1.简介 K-means算法是最为经典的基于划分的聚类方法,是十大经典数据挖掘算法之一。 K-means算法的基本思想是:以空间中k个点为中心进行聚类,对最靠近他们的对象归类。通过迭代的方法,逐次更新各聚类中心的值,直至得到最好的聚类结果。 2. 算法大致流程为: 1)随机选取k个点作为种子点(这k个点不一定属于数据集) 2)分别计算每个数据点到k个种子点的距离,离哪个种子点最近,就属于哪类 3)重新计算k个种子点的坐标(简单常用的方法是求坐标值的平均值作为新的坐标值) 4)重复2、3步,直到种子点坐标
GEO数据挖掘—2 四、代码分析流程 1. 下载数据并从中提取有用信息 gse_number = "GSE56649" eSet <- getGEO(gse_number, destdir = '.', getGPL = F) #(1)提取表达矩阵exp exp <- exprs(eSet) dim(exp) exp[1:4,1:4] 关于表达矩阵里的负值 取过log,有负值 —— 正常 没取过log,有负值 ——错误数据 有一半负值 ——做了标准化 获取实验分组和探针注释 # 生成Grou
geoChina的用法 #数据下载 rm(list = ls()) library(GEOquery) #先去网页确定是否是表达芯片数据,不是的话不能用本流程。 gse_number = "GSE28345" library(AnnoProbe) eSet <- geoChina(gse_number, destdir = '.') class(eSet) length(eSet) eSet = eSet[[1]] 批量安装R包 options("repos"="https://mirrors.ustc.e
今天正式开始教画图了,具体的代码其实挺多地方讲到了,上课的好处就是可以听到很多细节和经验,是自己零散地找资料不能相比的,收获很多,感觉要全部吞下来还要再复习几遍
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所有您想了解的有关K2 blackpearl以及流程驱动应用程序知识尽在于此书 Wrox Press, 2009 (点击窗口右边网站链接即刻订购) K2 blackpearl 正在改变人们使用软件
这个包里可以画pca, 热图,火山图,韦恩图,具体每个图的算法,可以看生信技能树GEO芯片分析
使用K2 blackpearl设计流程的时候有两个重要概念是Outcomes和Actions。 Actions代表的是人与工作流交互的时候,对流程处理的意见(例如同意/不同意/驳回),K2的Act
1*1=1,1*2=2,1*3=3,1*4=4,1*5=5, 2*1=2,2*2=4,2*3=6,2*4=8,2*5=10, 3*1=3,3*2=6,3*3=9,3*4=12,3*5=15, 4*1=4,4*2=8,4*3=12,4*4=16,4*5=20, 5*1=5,5*2=10,5*3=15,5*4=20,5*5=25,
#没有任何提示就是成功了,如果有warningxx包不存在,用library检查一下。
方法解析顺序(Method Resolution Order MRO),指的是在多继承编程语言中查找类的某个方法来自哪个基类的搜索顺序。
在K2流程系统中,流程中的任何一个执行节点(一个节点可以包含多个事件)都可能包含客户端事件,服务器端事件,以及子流程(IPC,Inter Process Communication)事件,或者其他事件。通常情况下,我们需要在流程节点中包含大量的业务逻辑,比如:流程节点的执行者是谁?在执行者启动流程节点任务之前哪些前提条件必须要满足,等等。流程节点是流程中的关键元素,任务执行者在流程节点做出审批、输入数据或者提取数据。 为了实现各种复杂的业务逻辑,K2提供了以下的业务规则: 1. Preceding Ru
数据框函数- 排序arrange()和desc参数、distinct()去重复、mutate()数据框新增列
箱型图不显示原始数据点,而是采用样本数据,根据四分位数用盒和线来显示值的范围。此外,它们用星号显示落在箱须之外的离群值
