数据处理及可视化是Python的一大应用场景。不过为了实现更好的动态演示效果，实际应用中常常还需要和js相结合。 今天我们就来给大家分享一个用D3.js实现的动态气泡图案例。...本文用到的语言主要 js，不过主要是做一些配置，所以阅读起来并不困难。另外也建议大家有空可以了解一下基础的js语法，会很有帮助。 首先我们来看下 D3.js 的气泡图效果： ?...，生成气泡图的结构。...-1 : 1; return mod * (a.value - b.value); }) ); } 设置For循环延时，完成动态气泡图的实现...如此便完成了一个动态的气泡图，这个案例用了疫情随时间变化的数据，这种图表可以比较直观地展现数据的变化趋势。
今天跟大家分享的是气泡图！ ▽▼▽ EXCEL制作的气泡图需要三个序列数据，除了通常必须的X轴、Y轴之外，还需要第三列数据，用来指定气泡面积大小。...●●●●● 三列数据一定要按照先后顺序排列（X轴、Y轴、气泡面积） 首先看下作图数据的排序： ?...然后选中后三列作图数据（D、E、F列数据） 插入——图表——气泡图（这里给出了两个备选项，三维气泡图和平面气泡图，建议还是平面的为好，三维效果纯属炫技，没啥实际意义，还容易误导视觉） ?...这是默认输出的气泡图，效果一般，我们需要做少许改动，让气泡图看起来更加有趣，规范，信息丰富一点。 ? 右键打开设置数据系列格式选项，将填充设置成依据数据点着色，将气泡面积设置为80%。 ? ?...这样，气泡图就大功告成了！
之前的推文介绍了画柱形图展示富集分析的结果R语言ggplot2做柱形图展示富集分析的结果，今天的推文介绍一下画气泡图展示富集分析结果的代码。气泡图就是散点图的一个变种。...比如下图 image.png 示例数据集还是之前的KEGG富集分析结果。...这次可以分享示例数据集 首先读入数据 dat<-read.table("kegg.txt", sep = "\t", header =...主要是为了减少数据量。但在真实的数据了这个阈值设置为多少就得根据自己的数据情况来了。...library(tidyverse) dat %>% filter(Corrected.P.Value dat01 dim(dat01) dim(dat) 最基本的图 library
本文作者蒋刘一琦 在生物信息领域我们常常使用R语言对数据可视化。在对数据可视化的时候，我们需要明确想要展示的信息，从而选择最为合适的图突出该信息。...什么是气泡图 气泡图（Bubble Plot）就是由一个个像气泡元素组成的图。...和普通的散点图不同，该图可以展示三维甚至四维信息，如下图：点的位置即其横纵坐标分别代表了Weight和Height，气泡的大小代表了Age，颜色代表了不同个体。 ? 再举几个例子： ? ?...从上述例子中可以发现用气泡图我们能展示更多的数据信息。随着多组学研究的涌现，我们急需在同一张图表来展现多维的数据，气泡图就是一个不错的选择。...怎么做气泡图 1）需要什么格式的数据 根据最终想要在气泡图上展示数据的维度以确定数据的格式。本次用一个来自于GOplo包的数据EC，该数据为RNA-seq的下游分析数据。
当 s 也为数组时，可以额外显示第三个维度的信息，此时散点图可称作气泡图。...依然可以添加其它的图形元素，使气泡图更完整： plt.title("气泡图示例",fontproperties="SimHei",fontsize = 20) plt.xlabel("x 轴", fontproperties
背景 模仿出2016年XieWei老师Nature的泡泡图Figure 4a。...PMID:27309802 一、使用场景 同时展示pvalue和表达量，例如： 场景一、展示motif的pvalue和motif对应的转录因子的表达量，就能看出哪个转录因子在哪个group里富集且表达量高...场景二、做基因功能富集分析时，展示富集的通路qvalue和基因数量或geneRatio。...二、输入数据 第一种： 把自己的数据整理成easy_input.txt的格式，就可以跳过“输入数据的格式化”，直接进入“开始画图”。...可以看出，比paper的图多出了很多转录因子。而且同一转录因子对应多个motif，paper里的只出现一个motif，作者是怎么处理的呢？
