发现awk比较的时候可以用-代替某一个文件,这样让整个代码更灵活: cat 2.txt | awk 'FNR==NR {x[$1];next} ($1 in x)' 1.txt - 取代第一个文件的位置...: cat 2.txt | awk 'FNR==NR {x[$1];next} ($1 in x)' - 1.txt 这样在提取bam文件的信息的时候比较方面,比如: samtools view -@...8 reads.bam | awk 'FNR==NR {x[$1];next} ($1 in x)' reads_name.txt -
当需要比较A , B两个文件 , A文件中存在 , 并且把也在B文件中存在的行去除掉 , 可以使用这个awk的用法来 awk '{if(ARGIND==1) {val[$0]}else{if($0...in val) delete val[$0]}}END{for(i in val) print i}' A B 使用awk的同时处理多文件功能,配合数组变量来进行处理 先扫描文件A,把文件A中的每行作为数组的...key放入数组 再扫描文件B,判断B中的每行是否存在于数组中,如果存在就删除这个数组元素 最后统一打印数组中的key
在使用容量有限的介质传输大文件时(比如U盘、光盘容量小于文件大小),这时候就需要把大文件切割后,再多次传递,最后再合并成原始文件 文件切割 ➜ split -b 4G CentOS-7-aarch64...-Everything-2009.iso 生成的文件是xaa和xab 文件合并 ➜ cat xaa xab > CentOS-7-merge.iso ➜ shasum CentOS-7-aarch64-...CentOS-7-merge.iso fb2d5f8b47d985b11ad532519aef3a92ece3361e CentOS-7-aarch64-Everything-2009.iso 可以看出来,合并后的文件跟原始文件是一样的...,sha散列值一样 常用选项 -b byte_count[K|k|M|m|G|g] 一个文件多少字节,一般用在二进制文件 -l line_count 一个文件多少行,一般用在文本文件 参考 Linux中的...split命令,文件切割
分割文件 文件分割可以使用split命令,该即支持文本文件分割,又支持二进制文件分割;而合并文件可以使用cat命令。 1.1 文本文件分割 分割文本文件时,可以按文件大小分割,也可以按文本行数分割。...按文件大小分割 按文件大小分割文件时,需要以-C参数指定分割后的文件大小: $ split -C 100M large_file.txt stxt 如上所示,我们将大文件large_file.txt按100M...按行分割 文本文件还可以以行为单位进行分割,以行数进行分割时会忽略文件大小,并以-l参数指定分割后文件的行数: $ split -l 1000 large_file.txt stxt 1.2 二进制文件分割...文件合并 文件合并使用cat命令,上面几种方式分割的文件都可以使用cat命令合并。 cat命令合并分割文件: $ cat stxt* > new_file.txt 3....文件合并: $ cat file1 file2 > file
cat Data/example.gtf | awk '{print $9$10}' | head ## 直接连接 cat Data/example.gtf | awk '{print $9"@"$10...}' | head cat Data/example.gtf | awk '{print $9"\t"$10}' | head 匹配模式 cat Data/example.gtf | awk '/UTR...Separator ORS:定义输出记录分隔符,Record Separator NF:数据文件中的字段综述,可以简单理解为列数 NR:已处理的输入记录数,可以简单理解为行数 # 设置OFS以定义输出字段分隔符...| awk 'BEGIN{FS="\t"; OFS=":"} {print NR,$9}' | head -5 awk 条件和循环语句 图片 ##判断第三列是否是基因 cat Data/example.gtf...| awk '{for(i=1;i<4;i++){print $i}}' | less -S ## 可以通过paste拼回去 less -S Data/example.gtf | awk '{for(
合并两个文件,其实只要把文件2的内容追加到文件1中就可以了例如,现有两个文件,file1和file2:file1.txt:123456file2.txt:abcdef代码如下:file1 = 'file1
awk中数组的使用。我们在其他语言中经常会使用到数组,awk中也可以使用。...示例如下: 与其他不同的是,awk中的数组元素值可以设置为”空字符串“,当设定某一个元素为”空字符串“时,打印出的值就是为”空“(注:”空格“不为”空“)。...鉴于awk中,元素的值可以为”空“,我们就不能根据元素的值是否为”空“去判断元素是否存在了。...在awk中,数组的下标不仅可以为”数字“,还可以为”任意字符“。...2 for(变量 in 数组){ //代码语句 } 注意,两种都能遍历输出数组中的元素,不过第一种for循环语法只能够输出以数字作为下标的数组,示例如下: 数组运算: 在awk中可以进行数值运算,如果
