制表符），也可以用 -F 参数自定义分隔符 $0 代表整个文本行...$NF 代表文本行中的最后一个数据字段 less -S Data/example.gtf | cut -f 9 | head less -S Data/example.gtf | awk -F '\t'...cat Data/example.gtf | awk '{print $9$10}' | head ## 直接连接 cat Data/example.gtf | awk '{print $9"@"$10...}' | head cat Data/example.gtf | awk '{print $9"\t"$10}' | head 匹配模式 cat Data/example.gtf | awk '/UTR...OFS=":"} {print NR,$9}' | head -5 awk 条件和循环语句 图片 ##判断第三列是否是基因 cat Data/example.gtf | awk '{if($3=="gene
awk中数组的使用。我们在其他语言中经常会使用到数组，awk中也可以使用。...示例如下： 与其他不同的是，awk中的数组元素值可以设置为”空字符串“，当设定某一个元素为”空字符串“时，打印出的值就是为”空“（注：”空格“不为”空“）。...在awk中，数组的下标不仅可以为”数字“，还可以为”任意字符“。...a有数值，则可以直接使用；如果a初始值默认设定为字符串或者空值，则计算时默认为0.之前我们如果引用了一个不存在的元素时，在print时候发现这个元素被赋值为空字符串。...综上，我们对一个不存在的元素进行自加运算后，这个元素的值就变成了自加运算的次数。例子如下： 统计某些文本出现的次数。
Linux 命令 awk命令解析 awk 命令是一种强大的文本处理工具，它可以根据指定的模式对文本进行处理、分析和格式化。...awk 的一般形式如下： awk 'pattern1 {action1} pattern2 {action2}...' filename pattern 是模式，用来匹配处理文本的内容； action...为方便读者理解，林一写个具体的 demo 现有有一个文件 linyi.txt，格式如下，计算文本文件中第一列数字的和： 1 abc 2 def 3 ghi 可以使用以下 awk 命令： awk '...Linux 命令 awk 命令注意事项 读者需要注意模式和动作的书写顺序不能颠倒；模式和动作可以省略，但大括号不能省略。 awk 命令还有许多内置变量和函数，可以用于进一步处理文本。...awk 命令还支持正则表达式，可以用来匹配复杂的文本模式。
awk是Linux三剑客之一，在我们处理文件等方面还是特别方便的 介绍 我们先来说一说awk是用来干什么的，awk是一个强大的文本分析工具，相对于grep的查找，sed的编辑，awk在其对数据分析并生成报告时...通俗来说pattern就是找谁，action就是干啥 awk处理的内容可以来自标准输入（<），一个或多个文本文件或管道 实践 我们先准备一个文件来用来进行后面的测试 ?...我们先用一个语句来说一下awk的运作方式 ?...3.继续读取下一行 4.重复1-3，直到读取到最后一行 其中的$0实际上是awk的内置变量，代表的是当前一整行记录，awk的内置变量有很多，我们这里举出其中的几个来进行说明，可以借用这些内容来进行各种方式的分割操作...这里再解释一下那个BEGIN是做什么的 BEGIN{}: 读入第一行文本之前执行的语句，一般用来初始化操作{}: 逐行处理END{}: 处理完最后以行文本后执行，一般用来处理输出结果 接下来再说一下正则表达式的应用
awk 是一种编程语言，用于在linux/unix下对文本和数据进行处理。数据可以来自标准输(stdin)、一个或多个文件，或其它命令的输出。它在命令行中使用，但更多是作为脚本来使用。...awk有很多内建的功能，比如数组、函数等，这是它和C语言的相同之处，灵活性是awk最大的优势。...语法格式 awk [options] 'scripts' var=value filename 常用参数 -F 指定分隔符（可以是字符串或正则表达式） -f 从脚本文件中读取awk命令 -v var=...一个awk脚本通常由BEGIN语句+模式匹配+END语句三部分组成,这三部分都是可选项....匹配0个或1个前导字符 [] 匹配指定字符组内的任意一个字符/^[ab] [^] 匹配不在指定字符组内的任意一个字符 () 子表达式 | 或者 \ 转义符 ~,!
