继续总结一下linux 的文本处理。包括但不限于awk, sed, paste,split,grep....
unzip php-7.3.0-Win32-VC15-x64.zip -d php ---- 指定到特定的文件夹下面
学习生信的过程中怎么能少了Linux呢。但是很多人都是Linux新手,又不想花钱买服务器,这里有个免费的网页版Linux服务(链接在文末),足够学习基础的Linux命令!
日常工作中需要对日志文件进行分析,当日志文件过大时,Linux中使用vim、cat、vim、grep、awk等这些工具对大文件日志进行分析将会成为梦魇,具体表现在:
扩展 awk 中使用外部shell变量http://ask.apelearn.com/question/199 命令示例:A=44echo "ABCD" | awk -v GET_A=$A '{print GET_A}'
在这篇文章里,我们将要一睹能快速分析文本数据(如日志,报告等)的最方便工具。很多时候,我们需要的数据并不存储在我们的本机上。所以首先,我们要知道如何链接到远程服务器上并使用它。为此,使用SSH最为合适。(SSH,即Secure Shell,是一个加密网络协议,它能让你在一个不安全的网络上安全地远程登陆和使用其他网络服务) 在Ubuntu的终端你可以用以下几个命令之一来登陆远程服务器。 $ ssh user@host $ ssh -p port host 通过密钥链接: $ ssh -i key.pem us
我以前的文章介绍过grep了,今天我就来说一下第二个sed,它是stream editor的缩写。在Linux的文本文件中文本存储都是一行,显示时表现的多行其实都是因为有换行符的存在,例如:文本是:abc$def$ghi 显示出来就是三行了。Sed就是一个行编辑器,它一次读一行文本进行操作,然后根据我们的选择看是否同步到文本之中。还有一个叫awk的,在Linux上叫做gawk(gnu awk),它是一个文本格式化工具,我们下一篇文章再说。 工作机制:每次读取一行文本至“模式空间(pattern space)
引言:生物信息学文件多样,通常我们会遇到各种将不同格式进行转换或者把文件修改成我们想要的那种格式的需求,不懂生信的小伙伴们会请教会生信的小伙伴,其实会生信的同学面对这些问题时往往也会很头大(OS:我们也不是万能的呀!
你还可以将特定字符做为替换范围。比如,将SQL语句从FROM至分号部分中的所有等号(=)替换为不等号(<>):
问题导读 1.Shell该如何学习? 2.Shell和传统编程语言有哪些相同? 3.Shell和传统编程语言有哪些不同? 4.你认为Shell还有哪些便捷的地方? 由于行业的发展,对程序员的要求越来越
前段时间迷上了做 B 站视频,主要是摩托车方面的知识分享。做的也比较粗糙,就是几张图片配上语音和字幕进行解说。尝试过自己解说,发现录制视频对节奏的要求还是比较高的,这里面水太深把握不住。好在以 "在线 免费 文字转语音" 作为关键字搜索一番,发现一个好用的网站——字幕说。好用的语音合成工具千千万,为什么我对这个情有独钟呢?原来它将文字底稿转换为语音的同时,还输出了字幕文件 (srt),这个在 B 站的云编辑器中就可以直接导入了,非常方便:
大数据文摘作品 编译:汪小七、Katrine Ren、夏雅薇 本篇文章作者是Matthew Mayo,选自KDnuggets(一个著名的数据挖掘网站)。简要介绍了12种类Unix操作系统命令行工具,以及这些命令行工具对数据科学研究和数据科学家的价值。 这篇文章概述了十二个可以用于数据科学项目的类Unix操作系统命令行工具。 这一系列工具不包括任何基本的文件管理命令(pwd、ls、mkdir、rm……)和远程桌面管理工具(rsh、ssh……),但是从数据科学角度来看,这些命令行工具都是比较实用的,通常用来进行