bG.eKO8Zupe0TnyFhWX9Y.:529:529::/home/dz02/s2002408032823:/bin/pw [Copy to clipboard] [ - ] CODE: awk...I0012 22222 I0014 55555 I0013 66666 规则:比较 file1的1-4字符 和 file2的2-5 字符,如果相同,将file2 的第二列 与 file1 合并...10 15 36.5 file2文件 50 10 9 3.2 1 5 将两个文件合成一个文件如...to clipboard] [ - ] CODE: awk '{for (i=1;i<=NF;i++) a[i]=$i;getline <"file2";for (i=1;i QUOTE: 5、 文件...[Copy to clipboard] [ - ] CODE: awk 'BEGIN{FS="[ |,]";OFS=","}NRFNR{print $1,$2,a[
awk是Linux三剑客之一,在我们处理文件等方面还是特别方便的 介绍 我们先来说一说awk是用来干什么的,awk是一个强大的文本分析工具,相对于grep的查找,sed的编辑,awk在其对数据分析并生成报告时...简单来说awk就是把文件逐行的读入,以空格为默认分隔符将每行切片,切开的部分再进行各种分析处理。 我们可以先来看一下awk的版本号 ?...用法 awk命令是由模式和动作的组合组成的 awk [options] 'pattern {action}' file 模式,pattern,可以理解为sed的模式匹配,可以由表达式组成,也可以是两个正斜杠之间的正则表达式...通俗来说pattern就是找谁,action就是干啥 awk处理的内容可以来自标准输入(文件或管道 实践 我们先准备一个文件来用来进行后面的测试 ?...awk是通过一行一行来处理文件的,上面这条语句执行的过程就是: 1.awk读入一行内容 2.判断是否符合模式中的条件(NR>=2),如果匹配到则执行对应的动作({print $0}),如果没有匹配到,继续读取下一行
Linux 命令 awk命令解析 awk 命令是一种强大的文本处理工具,它可以根据指定的模式对文本进行处理、分析和格式化。...为方便读者理解,林一写个具体的 demo 现有有一个文件 linyi.txt,格式如下,计算文本文件中第一列数字的和: 1 abc 2 def 3 ghi 可以使用以下 awk 命令: awk '...{s+=$1} END {print s}' linyi.txt $1 表示第一列的内容,s 是累加变量,通过 END 命令在处理完整个文件后输出结果。...Linux 命令 awk 命令注意事项 读者需要注意模式和动作的书写顺序不能颠倒;模式和动作可以省略,但大括号不能省略。 awk 命令还有许多内置变量和函数,可以用于进一步处理文本。...awk 命令还支持正则表达式,可以用来匹配复杂的文本模式。
在许多情况下,您需要获取两个或更多PDF并将它们合并为一个PDF。例如,您可能有一个标准封面页,需要继续处理多种类型的报表。您可以使用Python来帮助您完成这类工作。...main__': paths = ['document1.pdf', 'document2.pdf'] merge_pdfs(paths, output='merged.pdf') 要合并的...接下来,将迭代PDF文件中的所有页面,并用于.addPage()将每个页面添加到自身。一旦完成对列表中所有PDF的所有页面的迭代,将在结尾处输出结果。
按字段相加文本内容 a 3 b 4 c 5 a 8 d 2 c 6 将上面内容中字段相同的数据相加 awk -F ' ' '{sum[$1]+=$2}END{for(i in sum)...{print i, sum[i]}}' test.txt 结果: a 11 b 4 c 11 d 2 按字段拼接两个文本 文本1: a 3 b 4 c 5 文本2: a high...c middle b low 根据第一个字段拼接两个文本 awk '{if(NR==FNR){x[$1]=$2}else{x[$1]=x[$1]" "$2}}END {for(i in x){...FNR:表示当前文件中已读取的行数。 举个栗子: 有两个文件,第一个文件有10行,第二个文件有15行。在读第一个文件的第5行时,NR=5,FNR=5。...在读第二个文件的第8行的时候,NR=18,FNR=8。 所以NR==FNR表示在读取第一个文件。
AWK是一种处理文本文件的语言,是一个强大的文本分析工具。...-f scripfile or --file scriptfile 从脚本文件中读取awk命令。...这两个功能是Bell实验室版awk的扩展功能,在标准awk中不适用。...-f {awk脚本} {文件名}实例: $ awk -f cal.awk log.txt运算符运算符描述= += -= *= /= %= ^= **=赋值?...脚本,我们需要注意两个关键词BEGIN和END。
除了使用 sed 命令,Linux 系统中还有一个功能更加强大的文本数据处理工具,就是 awk。 曾有人推测 awk 命令的名字来源于 awkward 这个单词。...awk 使用数据字段变量 awk 的主要特性之一是其处理文本文件中数据的能力,它会自动给一行中的每个数据元素分配一个变量。...当然,如果你要读取采用了其他字段分隔符的文件,可以用 -F 选项手动指定。 awk 脚本命令使用多个命令 awk 允许将多条命令组合成一个正常的程序。...awk从文件中读取程序 跟 sed 一样,awk 允许将脚本命令存储到文件中,然后再在命令行中引用,比如: [root@localhost ~]# cat awk.sh {print $1 "'s home...注意,在程序文件中,也可以指定多条命令,只要一条命令放一行即可,之间不需要用分号。 awk BEGIN关键字 awk 中还可以指定脚本命令的运行时机。