原文链接: http://blog.csdn.net/humanking7/article/details/45037239
K2“BlackPearl”提供一个平台,用于管理和利用现有的跨越任何数量的业务系统的业务信息,以降低成本。它考虑到决策的制定,线路的排定以及报告,并根据360度的可见性进入到业务实体中,譬如客户,职员,订单和发票。 它的“SmartObject”设计器提供一个允许开发人员搭建和部署这些复合实体的可视化界面。开发人员可以通过K2提供的技术,Web服务,或 K2 ADO.NET 数据提供程序,从业务系统中建立属性和方法,建立实体之间的联系,以及联合字段显示数据。同时也可以在“SmartObject”设计器中设
摘要:本文指出《Matlab教程及实训》中关于分段函数画法的不妥,给出Matlab分段函数的最常用的几种画法。
生成Group向量的三种常规方法,三选一,选谁就把第几个逻辑值写成T,另外两个为F。如果三种办法都不适用,可以继续往后写else if
-(3)注意:之前提到过,矩阵的某一列不能单独转换数据类型,需要把矩阵转换成数据框再转换某列的数据类型;或者把这列单独提取出来再转换其数据类型;
输入数据是数值型矩阵/数据框,颜色的变化表示数值的大小。有相关性热图和差异基因热图。
·上下五条线的意思 中间的又黑又粗的—中位数;上下两条线是最大值和最小值;方框的上下两条线是75%和25%(四分位数);在外面的点-离群点
在Python2.1中,采用了经典类,使用深度优先算法解析。 Python2.2中,引入了新式类,使用深度优先算法和广度优先算法。 在Python2.3以后的版本中,经典类和新式类共存,使用了DFS算法和C3算法。 Python2中的经典类
数据下载(DEO、TCGA)-差异分析(芯片与转录组不相同)-WGCNA(加权共表达网络)-富集分析(ORA、GSEA)-PPI网络-预后分析(影响生存的疾病)
1.Entrez gene ID:我们一般说的Gnen ID即Entrez gene ID,是用一串数字表示的(在NCBI里面用)
首先注意到信息表格pd中的title与source_name_ch1列中均含有分组信息,这里我选择了source_name_ch1l列,non-Diabetic Foot skin作为对照,Diabetic Foot skinDFU作为处理组。
因为是癌症方面,自己不研究这一方面,所以不常用,但是GEO的转录组数据,是根据这个文件改写的
我们一直在为 Kotlin 编译器(代号 K2)开发新的前端。前端是编译器的一部分,负责解析代码和执行语义分析、数据流分析、调用解析和类型推断。这是开发者与编译器交互最多的部分。编译器也通过它在 IDE 中持续运行、报告所有错误和警告消息,帮助完成自动补全、语义感知检查、意图和重构等任务。新前端已经可供预览 – 我们将继续进行完善和稳定工作,计划在未来 Kotlin 版本中将其设为默认编译器前端。我们已经决定将这个未来版本命名为 Kotlin 2.0。下文将详细描述 Kotlin 2.0 版本的路线图、我们的动力以及对它的期望。
Reduce负责数据合并 reduce: [k2, {v2,…}] → [k3, v3]
碎碎念:这个没啥好仔细展示的,含义也很直观,主要是要记住有这个函数,等需要用的时候回来找
1、我使用的是编译软件是vc6.0 2、如果代码无法运行,你可以尝试吧文件xxx.c改为xxx.cpp 3、四个小游戏我都运行过,确保是可以运行的。虽然可玩性、操作性。。。
昨天的文章,用shell写了一个简单的MySQL系统运行状态实时监控的模版,《MySQL系统运行状态实时监控(shell版本)》,对于这种操作,任何语言都可以完成,今儿就用python写一下,写的不优雅的地方,请各位指正。
OMAC是一种认证模式,LibTomCrypt中涉及的OMAC,而NIST中提到的是CMAC。它们之间的关系是这样的:
x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 #是list 所以用[[]]
所以事务中的命令在加入时都没有被执行,直到提交时才会开始执行( Exec )一次性完成
Vector一维 c(1,2,3,4,4) c("A","B","C") c(T,F,F,T,F)