随着 Kubernetes 越来越流行,不管大公司还是小公司都往 Kubernetes 迁移,每个公司最少有两套集群(测试和生产),但是多个集群就有多个 Kubeconfig 用户授权文件。虽然官方文档中有介绍多个 Kubeconfig 文件合并成一个 Kubeconfig,但是对于一些新手来说,看得不是很明白。
杂项题目主要是以文件附件作为题目,但是给的文件不一定是有后缀名的,这就需要我们识别这些文件
Tech 导读 本文将从测试开发工作痛点出发,重在探讨Shell在日常工作中的实战应用,由浅入深,层层递进,将用户命令转化成计算机内核所能够理解的指令,逐步实现与操作系统的完美交互。另外,为了应对高频使用场景,Shell通过函数化封装来实现工具调用,避免陷入战术上勤奋的误区。
例如将一个BLM.txt文件分成前缀为 BLM_ 的1000个小文件,后缀为系数形式,且后缀为4位数字形式
linux下文件分割可以通过split命令来实现,可以将一个大文件拆分成指定大小的多个文件,并且拆分速度非常的快,可以指定按行数分割和安大小分割两种模式。Linux下文件合并可以通过cat命令来实现,非常简单。
去年一年,我写了将近100篇网络日志。 现在这一年结束了,我要统计"访问量排名",看看哪些文章最受欢迎。(隆重预告:本文结尾处将揭晓前5名。) 以往,我用的是AWStats日志分析软件。它可以生成很详
在软件开发中使用自动化构建工具的好处是显而易见的。通过工具自动化运行大量单调乏味、重复性的任务,比如图像压缩、文件合并、代码压缩、单元测试等等,可以为开发者节约大量的时间,使我们能够专注于真正重要的、有意义的工作,比如设计业务逻辑,编写代码等等。 对很多前端开发人员而言,Grunt 无疑是这方面的首选。基本上,如果你会用 JavaScript ,那么在一个名为 Gruntfile.js (或者 Gruntfile)的文件中用 Javascript 语言定义自动化任务是非常简单的过程,同时大量的 第三方插件
得到了它们的bam文件,也是走的GATK流程,这里就不多说了。本教程首发于生信技能树VIP论坛:https://vip.biotrainee.com/d/423-gatk4-gvcf
当需要将较大的数据上传到服务器,或从服务器下载较大的日志文件时,往往会因为网络或其它原因而导致传输中断而不得不重新传输。这种情况下,可以先将大文件分割成小文件后分批传输,传完后再合并文件。
原文:https://opensource.com/article/19/10/advanced-awk
本篇文章主要介绍如何在CDH 5.16.2集群中获取所有Hive表的分区数、小文件数量、表大小。
在黝黑的终端窗口中输入命令,这样的方式对某些人群来说可能好像过时了,但对许多专业计算机人员来说,这几乎是计算机完成能够执行的所有任务的最有效、最简便和最清晰的方式。如今,一些项目将开源命令引入了 macOS 和 Windows 等非开放平台,因此终端命令不仅仅是针对 Linux 和 BSD 用户,更是与每个人都息息相关。你可能会惊讶地发现,在一台普通的 POSIX 计算机上安装了数千个命令,当然,其中很多命令并不是真的有用,至少不是直接或经常性被使用。而其中的一部分命令虽然不是有效终端必须使用的命令,但相比其他命令而言使用频率较高,值得大家学习一下。
原文:https://www.escapelife.site/posts/72f237d3.html
本文隶属于专栏《1000个问题搞定大数据技术体系》,该专栏为笔者原创,引用请注明来源,不足和错误之处请在评论区帮忙指出,谢谢!
