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    R语言XML包获得html文件中的表格小实例

    需求 使用snpEff软件对vcf格式文件进行注释后会生成一个snpEff_summary.html;这个文件是对vcf格式文件中的内容进行的统计,结果会以表格和图片的形式在html文件里展示。...我现在想把html中的数据提取出来,自己来做图。...) doc<-htmlParse("snpEff_summary.html") total_table<-getNodeSet(doc,"//table") # 以上代码是固定的写法 # 下面的代码想获得第几个表格...,中括号中的数字就改成几 df3<-readHTMLTable(total_table[[3]]) df3 class(df3) 结果以数据框的形式存储 以上功能使用python的BeautifulSoup...模块应该也可以实现,如果有时间回头看一下自己之前写的利用python的BeautifulSoup模块抓取火箭当家球星哈登数据的那篇笔记,争取利用python的BeautifulSoup模块也来实现一下本文提到的这个需求

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