题目为drinksome tea,注意这个tea,作为一个提示,该题目全程用tea来作为名称
存在问题: 搞嵌入式特别是底层,常常提到中断,中断时干什么的呢? 解决方案: 做嵌入式肯定要了解中断。本文根据实例详细介绍中断过程,包括软件和硬件方面。 示例: KEY2 中断控制点亮 LED2 【0】检测按键k2,按键k2按下一次,灯LED2闪一次。 【1】查看原理图,连接引脚和控制逻辑 (1)按键k2 连接在GPX1_1引脚 (2)控制逻辑 k2 按下 ---- K2闭合 ---- GPX1_1 低电压 k2 常态 ---- K2打开 ---- GPX1_1 高电压 【2
DES3,通常指的是三重数据加密算法(Triple Data Encryption Algorithm,3DES)或称为Triple DES,是一种对称加密算法。它是基于原有的DES(Data Encryption Standard)算法扩展而来,通过三次DES加密来增强安全性。
由于最近很多人聊到滑动验证码怎么处理,所以决定自己动手试一下。 做一个东西前。我们首先要对这个东西的操作过程有一个大概的了解。
上一讲我们构造好了SingleCellExperiment对象,后续全部的分析都会以这个SingleCellExperiment对象为准,大家务必熟悉SingleCellExperiment对象的各种结构,教程见:cytofWorkflow之构建SingleCellExperiment对象(二)。有了这个SingleCellExperiment对象,而且经过了合理的质量控制,并且聚类分群了,就可以开始整理它亚群并且根据抗体信号强度值对不同亚群进行生物学注释。
BM25算法是一种常见用来做相关度打分的公式,思路比较简单,主要就是计算一个query里面所有词和文档的相关度,然后在把分数做累加操作,而每个词的相关度分数主要还是受到tf/idf的影响。
MapReduce,学习分布式系统必读的经典佳作,写在本系列的开篇。文章按该paper的思路解析Map Reduce编程模型核心思想和关注点、案例及其实现
背景 最近基于兴趣学学习了下 HTTPS 相关的知识,在此记录下学习心得。 在上网获取信息的过程中,我们接触最多的信息加密传输方式也莫过于 HTTPS 了。每当访问一个站点,浏览器的地址栏中出现绿色图标时,意味着该站点支持 HTTPS 信息传输方式。我们知道 HTTPS 是我们常见的 HTTP 协议与某个加密协议的混合体,也就是 HTTP+S。这个 S 可以是 TLS(安全传输层协议)、也可以是 SSL(安全套接层),不过我更认可另一个抽象概括的说法,HTTP+Security。不过要谈论 HTTPS 为何
1.字符串图片1.str_length图片x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."x### 1.检测字符串长度str_length(x)length(x) #返回字符串的个数2.str_splitsplit返回列表,但是列表不能进行计算,对列表进行取子集### 2.字符串拆分str_split(x," ")x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152")st
节流字面意思就是节省流动,这里的流动映射到js优化中可以简单的理解为操作,节流就是减少操作的进行,比如我们滚动页面的时候,如果不做节流的操作,假设我们滚动一次就请求一次函数,函数单一的还好, 如果函数本身就执行的比较麻烦的函数,这个时候我们的页面可能会出现卡死的情况,cpu也吃不消,这个时候我们需要的是,滚动的时候我们加个时间控制,不管你滚动的多快只要不超过我们设置的时间间隔,我都不给你执行即可,这个过程就是节流,那么代码实现就是通过一个闭包加上时间延迟进行实现。
过file_get_contents()用到了php伪协议。https://www.lorexxar.cn/2016/09/14/php-wei/。只要通过php://input来读取POST里的数据就可以。 所以构造payload:
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