AWK是一种处理文本文件的语言，是一个强大的文本分析工具。...fs 指定输入文件折分隔符，fs是一个字符串或者是一个正则表达式，如-F:。...-v var=value or --asign var=value 赋值一个用户定义变量。-f scripfile or --file scriptfile 从脚本文件中读取awk命令。...完整的输入记录ARGC命令行参数的数目ARGIND命令行中当前文件的位置(从0开始算)ARGV包含命令行参数的数组CONVFMT数字转换格式(默认值为%.6g)ENVIRON环境变量关联数组ERRNO最后一个系统错误的描述...)RLENGTH由match函数所匹配的字符串的长度RS记录分隔符(默认是一个换行符)RSTART由match函数所匹配的字符串的第一个位置SUBSEP数组下标分隔符(默认值是/034)$ awk 'BEGIN
按字段相加文本内容 a 3 b 4 c 5 a 8 d 2 c 6 将上面内容中字段相同的数据相加 awk -F ' ' '{sum[$1]+=$2}END{for(i in sum)...test.txt 结果： a 11 b 4 c 11 d 2 按字段拼接两个文本 文本1: a 3 b 4 c 5 文本2: a high c middle b low 根据第一个字段拼接两个文本...awk '{if(NR==FNR){x[$1]=$2}else{x[$1]=x[$1]" "$2}}END {for(i in x){print i, x[i]}}' test1.txt test2....举个栗子： 有两个文件，第一个文件有10行，第二个文件有15行。在读第一个文件的第5行时，NR=5，FNR=5。在读第二个文件的第8行的时候，NR=18，FNR=8。...所以NR==FNR表示在读取第一个文件。 发布者：全栈程序员栈长，转载请注明出处：https://javaforall.cn/107426.html原文链接：https://javaforall.cn
除了使用 sed 命令，Linux 系统中还有一个功能更加强大的文本数据处理工具，就是 awk。 曾有人推测 awk 命令的名字来源于 awkward 这个单词。...和 sed 命令类似，awk 命令也是逐行扫描文件（从第 1 行到最后一行），寻找含有目标文本的行，如果匹配成功，则会在该行上执行用户想要的操作；反之，则不对行做任何处理。...举个简单的例子： [root@localhost ~]# awk '/^$/ {print "Blank line"}' test.txt 在此命令中，/^$/ 是一个正则表达式，功能是匹配文本中的空白行...awk 使用数据字段变量 awk 的主要特性之一是其处理文本文件中数据的能力，它会自动给一行中的每个数据元素分配一个变量。...awk 脚本命令使用多个命令 awk 允许将多条命令组合成一个正常的程序。
localhost~]# echo ${array[@]} a b c 3.获取数组的长度 [root@localhost~]# echo ${#array[*]} 3 4.通过下标0 1 2依次获取数组的每一个元素...} b [root@localhost~]# echo ${array[2]} c 5.获取部分数组 [root@localhost~]# echo ${array[*]:0:2} a b 6.删除第一个元素...-mtime +30 -exec rm {} \; done 二、awk数组 awk的数组，一种关联数组(Associative Arrays)，支持多维数组，下标可以是数字和字符串。...在gawk 3.1.2以后的版本还提供了一个asorti函数，这个函数不是依据关联数组的值，而是依据关联数组的下标排序，即asorti(array)以后，仍会用数字(1到数组长度)来作为下标，但是array...的数组值变为排序后的原来的下标，除非你指定另一个参数如:asorti(a,b)。