/bin/bash #删除指定目录下的文件 a=(/usr/local/tomcat/logs /home/user/tomcat/logs /usr/local/app/tomcat/logs) for...-mtime +30 -exec rm {} \; done 二、awk数组 awk的数组,一种关联数组(Associative Arrays),支持多维数组,下标可以是数字和字符串。...因无需对数组名和元素提前声明,也无需指定元素个数 ,所以awk的数组使用非常灵活。...3 g h 3 11.合并file1和file2,除去重复项[root@localhost~]#cat file1 aaa bbb ccc ddd [root@localhost~]#cat file2...}’ file1 file2 aaa bbb ccc ddd eee fff 提取文件1中有,但文件2中没有:[root@localhost~]# awk ‘NR==FNR{a[0]=1}
简单来说awk就是把文件逐行的读入,以空格为默认分隔符将每行切片,切开的部分再进行各种分析处理。...awk语言的最基本功能是在文件或者字符串中基于指定规则浏览和抽取信息,awk抽取信息后,才能进行其他文本操作。完整的awk脚本通常用来格式化文本文件中的信息。 通常,awk是以文件的一行为处理单位的。...awk每接收文件的一行,然后执行相应的命令,来处理文本。 ...input-file(s) 是待处理的文件。 在awk中,文件的每一行中,由域分隔符分开的每一项称为一个域。通常,在不指名-F域分隔符的情况下,默认的域分隔符是空格。...中同时提供了print和printf两种打印输出的函数。
往往是因为网络传输的限制,导致很多时候,我们需要在 Linux 系统下进行大文件的切割。这样将一个大文件切割成为多个小文件,进行传输,传输完毕之后进行合并即可。 ?...文件切割 - split 在 Linux 系统下使用 split 命令进行大文件切割很方便 命令语法 -a: #指定输出文件名的后缀长度(默认为2个:aa,ab...)...www.gnu.org/software/coreutils/split> or available locally via: info '(coreutils) split invocation' 文件合并...- cat 在 Linux 系统下使用 cat 命令进行多个小文件的合并也很方便 命令语法 -n: #显示行号 -e: #以$字符作为每行的结尾 -t: #显示TAB字符(^I) cat [-n] [...-e] [-t] [输出文件名] 使用实例 # 合并文件 $ cat /data/users_* > users.sql 帮助信息 # 帮助信息 $ cat --h Usage: cat [OPTION
作者: Escape 链接: https://escapelife.github.io/posts/72f237d3.html 往往是因为网络传输的限制,导致很多时候,我们需要在 Linux 系统下进行大文件的切割...这样将一个大文件切割成为多个小文件,进行传输,传输完毕之后进行合并即可。...文件切割 - split 在 Linux 系统下使用 split 命令进行大文件切割很方便 命令语法 -a: #指定输出文件名的后缀长度(默认为2个:aa,ab...)...- cat 在 Linux 系统下使用 cat 命令进行多个小文件的合并也很方便 命令语法 -n: #显示行号 -e: #以$字符作为每行的结尾 -t: #显示TAB字符(^I) cat [-n] [...-e] [-t] [输出文件名] 使用实例 # 合并文件 $ cat /data/users_* > users.sql 帮助信息 # 帮助信息 $ cat --h Usage: cat [OPTION
在 Linux 上合并和排序文本的方法有很多种,但如何去处理它取决于你试图做什么:你是只想将多个文件的内容放入一个文件中,还是以某种方式组织它,让它更易于使用。...在 Linux 上,一个名为 filea 的文件将排在名为 fileA 的文件的前面,但会在 file7 的后面。...合并和排序文件 Linux 提供了一些有趣的方式来对合并之前或之后的文件内容进行排序。...join 命令让你能基于一个共同字段合并多个文件的内容。例如,你可能有一个包含一组同事的电话的文件,其中,而另一个包含了同事的电子邮件地址,并且两者均按个人姓名列出。...总结 在 Linux 上,你有很多可以合并和排序存储在单独文件中的数据的方式。这些方法可以使原本繁琐的任务变得异常简单。
Awk是什么 Awk、sed与grep,俗称Linux下的三剑客,它们之前有很多相似点,但是同样也各有各的特色,相似的地方是它们都可以匹配文本,其中sed和awk还可以用于文本编辑,而grep则不具备这个功用...awk中的变量名同一般的编程语言无太多区别,但是不能同awk的保留关键字重名,可以查看awk的man手册查询哪些是保留关键字。而变量值只有两种形式:字符串和数值。...因此事实上ARGV只是存储argument的部分,即文件名(file)以及命令行变量赋值两部分的内容。...更改ARGV元素的值 假设我们有a, b两个文件,它们各有一行内容:file a和file b。...,第一列是语句名称,第二列是对应的说明: 现在我们要将两列的内容分别输出到statement.txt和description.txt两个文件中: 下面是一个重定向到命令的例子,假设我们要对下面的文件进行排序
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云