HBase在存储时, 使用了LSM树来进行数据存储, 会定期将文件进行合并, 以提升数据的查询效率, LSM树都是这么处理的. 那么到这里就有一个问题了, HBase在进行文件合并的时候, 势必会占用
文章涉及到vim\grep\cat\more\less\echo\sed\awk的入门用法。
在Linux中,每个文件都有一组基本属性。可以使用ls -l命令来查看文件的详细属性。
awk -F ‘:’ ‘BEGIN{语句} {if(条件){语句1;语句2;语句3} } END{语句}’ filename
在Linux系统下,经常会有一些计算需求,那么下面就简单梳理下几个常用到的计算命令 (1)bc命令 bc命令是一种支持任意精度的交互执行的计算器语言。bash内置了对整数四则运算的支持,但是并不支持浮点运算,而bc命令可以很方便的进行浮点运算,当然整数运算也不再话下 常用参数选项: -i:强制进入交互式模式; -l:定义使用的标准数学库; -w:对POSIX bc的扩展给出警告信息; -q:不打印正常的GNU bc环境信息; -v:显示指令版本信息; -h:显示指令的帮助信息。 在bc工作环境下,
Linux 命令 cat 用于查看文件内容或将多个文件合并为一个文件的命令,一般形式如下:
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工欲善其事必先利其器,这一节课主要以Windows系统为例,介绍了用Linux编程之前需要下载并安装的软件:Xshell,git,markdown,Winscp,幕布以及notepad++。介绍了如何下载并安装R及R的操作软件Rstudio,在Rstudio里进行了简单的命令演示以及如何安装并调用包,需要注意的是,所有软件推荐从官网进行下载,并且在安装的时候默认进行,基本不需要改动任何选项。对于Windows用户要把所有软件装在C盘,对于Mac用户则默认安装,安装软件时勿出现中文路径。
大数据平台的资源管理组件主要涉及存储资源和计算资源管理两部分,属于大数据平台运维管理系统。基于资源管理系统,大数据平台的开发运维人员能够清晰掌控平台的资源使用情况和资源在不同时间段下的变化趋势,能对资源使用异常进行及时发现并定位处理,避免造成更严重的影响,如磁盘空间撑爆,计算资源无空余,任务长时间等待不运行等造成业务阻塞。
我正在编写一个脚本,以便打印文件中所有数字的总和。我已经有一个解决方案,但效率不高(运行需要几分钟的时间)。我正在寻找一个更高效的解决方案。有什么建议吗?
各种 IDE 大行其道的同时,传统的命令行工具以其短小精悍,随手可得的特点仍有很大的生存空间,这篇短文介绍了一个文本比较和合并的小工具:vimdiff。希望能对在 Unix/Linux 系统上进行开发的朋友有所帮助。
Linux是最适合开发的操作系统,它是把所有的操作权都交给了用户,有什么操作,就会呈现出什么样的格局。开放、自由、诚实,就是它最大的魅力。
日常工作中,经常需要将很多pdf文件合并到一起,有时可能是为了方便保存、搜索,有时可能是为了方便一起打印,等等,等等……
在使用容量有限的介质传输大文件时(比如U盘、光盘容量小于文件大小),这时候就需要把大文件切割后,再多次传递,最后再合并成原始文件 文件切割 ➜ split -b 4G CentOS-7-aarch64-Everything-2009.iso 生成的文件是xaa和xab 文件合并 ➜ cat xaa xab > CentOS-7-merge.iso ➜ shasum CentOS-7-aarch64-Everything-2009.iso CentOS-7-merge.iso fb2d5f8b47d985
今天要给大家讲的是PPT多文件合并! PPT多文件合并相对于Excel多工作薄合并来讲要简单很多。 主要也是两种方法: PPT内置合并功能 使用OIIO插件 接下来就给大家详细介绍: PPT内置合并
不论是Hive还是Spark SQL在使用过程中都可能会遇到小文件过多的问题。小文件过多最直接的表现是任务执行时间长,查看Spark log会发现大量的数据移动的日志。我们可以查看log中展现的日志信息,去对应的路径下查看文件的大小和个数。
由于Hadoop擅长存储大文件,因为大文件的元数据信息比较少,如果Hadoop集群当中有大量的小文件,那么每个小文件都需要维护一份元数据信息,会大大的增加集群管理元数据的内存压力,所以在实际工作当中,如果有必要一定要将小文件合并成大文件进行一起处理。
以上就是python文件拆分与合并的方法,希望对大家有所帮助。更多Python学习指路:python基础教程
对于一列或多列中出现倾斜值的表,可以创建倾斜表(Skewed Tables)来提升性能。比如,表中的key字段所包含的数据中,有50%为字符串”1“,那么这种就属于明显的倾斜现象;于是在对key字段进行处理时,倾斜数据会消耗较多的时间。
描述:源程序文件(通常是纯文本文件)比较和合并工具一直是软件开发过程中比较重要的组成部分,现在市场上很多功能很强大的专用比较和合并工具:
接下来对于几个上一章所讲解的常用命令的选项和参数进行一个简单的扩展。其实后期大家在学习和工作中用到其他的命令,我们完全可以自己在互联网上查询资料。那么前期,我带着大家入门。
上一遍记录了当时集群资源死锁的问题,后来想了想其实小文件较多也会让集群变慢,小文件较多在执行作业时rpc时间就会增加,从而拖垮了job的执行速度。
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