气泡图 气泡图是一种多变量图表，是散点图的变体，也可以认为是散点图和百分比区域图的组合[1]。气泡图最基本的用法是使用三个值来确定每个数据序列，和散点图一样。...气泡图通过气泡的位置及面积大小，可分析数据之间的相关性。 本文可以看作是《R语言数据可视化之美》[1]的学习笔记。...数据缩略版如下： ? 手把手绘制 geom_point()函数构建 气泡图是添加了第三维度的散点图：附加数值变量的值通过点的大小表示。(来源:data-to-viz[2])。...上图展示了世界各国的预期寿命(y)与人均国内生产总值(x)之间的关系。每个国家的人口用圆的大小表示。但是这个图不是非常美观，而且圆的大小并不是很直观，大家都差不多大。接下来对圆的大小进行设定。...该图基本可以满足我们日常生活的气泡图的可视化了。相信大家通过前面的详细的介绍，应该可以自行绘制，只要换个数据，懂得各个代码的含义即可。
富集分析气泡图dotplot, 本脚本只需要一个表格数据（如果是clusterProfiler包输出的富集分析结果可直接使用），也可以是其他软件工具的结果，按需改成本脚本所需格式即可。...结果展示： 图片 数据格式: （列名必须设置为这四个！..., 本展示数据第一列为行名，可以不需要这个行名） Description pvalue Count GeneRatio GO:0023061 signal release 5.246744e-06 29...，图的顺序就是表格的顺序，默认展示前15个通路。...# Dotplot 气泡图 library(tidyverse) DEG_Dotplot <- function(df, title="") { # """ # data格式如下（需有Description
gganimate|让你的图动起来！！！ 这是ggplot中十分可爱的一个扩增包，目的只有一个，就是让你的图动起来！就是酱紫！！...shadow_*()定义如何在给定的时间点呈现来自其他时间点的数据。 enter_*()/ exit_*()定义新数据应如何显示以及旧数据在动画过程中应如何消失。...Yet Another Example 首先查看一下数据格式吧，Gapminder是关于预期寿命，人均国内生产总值和国家人口的数据摘录。...哈哈哈，现在我们以肿瘤数据为例进行演示一下： 我编了一组测试数据，其中将肿瘤分为I,II,III型，IV型为control,然后分别显示了再不同样本中不同肿瘤分型下的部分基因的表达情况。...subgroup))+ geom_boxplot()+ geom_jitter()+ theme_bw() #按照subgroup进行分型，并画出箱式图
统计学家Hans Rosling在TED上关于《亚洲何时崛起》的演讲，其所采用的数据可视化展示方法可谓是近年来经典的可视化案例之一，动态的气泡图生动的展示了中国和印度是如何在过去几十年拼命追赶欧美经济的整个过程...经典的可视化库Matplotlib再现这经典的动态气泡图，或者说Hans Rosling Charts。...（2）第 34 行设置了x轴的刻度比例，这里这样设置是为了更好的展示某些年份的数据。...（7）第 96-99 行，对动态图进行展示，当然可以直接保存成gif文件，如100行操作，也可以直接保存成MP4格式文件，代码如下： bubble_animator.to_html5_video() bubble_animator.save...以上，基于matplotlib的动态气泡图就绘制完成了，难点：在于多类别图例的添加，可以参考本文方法也可参考官网方法。 下面给出本例子其中一年份数据绘图的结果图 ： 04.