简介 awk是一个强大的文本分析工具，相对于grep的查找，sed的编辑，awk在其对数据分析并生成报告时，显得尤为强大。...在awk中，文件的每一行中，由域分隔符分开的每一项称为一个域。通常，在不指名-F域分隔符的情况下，默认的域分隔符是空格。...2.shell脚本方式 将所有的awk命令插入一个文件，并使awk程序可执行，然后awk命令解释器作为脚本的首行，一遍通过键入脚本名称来调用。 相当于shell脚本首行的：#!.../bin/awk 3.将所有的awk命令插入一个单独文件，然后调用： awk -f awk-script-file input-file(s) 其中，-f选项加载awk-script-file中的awk...接着开始读入第二条记录······直到所有的记录都读完，最后执行END操作。
Awk是什么 Awk、sed与grep，俗称Linux下的三剑客，它们之前有很多相似点，但是同样也各有各的特色，相似的地方是它们都可以匹配文本，其中sed和awk还可以用于文本编辑，而grep则不具备这个功用...BEGIN是一个特殊的pattern，它在awk处理输入之前就会执行，可以认为是一个初始化语句，与此对应的还有END。 好像还没介绍如何指定处理的文件，是不是最后的argument就是指定的文件？...动作； 如果变量赋值在最后一个文件参数之后，在END动作之前执行，仅影响END动作； 如果文件参数不存在，情况同1所述； 如果变量赋值位于多个文件参数之间，在变量赋值前面的文件被处理后执行，影响到后续文件的处理和...内置变量NF记录着字段的个数，所以$NF表示最后一个字段： 当然，$(NF-1)表示倒数第二个。...n可以为一个变量，例如$NF代码最后一个字段，而$(NF-1)表示倒数第二个字段。 数组 数组是一种特殊的变量，在awk中，比较特殊地是，数组的下标可以为数字或者字符串。
-name "*.py" | xargs wc -l | awk 'BEGIN {size = 0} { size+=$1} END{print size/2}' find ....-name "*.py" | xargs cat | wc -l (1)find，拿到所有py结尾的文件，你写相对路径得到相对路径，绝对路径得到绝对路径 (2)wc -l计数 (3)awk求和，wc其实能算出来总数...，所以后面除2 2、对满足某个条件的字段计数 cat a.text | awk '{if ($1 > "2017-12-01 12:30:00") { count[$2]++;} } END{for (
/bin/awk -f BEGIN{ MAX = 0 MIN = 9999999 CCID=ENVIRON["ccid"] T=ENVIRON["date"]...} else { gt_5min[$1]++ } } } } ## 算一个累计值
linux awk数组操作详细介绍 用awk进行文本处理，少不了就是它的数组处理。那么awk数组有那些特点，一般常见运算又会怎么样呢。我们先看下下面的一些介绍，结合例子我 们会讲解下它的不同之处。...在 awk 中数组叫做关联数组(associative arrays)，因为下标记可 linux awk数组操作详细介绍 用awk进行文本处理，少不了就是它的数组处理。...在 awk 中数组叫做关联数组(associative arrays)，因为下标记可以是数也可以是串。awk 中的数组不必提前声明，也不必声明大小。数组元素用 0 或空串来初始化，这根据上下文而定。...二、数组相关函数 [chengmo@localhost ~]$ awk –version GNU Awk 3.1.5 使用版本是：3.1以上，不同版本下面函数不一定相同 得到数组长度(length方法使用...判断键值存在以及删除键值： 一个错误的判断方法： [chengmo@localhost ~]$ awk ‘BEGIN{tB[“a”]=”a1″;tB[“b”]=”b1″;if(tB[“c”]!