本期给大家分享一个用D3.js实现的动态气泡图案例。 也是之前小F了解D3.js时发现的，效果大致如下。 ?...在main.js文件中引用axios，用于请求数据。 import axios from 'axios' Vue.prototype....，生成气泡图的结构。...-1 : 1; return mod * (a.value - b.value); }) ); } 设置For循环延时，完成动态气泡图的实现...可以看到酷炫的动态气泡图，昨天青岛又出现病例，疫情结束遥遥无期呀～ 将项目下载到本地，运行下面两行命令，即可运行。 npm install npm run serve
导读 本文[1]将学习如何使用 Python 的 Matplotlib 库通过示例绘制气泡图。 简介 气泡图是散点图的改进版本。在散点图中，有两个维度 x 和 y。...在气泡图中，存在三个维度 x、y 和 z。其中第三维 z 表示权重。这样，气泡图比二维散点图在视觉上提供了更多信息。 数据准备 对于本教程，我将使用包含加拿大移民信息的数据集。...爱尔兰和巴西的移民数据有不同的范围。我需要将它们调整到 0 到 1 的范围内。我只是将爱尔兰数据除以爱尔兰数据系列的最大值。我对巴西的数据系列做了同样的事情。...plt.xlabel("Years", size=14) plt.ylabel("Number of immigrants", size=14) plt.show() scatter 现在，绘制气泡图...气泡越小，移民人数越少。 我们也可以让结果更多彩多姿。为了让它有点意义，我们需要对数据系列进行排序。您很快就会看到原因。
矩阵气泡图，其实就是矩阵（透视表）的升级版。下图显示了虚拟的几家店铺下半年的业绩，气泡大小表示业绩大小，气泡颜色表示业绩达成状态。比起普通矩阵来说，矩阵气泡图信息层次更加丰富。...准备好如下数据，写一个度量值，叫数据： 数据 = SUM('业绩表'[业绩]) 如果是传统矩阵，字段如下设置： 结果如下： 如果要呈现气泡图，需要对该度量值进行包装，包装后的度量值为： 矩阵气泡图...= VAR MAXR=MAXX(ALL('业绩表'),[数据]) RETURN "data:image/svg+xml;utf8,"&" " 解释说明见注释。
气泡点图 -- 可用于在地图上，使用颜色、大小不同的圆形图形表达地理区位数据量。...小O地图EXCEL版提供将EXCEL中带有经纬度坐标的数据，按点气泡的方式标注到地图上的功能，并可设置点气泡的大小、填充颜色等样式。 下面以样例数据来操作说明。...二、可视化设置 打开地图（高德地图），点击地图上方的“可视化”，在右边出现的控制面板上操作，新建“气泡点图”，如下图，按数字顺序依次执行。...新建气泡点图，小O地图的地图可视化是以图层方式实现，每份EXCEL表格数据都可生成可视化图层。新建图层后在图层列表上会出现图层项。...来个全图看效果 image.png 局部放大： image.png 此外，我们通过图层栏的按钮控制图层的显示、查看全图、删除图层等。
前言 本期使用joypy对降水数据处理，探索气象可视化的多元性。 降水数据是气象学中一个重要的指标，它对于了解和预测天气变化非常关键。...在本期中，我们将使用 joypy 库来进行降水数据的可视化，展示降水的变化趋势和分布情况。...joypy 是一个基于 matplotlib 的 Python 库，用于创建美观的峰峦图（Ridge Plot）。峰峦图可以同时显示多个组别的分布情况，非常适合用于展示降水数据的多元性。...在接下来的代码中，我们将使用 joypy 来创建降水数据的峰峦图，并展示降水的季节变化和年际变化。让我们开始吧！...preciption test", kind="counts", bins=50) 显示效果欠佳，还是直接看降水量分布 In [7]: # 创建山峦图
本篇文章案例来源于经济学人2013年一幅关于家庭支出结构与国家间的交叉对比图。...该图信息量相当丰富，至少涵盖了四个维度的信息，支出结构信息（类别型字段）、国别信息（类别型字段）、支出水平分类（类别型字段）、支出规模（数值型指标）等。 ?...因为原图中有奖金100+数据点，很多都没有具体数值，一个一个用肉眼估计简直丧心病狂，所以我模拟了一组数值，只保证思路讲到位就OK。...= FALSE,check.names = FALSE) 原始数据中带有\n，导入时R语言会自动给\添加一个\，这里涉及到R语言中保留字符的问题,需要将多余的\删掉。...数据源请移步GitHub主页下载： https://github.com/ljtyduyu/DataWarehouse/tree/master/File
本文利用R语言的ggplot2包，从头带您绘制文献级别的KEGG富集分析气泡图。...一 载入数据集和R包 library(ggplot2) pathway = read.csv("KEGG.csv",header=TRUE,check.names = FALSE) head(pathway...二 绘制KEGG气泡图 2.1初始化数据并绘制散点图 ggplot(pathway,aes(Pvalue,PATHWAY)) + geom_point() ?...三 汇总展示 ggplot(pathway,aes(Pvalue,PATHWAY))+ geom_point(aes(size=Gene,color=-1*log10(Qvalue)))+ scale_color_gradient...四 参考资料 ggplot2：数据分析与图形艺术 好了，更换成自己的数据集即可以自己动手绘制KEGG通路气泡图了。
具体为空间气泡图的绘制，主要涉及的内容如下： geopandas geojson数据格式读取并可视化展示 单独添加散点大小图例图层 adjustText 库解决文本重叠问题 geopandas geojson...数据可视化展示 在读取完数据之后，我们可以直接使用geopandas的plot() 方法进行绘制,代码如下(做了简单的颜色设置)： fig, ax = plt.subplots(figsize=(10,8...添加气泡散点数据 这里的数据来源为我的朋友J哥的公号：菜J学Python,感谢提供数据支持。...由于数据的经纬度是直接基于高德地图进行解析的，导致存在部分数据经纬度信息出错，我们使用pandas进行简单的数据筛选，具体就不再展示，后面会推出系列教程推文，数据预览如下： ?...气泡图例添加 这里我们不是直接基于数据进行图例的生成，而是单独进行其他图层的绘制进行图例生成，这样做的好处就是可以更加自由定制所需图例的颜色和大小，涉及的代码如下： #这里进行单独的图例添加 ax.scatter
image.png 今天的推文主要介绍其中的气泡图，明天的推文介绍如何向气泡图上叠加树形图 按照论文提供的代码得到了画图用到的数据，部分数据如下 ?...image.png 但是用他提供的画图代码没有能够画出图来。因为他用到了一个dot_plot()函数，没有找到这个函数是怎么来的。...既然已经拿到了数据，就用ggplot2自己来画吧 读入数据 data.final<-read.csv("NM/figure2f.csv",header=T) head(data.final) ?...image.png 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 遇到的问题：大家知道dot_plot()这个函数是哪来的吗？还有一个问题是应该如何调整图例前后顺序呢？...如果需要推文中的数据可以给文章点赞，然后点击在看，最后在文末留言！
关系（四）利用python绘制气泡图 气泡图（Bubble plot）简介 气泡图是散点图的变种，可以利用圆的大小来可视化第三个变量。...data = gapminder.loc[gapminder.year == 2007] # 利用scatter函数快速绘制气泡图 # matplotlib的s为点的面积，不宜过大。...通过seaborn绘制多样化的气泡图 seaborn主要利用scatterplot绘制气泡图，可以通过seaborn.scatterplot[1]了解更多用法 import matplotlib.pyplot...matplotlib主要利用scatter绘制气泡图，可以通过matplotlib.pyplot.scatter[2]了解更多用法 自定义气泡图 import matplotlib.pyplot as...，并通过修改参数或者辅以其他绘图知识自定义各种各样的气泡图来适应相关使用场景。
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