史上最好用的免费SVN空间简介awk是一个强大的文本分析工具，相对于grep的查找，sed的编辑，awk在其对数据分析并生成报告时，显得尤为强大。...今天说一说linux awk命令详解,希望能够帮助大家进步!!! 简介 awk是一个强大的文本分析工具，相对于grep的查找，sed的编辑，awk在其对数据分析并生成报告时，显得尤为强大。...2.shell脚本方式 将所有的awk命令插入一个文件，并使awk程序可执行，然后awk命令解释器作为脚本的首行，一遍通过键入脚本名称来调用。 相当于shell脚本首行的：#!.../bin/awk 3.将所有的awk命令插入一个单独文件，然后调用： awk -f awk-script-file input-file(s) 其中，-f选项加载awk-script-file中的awk.../bin/sh sys /bin/sh 如果只是显示/etc/passwd的账户和账户对应的shell,而账户与shell之间以逗号分割,而且在所有行添加列名name,shell,在最后一行添加
Hi，我是Johngo~ Linux、shell，很多初学者可能非常陌生，但是对于算法、数据、大数据相关的同学，这个又是一个不可避免的学习内容~ Shell 编程在机器学习和数据处理领域非常重要，尽管它通常不像...最后，END 块在程序执行完毕后被执行，打印一条结束执行的消息和 sum 的总和。 2. body 块 这个块是 Awk 程序的主要部分，它在每一行上被执行。...-f 选项告诉 AWK 从指定的文件中读取脚本。 注意事项 确保你的系统上安装了 AWK。大多数 UNIX 和类 UNIX 系统（如 Linux 和 macOS）默认安装了 AWK。...在主模块中，我们使用print命令来打印每个学生的姓名和分数， 1表示第一个字段（姓名）， 2表示第二个字段（分数）。 最后，我们指定了要处理的文件file.txt。...第一个代码块使用^a匹配所有以a开头的单词，并打印匹配到的行。 第二个代码块使用[0-9]匹配包含数字的行，并打印匹配到的行。 最后一个代码块使用NF !
在 linux 系统日常处理工作中，发挥很重要的作用，掌握了 awk将会使你的工作变的高大上。 awk 是三剑客的老大，利剑出鞘，必会不同凡响。...awk每接收文件的一行，然后执行相应的命令，来处理文本。 三：awk 的原理 通过一个简短的命令，我们来了解其工作原理。...test.txt文件内容为： [root@Gin scripts]# cat test.txt I am Poe,my qq is 33794712 请从该文件中过滤出'Poe'字符串与33794712，最后输出的结果为...然而，在许多编程情况中，可能需要在 awk 开始处理输入文件中的文本之前执行初始化代码。对于这种情况， awk 允许您定义一个 BEGIN 块。...之前的action{}里都是只有一个print,其实print只是一个语句，而action{}可以有多个语句，以;号隔开。
闲话： Linux 从来没有系统的学过，AWK 这个高端的东西更没有系统全面的学过，知道真正项目中遇到的时候才会想着系统的学习一下，今天先写一下AWK的数组使用，网上有很多这样的文章，但是很多地方都没有讲的很细...官方解释AWK awk ：适用程序，一种unix工具 就是一个强大的文本分析工具，相对于grep查找、sed的编辑，awk在对数据分析并生成报告的时候，显得尤为强大。...在end动作里完成对结果a的打印 3） awk统计ip访问次数（进阶） 现在有一个文件，数据量大概在200多万条记录，想用shell的awk做统计，文件的格式如下 #关键字#URL#IP地址# key1...URL总的访问的次数，以及多少个不同的IP,输出到一个文件中 awk -F”|” ‘{a[1″ “2]++;b[1” “2” “3]++}(b[1” “2” “3]==1){++c[1” “2]}END...url为关键字的访问IP肯定要+1 ，但是如果不是第一次出现，什么都不需要做 {b[1″ “2” “3]++}(b[1” “2” “3]==1){++c[1” “2]} 现在再看是不是就好理解了,最后结果为
awk的指令格式通常是这样的： [root@linux ~]# awk '条件类型 1{动作 1} 条件类型 2{动作 2} ...' filename 其中条件类型可有可无，比如像最上面这个例子，只存在指令不存在条件...指令中第一个动作是{for(i=2;i<=NF;i++) Number[$i]++}，该动作会将课程名称作为index，统计出每节课程所选人数作为相应的值。...要注意，在linux中使用一个数组类型不需要声明，所以在上面这个动作中直接就开始使用Number这个数组了，而$i会将一列中的值全部取出来，作为number的index，然后再取出number[index...]值做++操作，所以最后得到的number是以课程名称为index，课程的选课人数为value的数组。...这些都是awk的高级特性，详细可以参考http://linux.vbird.org/linux_basic/0330regularex/awk.pdf
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